Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G098000.1
Synonym Sb09g014230
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YW52
Pfam PF05097
Panther DB PTHR33257
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01790 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g27000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037541
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G049350 - -
2 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
3 Sobic.004G337950 - -
4 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.009G079200 expressed protein -
6 Sobic.003G176300 - -
7 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -
9 Sobic.004G080300 -(PubMedID : 23108465)@MONOCULM 1, putative, expressed -
10 Sobic.001G076300 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
11 Sobic.005G212800 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
12 Sobic.004G008600 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.003G046700 expressed protein -
14 Sobic.007G097550 - -
15 Sobic.001G233100 - -
16 Sobic.010G269000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G106500 PMR5, putative, expressed -
18 Sobic.010G128300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
19 Sobic.005G134200 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.13 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
20 Sobic.007G094100 OsWAK108 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G098000 Sobic009G098000 Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic009G098000--Sobic005G049350 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic009G098000--Sobic001G521600 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic009G098000--Sobic004G337950 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic009G098000--Sobic007G149000 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic009G098000--Sobic009G079200 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic009G098000--Sobic003G176300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic009G098000--Sobic001G506100 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic009G098000--Sobic009G018300 Sobic004G080300 Sobic004G080300 Sobic009G098000--Sobic004G080300 Sobic005G049350--Sobic001G521600 Sobic005G049350--Sobic007G149000 Sobic005G049350--Sobic003G176300 Sobic005G049350--Sobic004G337950 Sobic005G049350--Sobic009G098000 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic005G049350--Sobic001G499701 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic005G049350--Sobic001G233100 Sobic005G049350--Sobic009G018300 Sobic005G049350--Sobic009G079200 Sobic001G521600--Sobic009G018300 Sobic001G521600--Sobic004G337950 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic001G521600--Sobic003G046700 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G521600--Sobic010G128300 Sobic001G521600--Sobic001G506100 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic001G521600--Sobic004G119900 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G521600--Sobic007G097550 Sobic001G521600--Sobic001G233100 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic001G521600--Sobic005G134200 Sobic004G337950--Sobic009G018300 Sobic004G337950--Sobic001G521600 Sobic004G337950--Sobic007G097550 Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic004G337950--Sobic004G009300 Sobic004G337950--Sobic001G233100 Sobic007G094100 Sobic007G094100 Sobic004G337950--Sobic007G094100 Sobic004G337950--Sobic001G506100 Sobic004G337950--Sobic003G046700 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic004G337950--Sobic009G004900 Sobic007G149000--Sobic005G049350 Sobic007G149000--Sobic007G094100 Sobic007G149000--Sobic001G521600 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic003G176300 Sobic007G149000--Sobic004G337950 Sobic005G012600 Sobic005G012600 Sobic007G149000--Sobic005G012600 Sobic007G149000--Sobic009G098000 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic007G149000--Sobic010G115000 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic009G079200--Sobic008G084800 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic009G079200--Sobic006G047200 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic009G079200--Sobic001G499900 Sobic001G238100 Sobic001G238100 Sobic009G079200--Sobic001G238100 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic009G079200--Sobic005G212800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic009G079200--Sobic002G334000 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic009G079200--Sobic006G178300 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic005G049350 Sobic003G176300--Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic003G176300--Sobic005G216700 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic009G079200 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic009G259800 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic003G176300--Sobic006G133200 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic003G176300--Sobic006G133300 Sobic001G506100--Sobic009G018300 Sobic001G506100--Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic010G128300 Sobic001G506100--Sobic009G004900 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G506100--Sobic002G392000 Sobic001G506100--Sobic007G097550 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G205400 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic001G506100--Sobic005G226400 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic004G080300--Sobic002G063700 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic004G080300--Sobic005G069332 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic004G080300--Sobic005G069166 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G080300--Sobic009G136800 Sobic004G080300--Sobic005G226400 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic004G080300--Sobic006G230100 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic004G080300--Sobic004G299500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic004G080300--Sobic001G415100 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic004G080300--Sobic006G230200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.