Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G212800.1
Synonym Sb05g026510
Functional annotation carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed
UniProt A0A1B6PTV8
Pfam PF14365 PF03080
Panther DB PTHR31589 PTHR31589:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G56530 : Protein of Unknown Function (DUF239)
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g38590.1 : carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029123
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5D02G557900 , TraesCS4A02G327000 , TraesCS4A02G327600 , TraesCS4A02G327400 , TraesCS5B02G541800 , TraesCS5B02G541600 , TraesCS5B02G565600
Populus PNS90051 , PNS90050 , PNS90052


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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10 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.005G176600 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.006G229901 - -
13 Sobic.004G299500 - -
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15 Sobic.007G202480 - -
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19 Sobic.006G230100 TKL_IRAK_DUF26-ld.1 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
20 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic005G212800--Sobic001G234100 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic005G212800--Sobic008G084800 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic005G212800--Sobic005G101000 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic005G212800--Sobic005G205400 Sobic003G045650 Sobic003G045650 Sobic005G212800--Sobic003G045650 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic005G212800--Sobic006G047200 Sobic008G058600 Sobic008G058600 Sobic005G212800--Sobic008G058600 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic005G212800--Sobic007G097550 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic005G212800--Sobic001G395900 Sobic001G234100--Sobic008G084800 Sobic001G234100--Sobic005G101000 Sobic001G234100--Sobic005G212800 Sobic001G234100--Sobic005G205400 Sobic001G234100--Sobic006G047200 Sobic001G234100--Sobic008G058600 Sobic001G234100--Sobic001G395900 Sobic005G176600 Sobic005G176600 Sobic001G234100--Sobic005G176600 Sobic001G234100--Sobic003G045650 Sobic008G084800--Sobic001G234100 Sobic008G084800--Sobic005G205400 Sobic008G084800--Sobic005G212800 Sobic008G084800--Sobic005G101000 Sobic008G084800--Sobic006G047200 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic008G084800--Sobic002G392000 Sobic008G084800--Sobic005G176600 Sobic008G084800--Sobic008G058600 Sobic008G084800--Sobic007G097550 Sobic005G101000--Sobic001G234100 Sobic005G101000--Sobic001G395900 Sobic005G101000--Sobic008G058600 Sobic005G101000--Sobic008G084800 Sobic005G101000--Sobic006G047200 Sobic005G101000--Sobic005G212800 Sobic005G101000--Sobic005G205400 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic005G101000--Sobic004G299500 Sobic007G202480 Sobic007G202480 Sobic005G101000--Sobic007G202480 Sobic005G205400--Sobic008G084800 Sobic005G205400--Sobic001G234100 Sobic005G205400--Sobic006G047200 Sobic005G205400--Sobic002G392000 Sobic005G205400--Sobic005G212800 Sobic005G205400--Sobic005G101000 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic005G205400--Sobic010G128300 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic005G205400--Sobic001G153100 Sobic005G205400--Sobic008G058600 Sobic006G229901 Sobic006G229901 Sobic003G045650--Sobic006G229901 Sobic003G045650--Sobic008G058600 Sobic003G045650--Sobic005G101000 Sobic003G045650--Sobic007G202480 Sobic003G045650--Sobic004G299500 Sobic003G045650--Sobic001G395900 Sobic003G045650--Sobic005G176600 Sobic003G045650--Sobic005G212800 Sobic003G045650--Sobic001G234100 Sobic005G035900 Sobic005G035900 Sobic006G047200--Sobic005G035900 Sobic006G047200--Sobic005G205400 Sobic006G047200--Sobic008G084800 Sobic006G047200--Sobic002G392000 Sobic006G047200--Sobic001G234100 Sobic006G047200--Sobic005G101000 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic006G047200--Sobic009G136800 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic006G047200--Sobic010G241900 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic006G047200--Sobic005G134200 Sobic008G058600--Sobic005G101000 Sobic008G058600--Sobic003G045650 Sobic008G058600--Sobic001G395900 Sobic008G058600--Sobic004G299500 Sobic008G058600--Sobic001G234100 Sobic008G058600--Sobic005G176600 Sobic008G058600--Sobic007G202480 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic008G058600--Sobic006G230100 Sobic008G058600--Sobic006G229901 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic007G097550--Sobic009G018300 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic007G097550--Sobic001G233100 Sobic007G097550--Sobic005G212800 Sobic007G097550--Sobic008G084800 Sobic007G097550--Sobic005G205400 Sobic007G097550--Sobic001G234100 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic007G097550--Sobic001G506100 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic007G097550--Sobic009G004900 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic007G097550--Sobic006G178300 Sobic001G395900--Sobic007G202480 Sobic001G395900--Sobic004G299500 Sobic001G395900--Sobic005G101000 Sobic001G395900--Sobic006G230100 Sobic006G230200 Sobic006G230200 Sobic001G395900--Sobic006G230200 Sobic001G395900--Sobic008G058600 Sobic001G395900--Sobic006G229901 Sobic004G261500 Sobic004G261500 Sobic001G395900--Sobic004G261500 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic001G395900--Sobic005G069166
Octagon: transcription factors


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