Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G009300.1
Synonym Sb04g000980
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XS79
Pfam -
Panther DB PTHR36038 PTHR36038:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g02160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G018300 vrga1, putative, expressed -
2 Sobic.002G392300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
3 Sobic.007G094100 OsWAK108 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
4 Sobic.004G337950 - -
5 Sobic.006G135500 glyoxal oxidase-related, putative, expressed -
6 Sobic.003G046700 expressed protein -
7 Sobic.004G119900 expansin precursor, putative, expressed -
8 Sobic.001G233100 - -
9 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
10 Sobic.007G097550 - -
11 Sobic.001G506100 Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.006G171300 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G392200 peroxidase precursor, putative, expressed -
14 Sobic.010G269000 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G216500 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
16 Sobic.006G178300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.001G238100 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.004G008600 receptor protein kinase CLAVATA1 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.010G115000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@limonoid UDP-glucosyltransferase, putative, expressed -
20 Sobic.005G079100 dirigent, putative -


Gene co-expression network
sample Sobic004G009300 Sobic004G009300 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic004G009300--Sobic009G018300 Sobic002G392300 Sobic002G392300 Sobic004G009300--Sobic002G392300 Sobic007G094100 Sobic007G094100 Sobic004G009300--Sobic007G094100 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic004G009300--Sobic004G337950 Sobic006G135500 Sobic006G135500 Sobic004G009300--Sobic006G135500 Sobic003G046700 Sobic003G046700 Sobic004G009300--Sobic003G046700 Sobic004G119900 Sobic004G119900 Sobic004G009300--Sobic004G119900 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic004G009300--Sobic001G233100 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic004G009300--Sobic001G521600 Sobic007G097550 Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic007G097550 Sobic009G018300--Sobic001G233100 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic009G018300--Sobic001G506100 Sobic009G004900 Sobic009G004900 Sobic009G018300--Sobic009G004900 Sobic009G018300--Sobic003G046700 Sobic009G018300--Sobic001G521600 Sobic009G018300--Sobic004G337950 Sobic009G018300--Sobic004G009300 Sobic010G269000 Sobic010G269000 Sobic009G018300--Sobic010G269000 Sobic002G392200 Sobic002G392200 Sobic002G392300--Sobic002G392200 Sobic002G392300--Sobic004G009300 Sobic002G392300--Sobic006G135500 Sobic003G425701 Sobic003G425701 Sobic002G392300--Sobic003G425701 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic002G392300--Sobic006G171300 Sobic002G392300--Sobic004G337950 Sobic002G392300--Sobic007G094100 Sobic002G392300--Sobic009G018300 Sobic006G178300 Sobic006G178300 Sobic002G392300--Sobic006G178300 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic007G094100--Sobic010G115000 Sobic005G216500 Sobic005G216500 Sobic007G094100--Sobic005G216500 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic007G094100--Sobic004G008600 Sobic007G094100--Sobic010G269000 Sobic007G094100--Sobic004G009300 Sobic007G094100--Sobic003G046700 Sobic007G094100--Sobic006G171300 Sobic007G094100--Sobic009G018300 Sobic005G120900 Sobic005G120900 Sobic007G094100--Sobic005G120900 Sobic004G337950--Sobic009G018300 Sobic004G337950--Sobic001G521600 Sobic004G337950--Sobic007G097550 Sobic004G337950--Sobic004G009300 Sobic004G337950--Sobic001G233100 Sobic004G337950--Sobic007G094100 Sobic004G337950--Sobic001G506100 Sobic004G337950--Sobic003G046700 Sobic004G337950--Sobic009G004900 Sobic001G238100 Sobic001G238100 Sobic006G135500--Sobic001G238100 Sobic007G019900 Sobic007G019900 Sobic006G135500--Sobic007G019900 Sobic010G139100 Sobic010G139100 Sobic006G135500--Sobic010G139100 Sobic006G135500--Sobic004G009300 Sobic006G135500--Sobic002G392300 Sobic006G135500--Sobic003G046700 Sobic002G334000 Sobic002G334000 Sobic006G135500--Sobic002G334000 Sobic009G032900 Sobic009G032900 Sobic006G135500--Sobic009G032900 Sobic005G226200 Sobic005G226200 Sobic006G135500--Sobic005G226200 Sobic003G046700--Sobic002G334000 Sobic003G046700--Sobic010G269000 Sobic003G046700--Sobic004G008600 Sobic003G046700--Sobic005G216500 Sobic005G226350 Sobic005G226350 Sobic003G046700--Sobic005G226350 Sobic007G220400 Sobic007G220400 Sobic003G046700--Sobic007G220400 Sobic010G191700 Sobic010G191700 Sobic003G046700--Sobic010G191700 Sobic003G046700--Sobic009G018300 Sobic010G241900 Sobic010G241900 Sobic003G046700--Sobic010G241900 Sobic005G226400 Sobic005G226400 Sobic004G119900--Sobic005G226400 Sobic004G119900--Sobic009G018300 Sobic010G128300 Sobic010G128300 Sobic004G119900--Sobic010G128300 Sobic005G134200 Sobic005G134200 Sobic004G119900--Sobic005G134200 Sobic004G119900--Sobic001G233100 Sobic004G119900--Sobic007G220400 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G119900--Sobic009G136800 Sobic002G392000 Sobic002G392000 Sobic004G119900--Sobic002G392000 Sobic006G047200 Sobic006G047200 Sobic004G119900--Sobic006G047200 Sobic001G233100--Sobic009G004900 Sobic001G233100--Sobic009G018300 Sobic001G233100--Sobic001G506100 Sobic001G233100--Sobic007G097550 Sobic001G233100--Sobic004G119900 Sobic001G233100--Sobic010G128300 Sobic001G233100--Sobic005G226200 Sobic001G233100--Sobic005G226400 Sobic001G233100--Sobic002G392000 Sobic001G521600--Sobic009G018300 Sobic001G521600--Sobic004G337950 Sobic001G521600--Sobic003G046700 Sobic001G521600--Sobic010G128300 Sobic001G521600--Sobic001G506100 Sobic001G521600--Sobic004G119900 Sobic001G521600--Sobic007G097550 Sobic001G521600--Sobic001G233100 Sobic001G521600--Sobic005G134200
Octagon: transcription factors


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