Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G233100.1
Synonym Sb01g020410
Functional annotation -
UniProt C5X0C1
Pfam -
Panther DB PTHR33548 PTHR33548:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006741
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G004900 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
2 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -
3 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.007G097550 - -
5 Sobic.004G119900 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G128300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
7 Sobic.005G226200 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
8 Sobic.005G226400 RGH1A, putative, expressed -
9 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
10 Sobic.005G205400 - -
11 Sobic.004G337950 - -
12 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
13 Sobic.005G212800 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
14 Sobic.002G409200 TKL_IRAK_DUF26-lh.9 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
15 Sobic.008G084800 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
16 Sobic.004G009300 expressed protein -
17 Sobic.001G234100 expressed protein -
18 Sobic.005G226350 - -
19 Sobic.009G136800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
20 Sobic.002G063700 NB-ARC domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic001G233100--Sobic009G004900 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic001G233100--Sobic009G018300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic001G233100--Sobic001G506100 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic001G233100--Sobic007G097550 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic001G233100--Sobic004G119900 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G233100--Sobic010G128300 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G233100--Sobic005G226200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic001G233100--Sobic005G226400 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G233100--Sobic002G392000 Sobic009G004900--Sobic001G233100 Sobic009G004900--Sobic009G018300 Sobic009G004900--Sobic001G506100 Sobic009G004900--Sobic007G097550 Sobic009G004900--Sobic005G226400 Sobic009G004900--Sobic010G128300 Sobic009G004900--Sobic004G119900 Sobic004G120000 Sobic004G120000 Sobic009G004900--Sobic004G120000 Sobic002G409200 Sobic002G409200 Sobic009G004900--Sobic002G409200 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic001G506100--Sobic009G018300 Sobic001G506100--Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic010G128300 Sobic001G506100--Sobic009G004900 Sobic001G506100--Sobic002G392000 Sobic001G506100--Sobic007G097550 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226400 Sobic007G097550--Sobic009G018300 Sobic007G097550--Sobic001G233100 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic007G097550--Sobic005G212800 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic007G097550--Sobic008G084800 Sobic007G097550--Sobic005G205400 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic007G097550--Sobic001G234100 Sobic007G097550--Sobic001G506100 Sobic007G097550--Sobic009G004900 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic007G097550--Sobic006G178300 Sobic004G119900--Sobic005G226400 Sobic004G119900--Sobic009G018300 Sobic004G119900--Sobic010G128300 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic004G119900--Sobic005G134200 Sobic004G119900--Sobic001G233100 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic004G119900--Sobic007G220400 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G119900--Sobic009G136800 Sobic004G119900--Sobic002G392000 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic004G119900--Sobic006G047200 Sobic010G128300--Sobic002G392000 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic010G128300--Sobic010G241900 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic010G128300--Sobic010G191700 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic010G128300--Sobic002G391300 Sobic010G128300--Sobic005G226400 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic010G128300--Sobic005G226350 Sobic010G128300--Sobic005G134200 Sobic010G128300--Sobic009G136800 Sobic010G128300--Sobic007G220400 Sobic005G226200--Sobic001G506100 Sobic005G226200--Sobic010G128300 Sobic005G226200--Sobic001G233100 Sobic005G226200--Sobic003G046700 Sobic005G226200--Sobic009G018300 Sobic005G226200--Sobic009G004900 Sobic005G226200--Sobic001G521600 Sobic005G226200--Sobic002G392000 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic005G226200--Sobic002G334000 Sobic005G226400--Sobic005G134200 Sobic005G226400--Sobic009G136800 Sobic005G226400--Sobic010G128300 Sobic005G226400--Sobic002G391300 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic005G226400--Sobic006G171100 Sobic005G223700 Sobic005G223700 Sobic005G226400--Sobic005G223700 Sobic005G226400--Sobic006G047200 Sobic005G226400--Sobic005G226350 Sobic010G010000 Sobic010G010000 Sobic005G226400--Sobic010G010000 Sobic002G392000--Sobic010G128300 Sobic002G392000--Sobic005G205400 Sobic002G392000--Sobic006G047200 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392000--Sobic001G499900 Sobic002G392000--Sobic009G136800 Sobic002G392000--Sobic008G084800 Sobic002G392000--Sobic010G191700 Sobic002G392000--Sobic010G241900 Sobic002G392000--Sobic002G391300
Octagon: transcription factors


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