Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G100400.1
Synonym
Functional annotation ZOS1-03 - C2H2 zinc finger protein, expressed
UniProt A0A1B6PRF1
Pfam PF13912
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G53600 : C2H2-type zinc finger family protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G013200 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G116700 thaumatin, putative, expressed -
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6 Sobic.008G188200 - -
7 Sobic.004G354500 expressed protein -
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9 Sobic.005G058500 - -
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11 Sobic.010G195301 - -
12 Sobic.007G024000 - -
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14 Sobic.004G090500 - -
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16 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
17 Sobic.002G358000 transmembrane receptor, putative, expressed -
18 Sobic.008G082300 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
19 Sobic.005G189800 - -
20 Sobic.008G012000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G100400 Sobic005G100400 Sobic002G013200 Sobic002G013200 Sobic005G100400--Sobic002G013200 Sobic002G116700 Sobic002G116700 Sobic005G100400--Sobic002G116700 Sobic003G413000 Sobic003G413000 Sobic005G100400--Sobic003G413000 Sobic006G195900 Sobic006G195900 Sobic005G100400--Sobic006G195900 Sobic005G178200 Sobic005G178200 Sobic005G100400--Sobic005G178200 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic005G100400--Sobic008G188200 Sobic004G354500 Sobic004G354500 Sobic005G100400--Sobic004G354500 Sobic008G069200 Sobic008G069200 Sobic005G100400--Sobic008G069200 Sobic005G058500 Sobic005G058500 Sobic005G100400--Sobic005G058500 Sobic003G103100 Sobic003G103100 Sobic002G013200--Sobic003G103100 Sobic004G029700 Sobic004G029700 Sobic002G013200--Sobic004G029700 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic002G013200--Sobic008G184500 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic002G013200--Sobic005G042400 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic002G013200--Sobic009G062300 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic002G013200--Sobic005G124400 Sobic005G052200 Sobic005G052200 Sobic002G013200--Sobic005G052200 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic002G013200--Sobic003G319050 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic002G013200--Sobic002G097100 Sobic002G116700--Sobic008G069200 Sobic001G029700 Sobic001G029700 Sobic002G116700--Sobic001G029700 Sobic002G116700--Sobic008G188200 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic002G116700--Sobic008G064100 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic002G116700--Sobic007G131100 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic002G116700--Sobic008G082300 Sobic002G300800 Sobic002G300800 Sobic002G116700--Sobic002G300800 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic002G116700--Sobic007G025100 Sobic010G111400 Sobic010G111400 Sobic002G116700--Sobic010G111400 Sobic003G413000--Sobic005G100400 Sobic005G211801 Sobic005G211801 Sobic003G413000--Sobic005G211801 Sobic005G071200 Sobic005G071200 Sobic003G413000--Sobic005G071200 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic003G413000--Sobic009G169050 Sobic003G413000--Sobic006G195900 Sobic009G116000 Sobic009G116000 Sobic003G413000--Sobic009G116000 Sobic001G244500 Sobic001G244500 Sobic003G413000--Sobic001G244500 Sobic007G083200 Sobic007G083200 Sobic003G413000--Sobic007G083200 Sobic010G225950 Sobic010G225950 Sobic003G413000--Sobic010G225950 Sobic006G195900--Sobic005G058500 Sobic008G068850 Sobic008G068850 Sobic006G195900--Sobic008G068850 Sobic004G132200 Sobic004G132200 Sobic006G195900--Sobic004G132200 Sobic007G024000 Sobic007G024000 Sobic006G195900--Sobic007G024000 Sobic006G195900--Sobic008G069200 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic006G195900--Sobic005G146000 Sobic004G090500 Sobic004G090500 Sobic006G195900--Sobic004G090500 Sobic006G034900 Sobic006G034900 Sobic006G195900--Sobic006G034900 Sobic001G183100 Sobic001G183100 Sobic006G195900--Sobic001G183100 Sobic003G415300 Sobic003G415300 Sobic005G178200--Sobic003G415300 Sobic005G178200--Sobic008G188200 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic005G178200--Sobic010G195301 Sobic005G178200--Sobic005G058500 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic005G178200--Sobic009G086100 Sobic005G178200--Sobic004G354500 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G178200--Sobic003G326300 Sobic005G178200--Sobic008G082300 Sobic005G178200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic008G069200 Sobic008G188200--Sobic005G178200 Sobic008G188200--Sobic003G415300 Sobic008G188200--Sobic003G326300 Sobic008G188200--Sobic005G058500 Sobic008G188200--Sobic008G082300 Sobic008G188200--Sobic010G195301 Sobic008G188200--Sobic009G086100 Sobic008G184000 Sobic008G184000 Sobic008G188200--Sobic008G184000 Sobic004G354500--Sobic005G178200 Sobic004G354500--Sobic007G024000 Sobic004G354500--Sobic005G058500 Sobic004G354500--Sobic008G188200 Sobic004G354500--Sobic003G415300 Sobic004G354500--Sobic010G195301 Sobic004G354500--Sobic009G086100 Sobic004G354500--Sobic008G069200 Sobic004G354500--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic008G188200 Sobic008G069200--Sobic004G090500 Sobic008G069200--Sobic005G178200 Sobic008G069200--Sobic003G415300 Sobic008G069200--Sobic003G326300 Sobic008G069200--Sobic007G024000 Sobic008G069200--Sobic008G184000 Sobic008G069200--Sobic005G058500 Sobic008G069200--Sobic008G082300 Sobic005G058500--Sobic005G178200 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic005G189800 Sobic005G058500--Sobic009G086100 Sobic005G058500--Sobic003G415300 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic005G058500--Sobic009G019700 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic010G136100 Sobic005G058500--Sobic008G188200 Sobic005G058500--Sobic004G354500 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic005G058500--Sobic005G148100
Octagon: transcription factors


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