Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G171400.1
Synonym Sb05g023160
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PT20
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02970.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G100700 expressed protein -
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10 Sobic.010G151325 - -
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12 Sobic.003G153150 - -
13 Sobic.008G184201 - -
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15 Sobic.006G025132 - -
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17 Sobic.010G170550 - -
18 Sobic.007G116733 - -
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20 Sobic.002G074600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G171400 Sobic005G171400 Sobic002G100700 Sobic002G100700 Sobic005G171400--Sobic002G100700 Sobic005G028000 Sobic005G028000 Sobic005G171400--Sobic005G028000 Sobic001G163900 Sobic001G163900 Sobic005G171400--Sobic001G163900 Sobic002G375950 Sobic002G375950 Sobic005G171400--Sobic002G375950 Sobic005G092200 Sobic005G092200 Sobic005G171400--Sobic005G092200 Sobic006G058666 Sobic006G058666 Sobic005G171400--Sobic006G058666 Sobic010G125300 Sobic010G125300 Sobic005G171400--Sobic010G125300 Sobic006G081900 Sobic006G081900 Sobic005G171400--Sobic006G081900 Sobic010G263950 Sobic010G263950 Sobic005G171400--Sobic010G263950 Sobic007G187300 Sobic007G187300 Sobic002G100700--Sobic007G187300 Sobic006G030700 Sobic006G030700 Sobic002G100700--Sobic006G030700 Sobic006G100332 Sobic006G100332 Sobic002G100700--Sobic006G100332 Sobic009G226300 Sobic009G226300 Sobic002G100700--Sobic009G226300 Sobic001G249300 Sobic001G249300 Sobic002G100700--Sobic001G249300 Sobic005G018500 Sobic005G018500 Sobic002G100700--Sobic005G018500 Sobic005G151700 Sobic005G151700 Sobic002G100700--Sobic005G151700 Sobic009G054500 Sobic009G054500 Sobic002G100700--Sobic009G054500 Sobic004G260000 Sobic004G260000 Sobic002G100700--Sobic004G260000 Sobic005G028000--Sobic002G375950 Sobic010G207325 Sobic010G207325 Sobic005G028000--Sobic010G207325 Sobic006G025132 Sobic006G025132 Sobic005G028000--Sobic006G025132 Sobic007G116733 Sobic007G116733 Sobic005G028000--Sobic007G116733 Sobic005G028000--Sobic001G163900 Sobic010G151325 Sobic010G151325 Sobic005G028000--Sobic010G151325 Sobic006G218050 Sobic006G218050 Sobic005G028000--Sobic006G218050 Sobic001G361400 Sobic001G361400 Sobic005G028000--Sobic001G361400 Sobic001G120700 Sobic001G120700 Sobic005G028000--Sobic001G120700 Sobic001G163900--Sobic001G361400 Sobic001G163900--Sobic005G028000 Sobic004G242250 Sobic004G242250 Sobic001G163900--Sobic004G242250 Sobic001G163900--Sobic006G025132 Sobic001G163900--Sobic007G116733 Sobic001G163900--Sobic006G218050 Sobic010G174600 Sobic010G174600 Sobic001G163900--Sobic010G174600 Sobic001G163900--Sobic001G120700 Sobic001G163900--Sobic010G207325 Sobic002G375950--Sobic005G028000 Sobic002G375950--Sobic006G025132 Sobic002G375950--Sobic007G116733 Sobic002G375950--Sobic006G218050 Sobic002G375950--Sobic001G120700 Sobic002G375950--Sobic001G163900 Sobic002G375950--Sobic010G207325 Sobic002G375950--Sobic001G361400 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic002G375950--Sobic008G031800 Sobic005G092200--Sobic010G207325 Sobic005G092200--Sobic001G361400 Sobic005G025001 Sobic005G025001 Sobic005G092200--Sobic005G025001 Sobic010G059100 Sobic010G059100 Sobic005G092200--Sobic010G059100 Sobic005G092200--Sobic006G025132 Sobic005G092200--Sobic004G242250 Sobic002G074600 Sobic002G074600 Sobic005G092200--Sobic002G074600 Sobic007G181801 Sobic007G181801 Sobic005G092200--Sobic007G181801 Sobic005G092200--Sobic007G116733 Sobic006G058666--Sobic010G151325 Sobic006G058666--Sobic005G028000 Sobic006G058666--Sobic002G375950 Sobic006G246700 Sobic006G246700 Sobic006G058666--Sobic006G246700 Sobic006G058666--Sobic005G171400 Sobic004G113500 Sobic004G113500 Sobic006G058666--Sobic004G113500 Sobic003G072801 Sobic003G072801 Sobic006G058666--Sobic003G072801 Sobic001G517000 Sobic001G517000 Sobic006G058666--Sobic001G517000 Sobic006G058666--Sobic006G081900 Sobic006G017500 Sobic006G017500 Sobic010G125300--Sobic006G017500 Sobic006G017400 Sobic006G017400 Sobic010G125300--Sobic006G017400 Sobic001G282600 Sobic001G282600 Sobic010G125300--Sobic001G282600 Sobic001G150650 Sobic001G150650 Sobic010G125300--Sobic001G150650 Sobic003G322700 Sobic003G322700 Sobic010G125300--Sobic003G322700 Sobic006G016000 Sobic006G016000 Sobic010G125300--Sobic006G016000 Sobic010G169000 Sobic010G169000 Sobic010G125300--Sobic010G169000 Sobic003G010600 Sobic003G010600 Sobic010G125300--Sobic003G010600 Sobic004G225200 Sobic004G225200 Sobic010G125300--Sobic004G225200 Sobic002G209000 Sobic002G209000 Sobic006G081900--Sobic002G209000 Sobic006G100400 Sobic006G100400 Sobic006G081900--Sobic006G100400 Sobic010G248900 Sobic010G248900 Sobic006G081900--Sobic010G248900 Sobic008G015600 Sobic008G015600 Sobic006G081900--Sobic008G015600 Sobic010G170550 Sobic010G170550 Sobic006G081900--Sobic010G170550 Sobic001G483500 Sobic001G483500 Sobic006G081900--Sobic001G483500 Sobic003G269700 Sobic003G269700 Sobic006G081900--Sobic003G269700 Sobic001G251900 Sobic001G251900 Sobic006G081900--Sobic001G251900 Sobic002G409500 Sobic002G409500 Sobic006G081900--Sobic002G409500 Sobic009G140150 Sobic009G140150 Sobic010G263950--Sobic009G140150 Sobic009G239700 Sobic009G239700 Sobic010G263950--Sobic009G239700 Sobic010G263950--Sobic003G072801 Sobic010G263950--Sobic005G028000 Sobic010G263950--Sobic002G100700 Sobic010G263950--Sobic006G081900 Sobic003G047500 Sobic003G047500 Sobic010G263950--Sobic003G047500 Sobic004G006966 Sobic004G006966 Sobic010G263950--Sobic004G006966
Octagon: transcription factors


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