Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G126401.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIY0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G007200 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.004G045700 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G005332 - -
4 Sobic.007G124800 MLA1, putative, expressed -
5 Sobic.009G144050 - -
6 Sobic.001G027400 - -
7 Sobic.009G024133 - -
8 Sobic.006G154900 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G304900 - -
10 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G007100 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
13 Sobic.002G018133 - -
14 Sobic.004G149000 - -
15 Sobic.009G020800 - -
16 Sobic.003G030200 phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
17 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
18 Sobic.001G400101 - -
19 Sobic.004G288900 protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.006G185700 copper chaperone for superoxide dismutase, putative, expressed K04569: copper chaperone for superoxide dismutase


Gene co-expression network
sample Sobic005G126401 Sobic005G126401 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic005G126401--Sobic008G007200 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic005G126401--Sobic004G045700 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic005G126401--Sobic003G005332 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic005G126401--Sobic007G124800 Sobic009G144050 Sobic009G144050 Sobic005G126401--Sobic009G144050 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic005G126401--Sobic001G027400 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic005G126401--Sobic009G024133 Sobic006G154900 Sobic006G154900 Sobic005G126401--Sobic006G154900 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic005G126401--Sobic003G304900 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic008G007200--Sobic008G007100 Sobic008G007200--Sobic006G154900 Sobic008G007200--Sobic003G304900 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic008G007200--Sobic001G093732 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic008G007200--Sobic010G201444 Sobic008G007200--Sobic005G126401 Sobic009G252600 Sobic009G252600 Sobic008G007200--Sobic009G252600 Sobic008G007200--Sobic007G124800 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic008G007200--Sobic001G316500 Sobic004G045700--Sobic007G124800 Sobic004G045700--Sobic005G126401 Sobic004G045700--Sobic008G007200 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic004G045700--Sobic007G081400 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic004G045700--Sobic008G086300 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic004G045700--Sobic010G217001 Sobic004G045700--Sobic006G154900 Sobic004G045700--Sobic001G093732 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic004G045700--Sobic002G208900 Sobic003G005332--Sobic008G007100 Sobic003G259000 Sobic003G259000 Sobic003G005332--Sobic003G259000 Sobic003G005332--Sobic001G027400 Sobic003G005332--Sobic005G126401 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G005332--Sobic006G111400 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic003G005332--Sobic010G097800 Sobic003G005332--Sobic008G007200 Sobic003G005332--Sobic003G304900 Sobic004G306700 Sobic004G306700 Sobic003G005332--Sobic004G306700 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic007G124800--Sobic002G202200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic009G144050--Sobic004G288900 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic009G144050--Sobic002G018133 Sobic001G487250 Sobic001G487250 Sobic009G144050--Sobic001G487250 Sobic003G082401 Sobic003G082401 Sobic009G144050--Sobic003G082401 Sobic001G400101 Sobic001G400101 Sobic009G144050--Sobic001G400101 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic009G144050--Sobic009G184500 Sobic003G155350 Sobic003G155350 Sobic009G144050--Sobic003G155350 Sobic008G096300 Sobic008G096300 Sobic009G144050--Sobic008G096300 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic009G144050--Sobic004G184500 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic009G024133--Sobic009G188750 Sobic006G185700 Sobic006G185700 Sobic009G024133--Sobic006G185700 Sobic007G136400 Sobic007G136400 Sobic009G024133--Sobic007G136400 Sobic009G024133--Sobic009G144050 Sobic009G024133--Sobic005G126401 Sobic002G161200 Sobic002G161200 Sobic009G024133--Sobic002G161200 Sobic001G243300 Sobic001G243300 Sobic009G024133--Sobic001G243300 Sobic001G422800 Sobic001G422800 Sobic009G024133--Sobic001G422800 Sobic009G024133--Sobic010G097800 Sobic006G154900--Sobic008G007200 Sobic006G154900--Sobic002G018133 Sobic006G154900--Sobic001G093732 Sobic006G154900--Sobic010G217001 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic006G154900--Sobic008G078500 Sobic006G154900--Sobic009G184500 Sobic002G360701 Sobic002G360701 Sobic006G154900--Sobic002G360701 Sobic004G273500 Sobic004G273500 Sobic006G154900--Sobic004G273500 Sobic006G154900--Sobic010G201444 Sobic003G304900--Sobic001G027400 Sobic003G304900--Sobic008G007200 Sobic003G304900--Sobic001G316500 Sobic003G304900--Sobic008G007100 Sobic003G304900--Sobic009G252600 Sobic003G304900--Sobic010G097800 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic003G304900--Sobic002G138200 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic003G304900--Sobic003G371900 Sobic001G060200 Sobic001G060200 Sobic003G304900--Sobic001G060200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.