Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G205400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5Y7F2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G084800 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
2 Sobic.001G234100 expressed protein -
3 Sobic.006G047200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
4 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.005G212800 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
6 Sobic.005G101000 - -
7 Sobic.010G128300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.001G153100 sulfate transporter, putative, expressed K17470: sulfate transporter 1, high-affinity
9 Sobic.008G058600 protein kinase family protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G136800 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
11 Sobic.005G226400 RGH1A, putative, expressed -
12 Sobic.005G035900 PAN domain-containing protein At5g03700 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.001G395900 Nicotianamine synthase 4("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@nicotianamine synthase, putative, expressed K05953: nicotianamine synthase
14 Sobic.007G097550 - -
15 Sobic.002G063700 NB-ARC domain containing protein, expressed -
16 Sobic.005G134200 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.13 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
17 Sobic.002G289500 carbohydrate binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G176600 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G391300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
20 Sobic.004G299500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic005G205400--Sobic008G084800 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic005G205400--Sobic001G234100 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic005G205400--Sobic006G047200 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic005G205400--Sobic002G392000 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic005G205400--Sobic005G212800 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic005G205400--Sobic005G101000 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic005G205400--Sobic010G128300 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic005G205400--Sobic001G153100 Sobic008G058600 Sobic008G058600 Sobic005G205400--Sobic008G058600 Sobic008G084800--Sobic001G234100 Sobic008G084800--Sobic005G205400 Sobic008G084800--Sobic005G212800 Sobic008G084800--Sobic005G101000 Sobic008G084800--Sobic006G047200 Sobic008G084800--Sobic002G392000 Sobic005G176600 Sobic005G176600 Sobic008G084800--Sobic005G176600 Sobic008G084800--Sobic008G058600 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic008G084800--Sobic007G097550 Sobic001G234100--Sobic008G084800 Sobic001G234100--Sobic005G101000 Sobic001G234100--Sobic005G212800 Sobic001G234100--Sobic005G205400 Sobic001G234100--Sobic006G047200 Sobic001G234100--Sobic008G058600 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic001G234100--Sobic001G395900 Sobic001G234100--Sobic005G176600 Sobic003G045650 Sobic003G045650 Sobic001G234100--Sobic003G045650 Sobic005G035900 Sobic005G035900 Sobic006G047200--Sobic005G035900 Sobic006G047200--Sobic005G205400 Sobic006G047200--Sobic008G084800 Sobic006G047200--Sobic002G392000 Sobic006G047200--Sobic001G234100 Sobic006G047200--Sobic005G101000 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic006G047200--Sobic009G136800 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic006G047200--Sobic010G241900 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic006G047200--Sobic005G134200 Sobic002G392000--Sobic010G128300 Sobic002G392000--Sobic005G205400 Sobic002G392000--Sobic006G047200 Sobic001G499900 Sobic001G499900 Sobic002G392000--Sobic001G499900 Sobic002G392000--Sobic009G136800 Sobic002G392000--Sobic008G084800 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic002G392000--Sobic010G191700 Sobic002G392000--Sobic010G241900 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic002G392000--Sobic002G391300 Sobic005G212800--Sobic001G234100 Sobic005G212800--Sobic008G084800 Sobic005G212800--Sobic005G101000 Sobic005G212800--Sobic005G205400 Sobic005G212800--Sobic003G045650 Sobic005G212800--Sobic006G047200 Sobic005G212800--Sobic008G058600 Sobic005G212800--Sobic007G097550 Sobic005G212800--Sobic001G395900 Sobic005G101000--Sobic001G234100 Sobic005G101000--Sobic001G395900 Sobic005G101000--Sobic008G058600 Sobic005G101000--Sobic008G084800 Sobic005G101000--Sobic006G047200 Sobic005G101000--Sobic005G212800 Sobic005G101000--Sobic005G205400 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic005G101000--Sobic004G299500 Sobic007G202480 Sobic007G202480 Sobic005G101000--Sobic007G202480 Sobic010G128300--Sobic002G392000 Sobic010G128300--Sobic010G241900 Sobic010G128300--Sobic010G191700 Sobic010G128300--Sobic002G391300 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic010G128300--Sobic005G226400 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic010G128300--Sobic005G226350 Sobic010G128300--Sobic005G134200 Sobic010G128300--Sobic009G136800 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic010G128300--Sobic007G220400 Sobic001G153100--Sobic007G202480 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic001G153100--Sobic005G069166 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic001G153100--Sobic006G230100 Sobic001G153100--Sobic004G299500 Sobic006G229901 Sobic006G229901 Sobic001G153100--Sobic006G229901 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic001G153100--Sobic002G063700 Sobic001G153100--Sobic001G395900 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic001G153100--Sobic001G415100 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic001G153100--Sobic002G289500 Sobic008G058600--Sobic005G101000 Sobic008G058600--Sobic003G045650 Sobic008G058600--Sobic001G395900 Sobic008G058600--Sobic004G299500 Sobic008G058600--Sobic001G234100 Sobic008G058600--Sobic005G176600 Sobic008G058600--Sobic007G202480 Sobic008G058600--Sobic006G230100 Sobic008G058600--Sobic006G229901
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.