Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G228501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RK24
Pfam PF13962
Panther DB PTHR24177 PTHR24177:SF51
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G11000 : Ankyrin repeat family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g18990.1 : embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001870
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G397100
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G233100 AP2 domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G266800 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
3 Sobic.002G195600 Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 28606901)@Cinnamyl alcohol dehydrogenase(PubMedID : 19087955)@dehydrogenase, putative, expressed K00083: cinnamyl-alcohol dehydrogenase
4 Sobic.006G133200 expressed protein -
5 Sobic.003G176300 - -
6 Sobic.003G240500 glycosyl transferase, group 1 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G015200 - -
8 Sobic.007G007300 methyltransferase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G308500 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
10 Sobic.001G238000 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G052700 ZOS11-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.005G079100 dirigent, putative -
13 Sobic.005G010100 BTB9 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.003G203600 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K12355: coniferyl-aldehyde dehydrogenase
15 Sobic.001G182200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
16 Sobic.004G003100 nodulin, putative, expressed -
17 Sobic.009G058400 expressed protein -
18 Sobic.003G053600 hydrolase, alpha/beta fold family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G377700 caltractin, putative, expressed -
20 Sobic.005G049350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G228501 Sobic005G228501 Sobic009G233100 Sobic009G233100 Sobic005G228501--Sobic009G233100 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic005G228501--Sobic006G266800 Sobic002G195600 Sobic002G195600 Sobic005G228501--Sobic002G195600 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic005G228501--Sobic006G133200 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic005G228501--Sobic003G176300 Sobic003G240500 Sobic003G240500 Sobic005G228501--Sobic003G240500 Sobic009G015200 Sobic009G015200 Sobic005G228501--Sobic009G015200 Sobic007G007300 Sobic007G007300 Sobic005G228501--Sobic007G007300 Sobic004G308500 Sobic004G308500 Sobic005G228501--Sobic004G308500 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic009G233100--Sobic004G003100 Sobic005G110514 Sobic005G110514 Sobic009G233100--Sobic005G110514 Sobic009G233100--Sobic004G308500 Sobic005G206000 Sobic005G206000 Sobic009G233100--Sobic005G206000 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic009G233100--Sobic001G301000 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic009G233100--Sobic003G053200 Sobic010G031700 Sobic010G031700 Sobic009G233100--Sobic010G031700 Sobic007G037600 Sobic007G037600 Sobic009G233100--Sobic007G037600 Sobic006G277700 Sobic006G277700 Sobic009G233100--Sobic006G277700 Sobic006G266800--Sobic002G195600 Sobic003G215300 Sobic003G215300 Sobic006G266800--Sobic003G215300 Sobic006G266800--Sobic007G007300 Sobic001G503000 Sobic001G503000 Sobic006G266800--Sobic001G503000 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic006G266800--Sobic007G073000 Sobic006G196400 Sobic006G196400 Sobic006G266800--Sobic006G196400 Sobic002G115600 Sobic002G115600 Sobic006G266800--Sobic002G115600 Sobic004G322000 Sobic004G322000 Sobic006G266800--Sobic004G322000 Sobic008G138900 Sobic008G138900 Sobic006G266800--Sobic008G138900 Sobic002G195600--Sobic007G073000 Sobic002G195600--Sobic006G196400 Sobic002G195600--Sobic008G138900 Sobic002G195600--Sobic003G215300 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic002G195600--Sobic003G240400 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic002G195600--Sobic004G014600 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic002G195600--Sobic007G090600 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic002G195600--Sobic006G092700 Sobic006G135300 Sobic006G135300 Sobic002G195600--Sobic006G135300 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic006G133200--Sobic004G106100 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic006G133200--Sobic009G181600 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic006G133200--Sobic006G205700 Sobic006G133200--Sobic007G007300 Sobic006G133200--Sobic007G037600 Sobic006G133200--Sobic004G308500 Sobic001G507100 Sobic001G507100 Sobic006G133200--Sobic001G507100 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic006G133200--Sobic007G086300 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic006G133200--Sobic006G106900 Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic003G176300--Sobic005G049350 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic001G521600 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic003G176300--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic003G176300--Sobic005G216700 Sobic003G176300--Sobic006G266800 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic003G176300--Sobic009G079200 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic006G133200 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic003G176300--Sobic006G133300 Sobic010G082100 Sobic010G082100 Sobic003G240500--Sobic010G082100 Sobic003G240500--Sobic007G007300 Sobic003G240500--Sobic006G266800 Sobic003G240500--Sobic005G110514 Sobic003G240500--Sobic004G308500 Sobic003G240500--Sobic004G322000 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic003G240500--Sobic001G506500 Sobic002G166150 Sobic002G166150 Sobic003G240500--Sobic002G166150 Sobic001G506700 Sobic001G506700 Sobic003G240500--Sobic001G506700 Sobic001G182200 Sobic001G182200 Sobic009G015200--Sobic001G182200 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic009G015200--Sobic009G035900 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic009G015200--Sobic001G499701 Sobic009G015200--Sobic003G176300 Sobic009G015200--Sobic003G240500 Sobic009G015200--Sobic005G228501 Sobic009G015200--Sobic006G266800 Sobic002G122400 Sobic002G122400 Sobic009G015200--Sobic002G122400 Sobic010G162800 Sobic010G162800 Sobic009G015200--Sobic010G162800 Sobic007G007300--Sobic007G090600 Sobic007G007300--Sobic004G322000 Sobic003G095100 Sobic003G095100 Sobic007G007300--Sobic003G095100 Sobic003G282300 Sobic003G282300 Sobic007G007300--Sobic003G282300 Sobic007G007300--Sobic004G308500 Sobic007G007300--Sobic003G215300 Sobic007G007300--Sobic006G133200 Sobic007G007300--Sobic004G014600 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic007G007300--Sobic005G052700 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic004G308500--Sobic002G289500 Sobic004G308500--Sobic004G014600 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic004G308500--Sobic004G121600 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic004G308500--Sobic001G415100 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic004G308500--Sobic007G111800 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic004G308500--Sobic005G046400 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic004G308500--Sobic005G106300 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic004G308500--Sobic006G097900 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic004G308500--Sobic003G441800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.