Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G097550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R9J0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -
2 Sobic.001G233100 - -
3 Sobic.005G212800 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
4 Sobic.008G084800 major facilitator superfamily antiporter, putative, expressed -
5 Sobic.005G205400 - -
6 Sobic.001G234100 expressed protein -
7 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
8 Sobic.009G004900 protein kinase domain containing protein, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
9 Sobic.006G178300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.005G226400 RGH1A, putative, expressed -
11 Sobic.006G047200 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G392000 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
13 Sobic.004G337950 - -
14 Sobic.010G128300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
15 Sobic.004G119900 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
17 Sobic.005G101000 - -
18 Sobic.005G134200 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.13 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
19 Sobic.010G269000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G009300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic007G097550--Sobic009G018300 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic007G097550--Sobic001G233100 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic007G097550--Sobic005G212800 Sobic008G084800 Sobic008G084800 Sobic007G097550--Sobic008G084800 Sobic005G205400 Sobic005G205400 Sobic007G097550--Sobic005G205400 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic007G097550--Sobic001G234100 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic007G097550--Sobic001G506100 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic007G097550--Sobic009G004900 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic007G097550--Sobic006G178300 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic001G233100--Sobic009G004900 Sobic001G233100--Sobic009G018300 Sobic001G233100--Sobic001G506100 Sobic001G233100--Sobic007G097550 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic001G233100--Sobic004G119900 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic001G233100--Sobic010G128300 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic001G233100--Sobic005G226200 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic001G233100--Sobic005G226400 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic001G233100--Sobic002G392000 Sobic005G212800--Sobic001G234100 Sobic005G212800--Sobic008G084800 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic005G212800--Sobic005G101000 Sobic005G212800--Sobic005G205400 Sobic003G045650 Sobic003G045650 Sobic005G212800--Sobic003G045650 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic005G212800--Sobic006G047200 Sobic008G058600 Sobic008G058600 Sobic005G212800--Sobic008G058600 Sobic005G212800--Sobic007G097550 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic005G212800--Sobic001G395900 Sobic008G084800--Sobic001G234100 Sobic008G084800--Sobic005G205400 Sobic008G084800--Sobic005G212800 Sobic008G084800--Sobic005G101000 Sobic008G084800--Sobic006G047200 Sobic008G084800--Sobic002G392000 Sobic005G176600 Sobic005G176600 Sobic008G084800--Sobic005G176600 Sobic008G084800--Sobic008G058600 Sobic008G084800--Sobic007G097550 Sobic005G205400--Sobic008G084800 Sobic005G205400--Sobic001G234100 Sobic005G205400--Sobic006G047200 Sobic005G205400--Sobic002G392000 Sobic005G205400--Sobic005G212800 Sobic005G205400--Sobic005G101000 Sobic005G205400--Sobic010G128300 Sobic001G153100 Sobic001G153100 Sobic005G205400--Sobic001G153100 Sobic005G205400--Sobic008G058600 Sobic001G234100--Sobic008G084800 Sobic001G234100--Sobic005G101000 Sobic001G234100--Sobic005G212800 Sobic001G234100--Sobic005G205400 Sobic001G234100--Sobic006G047200 Sobic001G234100--Sobic008G058600 Sobic001G234100--Sobic001G395900 Sobic001G234100--Sobic005G176600 Sobic001G234100--Sobic003G045650 Sobic001G506100--Sobic009G018300 Sobic001G506100--Sobic001G233100 Sobic001G506100--Sobic010G128300 Sobic001G506100--Sobic009G004900 Sobic001G506100--Sobic002G392000 Sobic001G506100--Sobic007G097550 Sobic001G506100--Sobic005G205400 Sobic001G506100--Sobic005G226200 Sobic001G506100--Sobic005G226400 Sobic009G004900--Sobic001G233100 Sobic009G004900--Sobic009G018300 Sobic009G004900--Sobic001G506100 Sobic009G004900--Sobic007G097550 Sobic009G004900--Sobic005G226400 Sobic009G004900--Sobic010G128300 Sobic009G004900--Sobic004G119900 Sobic004G120000 Sobic004G120000 Sobic009G004900--Sobic004G120000 Sobic002G409200 Sobic002G409200 Sobic009G004900--Sobic002G409200 Sobic006G178300--Sobic008G084800 Sobic006G178300--Sobic007G097550 Sobic006G178300--Sobic005G212800 Sobic006G178300--Sobic009G018300 Sobic006G178300--Sobic001G234100 Sobic006G178300--Sobic005G205400 Sobic006G178300--Sobic006G047200 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic006G178300--Sobic009G079200 Sobic006G178300--Sobic005G176600
Octagon: transcription factors


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