Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G210850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJR2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G199200 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.009G048800 - -
3 Sobic.004G125100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
4 Sobic.005G157733 - -
5 Sobic.001G186300 sec20 domain containing protein, expressed K08497: protein transport protein SEC20
6 Sobic.001G268000 - -
7 Sobic.004G023300 membrane related protein CP5, putative, expressed -
8 Sobic.005G211600 zinc knuckle family protein, expressed -
9 Sobic.010G271901 - -
10 Sobic.006G036700 - -
11 Sobic.004G053800 - -
12 Sobic.008G088833 - -
13 Sobic.001G432900 - -
14 Sobic.010G024300 expressed protein -
15 Sobic.005G117700 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.006G176000 expressed protein -
17 Sobic.003G132050 - -
18 Sobic.007G005900 expressed protein -
19 Sobic.001G473300 stage II sporulation protein E, putative, expressed -
20 Sobic.006G254100 GTP cyclohydrolase I 1, putative, expressed K01495: GCH1, GTP cyclohydrolase IA


Gene co-expression network
sample Sobic005G210850 Sobic005G210850 Sobic007G199200 Sobic007G199200 Sobic005G210850--Sobic007G199200 Sobic009G048800 Sobic009G048800 Sobic005G210850--Sobic009G048800 Sobic004G125100 Sobic004G125100 Sobic005G210850--Sobic004G125100 Sobic005G157733 Sobic005G157733 Sobic005G210850--Sobic005G157733 Sobic001G186300 Sobic001G186300 Sobic005G210850--Sobic001G186300 Sobic001G268000 Sobic001G268000 Sobic005G210850--Sobic001G268000 Sobic004G023300 Sobic004G023300 Sobic005G210850--Sobic004G023300 Sobic005G211600 Sobic005G211600 Sobic005G210850--Sobic005G211600 Sobic010G271901 Sobic010G271901 Sobic005G210850--Sobic010G271901 Sobic007G199200--Sobic009G048800 Sobic010G024300 Sobic010G024300 Sobic007G199200--Sobic010G024300 Sobic007G199200--Sobic005G210850 Sobic007G199200--Sobic004G023300 Sobic002G097400 Sobic002G097400 Sobic007G199200--Sobic002G097400 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic007G199200--Sobic001G000501 Sobic005G082600 Sobic005G082600 Sobic007G199200--Sobic005G082600 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic007G199200--Sobic008G088833 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic007G199200--Sobic008G084300 Sobic009G048800--Sobic007G199200 Sobic009G048800--Sobic010G024300 Sobic009G048800--Sobic001G000501 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic009G048800--Sobic009G007200 Sobic006G036700 Sobic006G036700 Sobic009G048800--Sobic006G036700 Sobic009G048800--Sobic005G210850 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic009G048800--Sobic010G060800 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic009G048800--Sobic007G095300 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic009G048800--Sobic005G221900 Sobic006G093100 Sobic006G093100 Sobic004G125100--Sobic006G093100 Sobic003G372400 Sobic003G372400 Sobic004G125100--Sobic003G372400 Sobic005G042800 Sobic005G042800 Sobic004G125100--Sobic005G042800 Sobic002G056500 Sobic002G056500 Sobic004G125100--Sobic002G056500 Sobic003G097600 Sobic003G097600 Sobic004G125100--Sobic003G097600 Sobic010G100300 Sobic010G100300 Sobic004G125100--Sobic010G100300 Sobic003G154300 Sobic003G154300 Sobic004G125100--Sobic003G154300 Sobic003G042900 Sobic003G042900 Sobic004G125100--Sobic003G042900 Sobic008G129900 Sobic008G129900 Sobic004G125100--Sobic008G129900 Sobic010G145650 Sobic010G145650 Sobic005G157733--Sobic010G145650 Sobic005G117700 Sobic005G117700 Sobic005G157733--Sobic005G117700 Sobic001G445850 Sobic001G445850 Sobic005G157733--Sobic001G445850 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic005G157733--Sobic002G162450 Sobic004G053800 Sobic004G053800 Sobic001G186300--Sobic004G053800 Sobic001G186300--Sobic001G268000 Sobic001G363900 Sobic001G363900 Sobic001G186300--Sobic001G363900 Sobic001G186300--Sobic010G271901 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic001G186300--Sobic010G145500 Sobic008G148300 Sobic008G148300 Sobic001G186300--Sobic008G148300 Sobic004G284001 Sobic004G284001 Sobic001G186300--Sobic004G284001 Sobic008G166400 Sobic008G166400 Sobic001G186300--Sobic008G166400 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G186300--Sobic001G233300 Sobic001G268000--Sobic001G186300 Sobic001G268000--Sobic004G053800 Sobic001G268000--Sobic001G363900 Sobic001G268000--Sobic010G271901 Sobic006G035400 Sobic006G035400 Sobic001G268000--Sobic006G035400 Sobic002G048100 Sobic002G048100 Sobic001G268000--Sobic002G048100 Sobic001G268000--Sobic006G036700 Sobic001G268000--Sobic010G145500 Sobic001G268000--Sobic001G233300 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic004G023300--Sobic004G086150 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic004G023300--Sobic009G248801 Sobic002G196600 Sobic002G196600 Sobic004G023300--Sobic002G196600 Sobic008G096700 Sobic008G096700 Sobic004G023300--Sobic008G096700 Sobic002G390100 Sobic002G390100 Sobic004G023300--Sobic002G390100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic004G023300--Sobic005G095000 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic004G023300--Sobic005G068700 Sobic003G355200 Sobic003G355200 Sobic004G023300--Sobic003G355200 Sobic001G105200 Sobic001G105200 Sobic004G023300--Sobic001G105200 Sobic010G178401 Sobic010G178401 Sobic005G211600--Sobic010G178401 Sobic007G044700 Sobic007G044700 Sobic005G211600--Sobic007G044700 Sobic005G211600--Sobic010G271901 Sobic006G024600 Sobic006G024600 Sobic005G211600--Sobic006G024600 Sobic002G077400 Sobic002G077400 Sobic005G211600--Sobic002G077400 Sobic007G005900 Sobic007G005900 Sobic005G211600--Sobic007G005900 Sobic005G211600--Sobic006G036700 Sobic004G092350 Sobic004G092350 Sobic005G211600--Sobic004G092350 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic005G211600--Sobic003G080300 Sobic010G271901--Sobic006G036700 Sobic006G177900 Sobic006G177900 Sobic010G271901--Sobic006G177900 Sobic010G271901--Sobic002G077400 Sobic010G271901--Sobic010G145500 Sobic010G271901--Sobic005G211600 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic010G271901--Sobic005G093800 Sobic010G271901--Sobic001G268000 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic010G271901--Sobic003G190100 Sobic010G271901--Sobic004G053800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.