Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G049350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGT1
Pfam PF08787
Panther DB PTHR33681 PTHR33681:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07310.1 : citrate-binding protein precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012910
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G113710.2 , HORVU7Hr1G113710.3 , HORVU0Hr1G020380.1 , HORVU7Hr1G113710.1
Wheat TraesCS7A02G202300 , TraesCS7B02G382900 , TraesCS7D02G496600 , TraesCS7A02G508400 , TraesCS7B02G109200 , TraesCS7D02G205700 , TraesCS7D02G057800 , TraesCS1D02G014100 , TraesCS7B02G417600 , TraesCS7B02G109300 , TraesCS6B02G018200 , TraesCS7A02G508500 , TraesCS3A02G312700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
2 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.003G176300 - -
4 Sobic.004G337950 - -
5 Sobic.009G098000 expressed protein -
6 Sobic.001G499701 - -
7 Sobic.001G233100 - -
8 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -
9 Sobic.009G079200 expressed protein -
10 Sobic.004G119900 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G009300 expressed protein -
12 Sobic.009G004900 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
13 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.005G226200 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
15 Sobic.005G012600 LTPL10 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.007G019900 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.005G220740 - -
18 Sobic.003G046700 expressed protein -
19 Sobic.004G120000 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.007G097550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic005G049350--Sobic001G521600 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic005G049350--Sobic007G149000 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic005G049350--Sobic003G176300 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic005G049350--Sobic004G337950 Sobic009G098000 Sobic009G098000 Sobic005G049350--Sobic009G098000 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic005G049350--Sobic001G499701 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic005G049350--Sobic001G233100 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic005G049350--Sobic009G018300 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic005G049350--Sobic009G079200 Sobic001G521600--Sobic009G018300 Sobic001G521600--Sobic004G337950 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic001G521600--Sobic003G046700 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G521600--Sobic010G128300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic001G521600--Sobic001G506100 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic001G521600--Sobic004G119900 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G521600--Sobic007G097550 Sobic001G521600--Sobic001G233100 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic001G521600--Sobic005G134200 Sobic007G149000--Sobic005G049350 Sobic007G094100 Sobic007G094100 Sobic007G149000--Sobic007G094100 Sobic007G149000--Sobic001G521600 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic003G176300 Sobic007G149000--Sobic004G337950 Sobic005G012600 Sobic005G012600 Sobic007G149000--Sobic005G012600 Sobic007G149000--Sobic009G098000 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic007G149000--Sobic010G115000 Sobic003G176300--Sobic005G049350 Sobic003G176300--Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic003G176300--Sobic005G216700 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic009G079200 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic009G259800 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic003G176300--Sobic006G133200 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic003G176300--Sobic006G133300 Sobic004G337950--Sobic009G018300 Sobic004G337950--Sobic001G521600 Sobic004G337950--Sobic007G097550 Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic004G337950--Sobic004G009300 Sobic004G337950--Sobic001G233100 Sobic004G337950--Sobic007G094100 Sobic004G337950--Sobic001G506100 Sobic004G337950--Sobic003G046700 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic004G337950--Sobic009G004900 Sobic009G098000--Sobic005G049350 Sobic009G098000--Sobic001G521600 Sobic009G098000--Sobic004G337950 Sobic009G098000--Sobic007G149000 Sobic009G098000--Sobic009G079200 Sobic009G098000--Sobic003G176300 Sobic009G098000--Sobic001G506100 Sobic009G098000--Sobic009G018300 Sobic004G080300 Sobic004G080300 Sobic009G098000--Sobic004G080300 Sobic001G499701--Sobic005G049350 Sobic001G499701--Sobic003G176300 Sobic001G499701--Sobic007G149000 Sobic001G499701--Sobic005G216700 Sobic009G015200 Sobic009G015200 Sobic001G499701--Sobic009G015200 Sobic001G499701--Sobic009G098000 Sobic007G019900 Sobic007G019900 Sobic001G499701--Sobic007G019900 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic001G499701--Sobic009G035900 Sobic005G220740 Sobic005G220740 Sobic001G499701--Sobic005G220740 Sobic001G233100--Sobic009G004900 Sobic001G233100--Sobic009G018300 Sobic001G233100--Sobic001G506100 Sobic001G233100--Sobic007G097550 Sobic001G233100--Sobic004G119900 Sobic001G233100--Sobic010G128300 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G233100--Sobic005G226200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic001G233100--Sobic005G226400 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G233100--Sobic002G392000 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic009G079200--Sobic008G084800 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic009G079200--Sobic006G047200 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic009G079200--Sobic001G499900 Sobic001G238100 Sobic001G238100 Sobic009G079200--Sobic001G238100 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic009G079200--Sobic005G212800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic009G079200--Sobic002G334000 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic009G079200--Sobic006G178300 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G521600
Octagon: transcription factors


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