Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G522200.1
Synonym Sb01g048680
Functional annotation -
UniProt C5X000
Pfam -
Panther DB PTHR37767 PTHR37767:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G51680 : hydroxyproline-rich glycoprotein family protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK23869
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G507100 dirigent, putative, expressed -
2 Sobic.001G414800 dirigent, putative, expressed -
3 Sobic.009G065700 - -
4 Sobic.006G133300 expressed protein -
5 Sobic.006G106900 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G499900 expansin precursor, putative, expressed -
7 Sobic.002G111900 receptor-like kinase, putative, expressed -
8 Sobic.007G220400 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
9 Sobic.004G121600 expansin precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G272800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G046400 - -
12 Sobic.003G441800 RCLEA2 - Root cap and Late embryogenesis related family protein precursor, putative, expressed -
13 Sobic.004G119800 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.003G167300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.010G010000 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G217766 - -
17 Sobic.010G191600 cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.004G029400 periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
19 Sobic.006G059800 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
20 Sobic.007G206800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lectin-like protein kinase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G522200 Sobic001G522200 Sobic001G507100 Sobic001G507100 Sobic001G522200--Sobic001G507100 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic001G522200--Sobic001G414800 Sobic009G065700 Sobic009G065700 Sobic001G522200--Sobic009G065700 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic001G522200--Sobic006G133300 Sobic006G106900 Sobic006G106900 Sobic001G522200--Sobic006G106900 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic001G522200--Sobic001G499900 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic001G522200--Sobic002G111900 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic001G522200--Sobic007G220400 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic001G522200--Sobic004G121600 Sobic001G507100--Sobic001G414800 Sobic001G507100--Sobic006G106900 Sobic003G064800 Sobic003G064800 Sobic001G507100--Sobic003G064800 Sobic004G306900 Sobic004G306900 Sobic001G507100--Sobic004G306900 Sobic007G086300 Sobic007G086300 Sobic001G507100--Sobic007G086300 Sobic004G106100 Sobic004G106100 Sobic001G507100--Sobic004G106100 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic001G507100--Sobic006G133200 Sobic003G319400 Sobic003G319400 Sobic001G507100--Sobic003G319400 Sobic005G202300 Sobic005G202300 Sobic001G507100--Sobic005G202300 Sobic001G414800--Sobic006G106900 Sobic001G414800--Sobic001G507100 Sobic010G191600 Sobic010G191600 Sobic001G414800--Sobic010G191600 Sobic007G206800 Sobic007G206800 Sobic001G414800--Sobic007G206800 Sobic001G414800--Sobic003G064800 Sobic005G217766 Sobic005G217766 Sobic001G414800--Sobic005G217766 Sobic005G097400 Sobic005G097400 Sobic001G414800--Sobic005G097400 Sobic001G414800--Sobic007G086300 Sobic008G022100 Sobic008G022100 Sobic001G414800--Sobic008G022100 Sobic003G167300 Sobic003G167300 Sobic009G065700--Sobic003G167300 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic009G065700--Sobic003G441800 Sobic009G065700--Sobic002G111900 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic009G065700--Sobic010G010000 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic009G065700--Sobic002G289500 Sobic009G065700--Sobic001G499900 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic009G065700--Sobic003G441601 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic009G065700--Sobic010G241900 Sobic001G348400 Sobic001G348400 Sobic009G065700--Sobic001G348400 Sobic006G133300--Sobic001G499900 Sobic006G133300--Sobic010G191600 Sobic006G133300--Sobic007G206800 Sobic002G391400 Sobic002G391400 Sobic006G133300--Sobic002G391400 Sobic006G133300--Sobic009G065700 Sobic006G133300--Sobic005G217766 Sobic006G133300--Sobic001G414800 Sobic006G133300--Sobic003G167300 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic006G133300--Sobic010G191700 Sobic006G106900--Sobic003G319400 Sobic006G106900--Sobic005G202300 Sobic006G106900--Sobic003G064800 Sobic006G106900--Sobic001G414800 Sobic006G106900--Sobic004G306900 Sobic006G106900--Sobic001G507100 Sobic009G181600 Sobic009G181600 Sobic006G106900--Sobic009G181600 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic006G106900--Sobic001G438200 Sobic003G280000 Sobic003G280000 Sobic006G106900--Sobic003G280000 Sobic001G499900--Sobic003G167300 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G499900--Sobic002G392000 Sobic001G499900--Sobic010G241900 Sobic001G499900--Sobic007G220400 Sobic001G499900--Sobic008G022100 Sobic001G499900--Sobic007G206800 Sobic001G499900--Sobic010G191700 Sobic001G499900--Sobic009G065700 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic001G499900--Sobic006G047200 Sobic002G111900--Sobic010G191700 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic002G111900--Sobic002G391300 Sobic002G111900--Sobic003G441601 Sobic002G111900--Sobic007G220400 Sobic002G111900--Sobic010G241900 Sobic002G111900--Sobic010G010000 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic002G111900--Sobic006G171100 Sobic005G046400 Sobic005G046400 Sobic002G111900--Sobic005G046400 Sobic006G059800 Sobic006G059800 Sobic002G111900--Sobic006G059800 Sobic007G220400--Sobic010G241900 Sobic007G220400--Sobic010G191700 Sobic007G220400--Sobic007G206800 Sobic007G220400--Sobic002G111900 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic007G220400--Sobic005G226350 Sobic007G220400--Sobic002G391400 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic007G220400--Sobic005G134200 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic007G220400--Sobic010G128300 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic007G220400--Sobic002G334000 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic004G121600--Sobic003G441700 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic004G121600--Sobic001G301000 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic004G121600--Sobic006G097900 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic004G121600--Sobic005G119900 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic004G121600--Sobic003G053200 Sobic004G121600--Sobic003G441800 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic004G121600--Sobic008G010500 Sobic001G218400 Sobic001G218400 Sobic004G121600--Sobic001G218400 Sobic004G121800 Sobic004G121800 Sobic004G121600--Sobic004G121800
Octagon: transcription factors


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