Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G226900.1
Synonym Sb05g027506
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PU59
Pfam PF13968 PF04578
Panther DB PTHR31325:SF34 PTHR31325
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g02960.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK19630 , KQK19834 , KQK19833
Barley HORVU5Hr1G125260.1 , HORVU7Hr1G009350.8 , HORVU7Hr1G009350.9 , HORVU7Hr1G009350.6 , HORVU7Hr1G009350.7 , HORVU7Hr1G009350.4 , HORVU7Hr1G009350.5 , HORVU7Hr1G009350.2 , HORVU7Hr1G009350.3 , HORVU7Hr1G009350.1 , HORVU7Hr1G009350.10 , HORVU7Hr1G009350.11 , HORVU7Hr1G009350.12 , HORVU7Hr1G009660.2 , HORVU7Hr1G009660.1 , HORVU5Hr1G125260.3 , HORVU5Hr1G125260.2 , HORVU7Hr1G036050.1
Wheat TraesCS7A02G052100 , TraesCS7D02G047700 , TraesCS4A02G439200 , TraesCS6A02G004300 , TraesCS6A02G004300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G163600 expressed protein -
2 Sobic.010G178900 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G014200 expressed protein -
4 Sobic.001G481201 - -
5 Sobic.010G114400 expressed protein -
6 Sobic.004G128600 salt stress root protein RS1, putative, expressed -
7 Sobic.008G031600 expressed protein -
8 Sobic.009G127600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
9 Sobic.010G224800 patellin-5, putative, expressed -
10 Sobic.001G261440 - -
11 Sobic.006G172651 - -
12 Sobic.003G136700 - -
13 Sobic.002G156300 - -
14 Sobic.003G201400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@hsp20/alpha crystallin family protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G163500 - -
16 Sobic.004G251350 - -
17 Sobic.003G109400 - -
18 Sobic.001G145300 - -
19 Sobic.009G082400 - -
20 Sobic.002G165401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G226900 Sobic005G226900 Sobic008G163600 Sobic008G163600 Sobic005G226900--Sobic008G163600 Sobic010G178900 Sobic010G178900 Sobic005G226900--Sobic010G178900 Sobic010G014200 Sobic010G014200 Sobic005G226900--Sobic010G014200 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic005G226900--Sobic001G481201 Sobic010G114400 Sobic010G114400 Sobic005G226900--Sobic010G114400 Sobic004G128600 Sobic004G128600 Sobic005G226900--Sobic004G128600 Sobic008G031600 Sobic008G031600 Sobic005G226900--Sobic008G031600 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic005G226900--Sobic009G127600 Sobic010G224800 Sobic010G224800 Sobic005G226900--Sobic010G224800 Sobic002G425900 Sobic002G425900 Sobic008G163600--Sobic002G425900 Sobic008G163600--Sobic010G224800 Sobic006G278400 Sobic006G278400 Sobic008G163600--Sobic006G278400 Sobic008G163600--Sobic010G114400 Sobic002G284800 Sobic002G284800 Sobic008G163600--Sobic002G284800 Sobic001G255700 Sobic001G255700 Sobic008G163600--Sobic001G255700 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic008G163600--Sobic010G179150 Sobic007G001300 Sobic007G001300 Sobic008G163600--Sobic007G001300 Sobic004G197300 Sobic004G197300 Sobic008G163600--Sobic004G197300 Sobic009G163500 Sobic009G163500 Sobic010G178900--Sobic009G163500 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic010G178900--Sobic004G251350 Sobic003G136700 Sobic003G136700 Sobic010G178900--Sobic003G136700 Sobic010G178900--Sobic010G179150 Sobic010G178900--Sobic004G197300 Sobic008G020300 Sobic008G020300 Sobic010G178900--Sobic008G020300 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic010G178900--Sobic004G016600 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic010G178900--Sobic007G013100 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic010G178900--Sobic003G368150 Sobic001G180300 Sobic001G180300 Sobic010G014200--Sobic001G180300 Sobic004G329100 Sobic004G329100 Sobic010G014200--Sobic004G329100 Sobic010G014200--Sobic004G128600 Sobic010G014200--Sobic010G178900 Sobic010G014200--Sobic006G278400 Sobic010G014200--Sobic008G163600 Sobic010G014200--Sobic005G226900 Sobic004G227000 Sobic004G227000 Sobic010G014200--Sobic004G227000 Sobic001G541900 Sobic001G541900 Sobic010G014200--Sobic001G541900 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic001G481201--Sobic002G165401 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G481201--Sobic007G204500 Sobic009G082400 Sobic009G082400 Sobic001G481201--Sobic009G082400 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G481201--Sobic001G537900 Sobic001G481201--Sobic004G251350 Sobic001G481201--Sobic010G179150 Sobic001G520700 Sobic001G520700 Sobic001G481201--Sobic001G520700 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic001G481201--Sobic006G180500 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic001G481201--Sobic006G019901 Sobic010G114400--Sobic010G224800 Sobic002G156300 Sobic002G156300 Sobic010G114400--Sobic002G156300 Sobic010G114400--Sobic007G001300 Sobic003G109400 Sobic003G109400 Sobic010G114400--Sobic003G109400 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic010G114400--Sobic009G031100 Sobic010G114400--Sobic002G425900 Sobic010G114400--Sobic004G197300 Sobic010G114400--Sobic009G163500 Sobic003G105300 Sobic003G105300 Sobic010G114400--Sobic003G105300 Sobic006G197000 Sobic006G197000 Sobic004G128600--Sobic006G197000 Sobic004G128600--Sobic002G425900 Sobic004G128600--Sobic010G224800 Sobic004G128600--Sobic010G114400 Sobic009G154000 Sobic009G154000 Sobic004G128600--Sobic009G154000 Sobic004G128600--Sobic007G001300 Sobic003G201400 Sobic003G201400 Sobic004G128600--Sobic003G201400 Sobic001G200500 Sobic001G200500 Sobic004G128600--Sobic001G200500 Sobic005G102100 Sobic005G102100 Sobic004G128600--Sobic005G102100 Sobic003G081400 Sobic003G081400 Sobic008G031600--Sobic003G081400 Sobic008G031600--Sobic003G201400 Sobic010G045300 Sobic010G045300 Sobic008G031600--Sobic010G045300 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic008G031600--Sobic010G029200 Sobic010G122533 Sobic010G122533 Sobic008G031600--Sobic010G122533 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic008G031600--Sobic009G039400 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic008G031600--Sobic010G208300 Sobic005G022600 Sobic005G022600 Sobic008G031600--Sobic005G022600 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic008G031600--Sobic006G167200 Sobic001G145300 Sobic001G145300 Sobic009G127600--Sobic001G145300 Sobic009G127600--Sobic002G156300 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic009G127600--Sobic004G279150 Sobic009G127600--Sobic001G481201 Sobic009G127600--Sobic010G114400 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic003G008850 Sobic009G127600--Sobic006G019901 Sobic009G127600--Sobic007G001300 Sobic009G127600--Sobic003G109400 Sobic010G224800--Sobic010G114400 Sobic010G224800--Sobic007G001300 Sobic010G224800--Sobic003G109400 Sobic010G224800--Sobic002G156300 Sobic010G224800--Sobic009G031100 Sobic010G224800--Sobic002G425900 Sobic010G224800--Sobic003G105300 Sobic010G224800--Sobic004G197300 Sobic010G224800--Sobic009G163500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.