Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G220740.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RKD2
Pfam PF07714 PF08263
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF30
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47580 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g13970.2 : receptor-like kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G220800 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
2 Sobic.005G049350 - -
3 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.001G499701 - -
5 Sobic.004G013700 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G176300 - -
7 Sobic.009G098000 expressed protein -
8 Sobic.004G010050 - -
9 Sobic.004G337950 - -
10 Sobic.006G171300 expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G392300 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.006G004900 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
13 Sobic.005G161600 terpene synthase, putative, expressed K04121: ent-kaurene synthase
14 Sobic.004G228850 - -
15 Sobic.002G392200 peroxidase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
17 Sobic.005G012600 LTPL10 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
18 Sobic.010G063900 AP2 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.004G009300 expressed protein -
20 Sobic.010G174100 expressed protein -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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