Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G076300.1
Synonym Sb01g006890, CML41
Functional annotation EF hand family protein, putative, expressed
UniProt C5WZ86
Pfam PF00036 PF13833
Panther DB PTHR10891 PTHR10891:SF641
NCBI CDD KOG0027; Calmodulin and related proteins (EF-Hand superfamily)
KEGG Orthology K13448; calcium-binding protein CML
Gene Ontology GO:0005509; calcium ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50770 : calmodulin-like 41
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g55960.1 : EF hand family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008331
Brachypodium KQK13000
Barley HORVU5Hr1G070650.1 , HORVU5Hr1G098380.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase


Gene co-expression network
sample Sobic001G076300 Sobic001G076300 Sobic009G098000 Sobic009G098000 Sobic001G076300--Sobic009G098000 Sobic001G522200 Sobic001G522200 Sobic001G076300--Sobic001G522200 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic001G076300--Sobic006G133300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic001G076300--Sobic001G506100 Sobic004G080300 Sobic004G080300 Sobic001G076300--Sobic004G080300 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic001G076300--Sobic009G079200 Sobic001G314000 Sobic001G314000 Sobic001G076300--Sobic001G314000 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic001G076300--Sobic003G176300 Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic001G076300--Sobic005G049350 Sobic009G098000--Sobic005G049350 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic009G098000--Sobic001G521600 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic009G098000--Sobic004G337950 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic009G098000--Sobic007G149000 Sobic009G098000--Sobic009G079200 Sobic009G098000--Sobic003G176300 Sobic009G098000--Sobic001G506100 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic009G098000--Sobic009G018300 Sobic009G098000--Sobic004G080300 Sobic001G507100 Sobic001G507100 Sobic001G522200--Sobic001G507100 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic001G522200--Sobic001G414800 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic001G522200--Sobic009G065700 Sobic001G522200--Sobic006G133300 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic001G522200--Sobic006G106900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic001G522200--Sobic001G499900 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic001G522200--Sobic002G111900 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic001G522200--Sobic007G220400 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic001G522200--Sobic004G121600 Sobic006G133300--Sobic001G499900 Sobic010G191600 Sobic010G191600 Sobic006G133300--Sobic010G191600 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic006G133300--Sobic007G206800 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic006G133300--Sobic002G391400 Sobic006G133300--Sobic009G065700 Sobic005G217766 Sobic005G217766 Sobic006G133300--Sobic005G217766 Sobic006G133300--Sobic001G414800 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic006G133300--Sobic003G167300 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic006G133300--Sobic010G191700 Sobic001G506100--Sobic009G018300 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic001G233100 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G506100--Sobic010G128300 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic001G506100--Sobic009G004900 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G506100--Sobic002G392000 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G506100--Sobic007G097550 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G205400 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic001G506100--Sobic005G226400 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic004G080300--Sobic002G063700 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic004G080300--Sobic005G069332 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic004G080300--Sobic005G069166 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G080300--Sobic009G136800 Sobic004G080300--Sobic005G226400 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic004G080300--Sobic006G230100 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic004G080300--Sobic004G299500 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic004G080300--Sobic001G415100 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic004G080300--Sobic006G230200 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic009G079200--Sobic008G084800 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic009G079200--Sobic006G047200 Sobic009G079200--Sobic001G499900 Sobic001G238100 Sobic001G238100 Sobic009G079200--Sobic001G238100 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic009G079200--Sobic005G212800 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic009G079200--Sobic002G334000 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic009G079200--Sobic006G178300 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G234100 Sobic009G079200--Sobic001G521600 Sobic003G183300 Sobic003G183300 Sobic001G314000--Sobic003G183300 Sobic009G079900 Sobic009G079900 Sobic001G314000--Sobic009G079900 Sobic001G514300 Sobic001G514300 Sobic001G314000--Sobic001G514300 Sobic003G426200 Sobic003G426200 Sobic001G314000--Sobic003G426200 Sobic001G314000--Sobic007G206800 Sobic001G314000--Sobic002G391400 Sobic005G052700 Sobic005G052700 Sobic001G314000--Sobic005G052700 Sobic001G314000--Sobic002G334000 Sobic006G205700 Sobic006G205700 Sobic001G314000--Sobic006G205700 Sobic003G176300--Sobic005G049350 Sobic003G176300--Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic003G176300--Sobic005G216700 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic009G079200 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic009G259800 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic003G176300--Sobic006G133200 Sobic003G176300--Sobic006G133300 Sobic005G049350--Sobic001G521600 Sobic005G049350--Sobic007G149000 Sobic005G049350--Sobic003G176300 Sobic005G049350--Sobic004G337950 Sobic005G049350--Sobic009G098000 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic005G049350--Sobic001G499701 Sobic005G049350--Sobic001G233100 Sobic005G049350--Sobic009G018300 Sobic005G049350--Sobic009G079200
Octagon: transcription factors


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