Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G220800.1
Synonym EFR
Functional annotation receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RJW3
Pfam PF07714 PF08263 PF00560 PF13855
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF30
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g10310.1 : receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK23306
Barley -
Wheat TraesCS5D02G444700
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G220740 - -
2 Sobic.001G499701 - -
3 Sobic.005G049350 - -
4 Sobic.007G149000 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@cytochrome P450, putative, expressed -
5 Sobic.003G176300 - -
6 Sobic.006G004900 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
7 Sobic.005G012600 LTPL10 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.009G098000 expressed protein -
9 Sobic.001G160500 phenylalanine ammonia-lyase, putative, expressed K10775: phenylalanine ammonia-lyase
10 Sobic.002G076700 IPP transferase, putative, expressed K10760: adenylate dimethylallyltransferase (cytokinin synthase)
11 Sobic.004G010050 - -
12 Sobic.001G521600 Leucine-rich repeat family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
13 Sobic.009G015200 - -
14 Sobic.009G187150 - -
15 Sobic.004G337950 - -
16 Sobic.001G506500 exostosin family domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G243600 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G048400 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
19 Sobic.005G216700 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G079200 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G220800 Sobic005G220800 Sobic005G220740 Sobic005G220740 Sobic005G220800--Sobic005G220740 Sobic001G499701 Sobic001G499701 Sobic005G220800--Sobic001G499701 Sobic005G049350 Sobic005G049350 Sobic005G220800--Sobic005G049350 Sobic007G149000 Sobic007G149000 Sobic005G220800--Sobic007G149000 Sobic003G176300 Sobic003G176300 Sobic005G220800--Sobic003G176300 Sobic006G004900 Sobic006G004900 Sobic005G220800--Sobic006G004900 Sobic005G012600 Sobic005G012600 Sobic005G220800--Sobic005G012600 Sobic009G098000 Sobic009G098000 Sobic005G220800--Sobic009G098000 Sobic001G160500 Sobic001G160500 Sobic005G220800--Sobic001G160500 Sobic005G220740--Sobic005G220800 Sobic005G220740--Sobic005G049350 Sobic005G220740--Sobic007G149000 Sobic005G220740--Sobic001G499701 Sobic004G013700 Sobic004G013700 Sobic005G220740--Sobic004G013700 Sobic005G220740--Sobic003G176300 Sobic005G220740--Sobic009G098000 Sobic004G010050 Sobic004G010050 Sobic005G220740--Sobic004G010050 Sobic004G337950 Sobic004G337950 Sobic005G220740--Sobic004G337950 Sobic001G499701--Sobic005G049350 Sobic001G499701--Sobic003G176300 Sobic001G499701--Sobic007G149000 Sobic005G216700 Sobic005G216700 Sobic001G499701--Sobic005G216700 Sobic009G015200 Sobic009G015200 Sobic001G499701--Sobic009G015200 Sobic001G499701--Sobic009G098000 Sobic007G019900 Sobic007G019900 Sobic001G499701--Sobic007G019900 Sobic009G035900 Sobic009G035900 Sobic001G499701--Sobic009G035900 Sobic001G499701--Sobic005G220740 Sobic001G521600 Sobic001G521600 Sobic005G049350--Sobic001G521600 Sobic005G049350--Sobic007G149000 Sobic005G049350--Sobic003G176300 Sobic005G049350--Sobic004G337950 Sobic005G049350--Sobic009G098000 Sobic005G049350--Sobic001G499701 Sobic001G233100 Sobic001G233100 Sobic005G049350--Sobic001G233100 Sobic009G018300 Sobic009G018300 Sobic005G049350--Sobic009G018300 Sobic009G079200 Sobic009G079200 Sobic005G049350--Sobic009G079200 Sobic007G149000--Sobic005G049350 Sobic007G094100 Sobic007G094100 Sobic007G149000--Sobic007G094100 Sobic007G149000--Sobic001G521600 Sobic006G171300 Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic006G171300 Sobic007G149000--Sobic003G176300 Sobic007G149000--Sobic004G337950 Sobic007G149000--Sobic005G012600 Sobic007G149000--Sobic009G098000 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic007G149000--Sobic010G115000 Sobic003G176300--Sobic005G049350 Sobic003G176300--Sobic001G521600 Sobic003G176300--Sobic007G149000 Sobic003G176300--Sobic005G216700 Sobic006G266800 Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic006G266800 Sobic003G176300--Sobic009G079200 Sobic009G259800 Sobic009G259800 Sobic003G176300--Sobic009G259800 Sobic006G133200 Sobic006G133200 Sobic003G176300--Sobic006G133200 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic003G176300--Sobic006G133300 Sobic006G004900--Sobic004G010050 Sobic003G223600 Sobic003G223600 Sobic006G004900--Sobic003G223600 Sobic008G112700 Sobic008G112700 Sobic006G004900--Sobic008G112700 Sobic002G063566 Sobic002G063566 Sobic006G004900--Sobic002G063566 Sobic003G324900 Sobic003G324900 Sobic006G004900--Sobic003G324900 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic006G004900--Sobic003G059600 Sobic010G253250 Sobic010G253250 Sobic006G004900--Sobic010G253250 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic006G004900--Sobic004G279900 Sobic004G208201 Sobic004G208201 Sobic006G004900--Sobic004G208201 Sobic005G012600--Sobic007G149000 Sobic002G076700 Sobic002G076700 Sobic005G012600--Sobic002G076700 Sobic005G012600--Sobic001G521600 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic005G012600--Sobic006G092100 Sobic005G012600--Sobic004G337950 Sobic005G012600--Sobic007G094100 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic005G012600--Sobic008G138700 Sobic005G012600--Sobic009G018300 Sobic004G008600 Sobic004G008600 Sobic005G012600--Sobic004G008600 Sobic009G098000--Sobic005G049350 Sobic009G098000--Sobic001G521600 Sobic009G098000--Sobic004G337950 Sobic009G098000--Sobic007G149000 Sobic009G098000--Sobic009G079200 Sobic009G098000--Sobic003G176300 Sobic001G506100 Sobic001G506100 Sobic009G098000--Sobic001G506100 Sobic009G098000--Sobic009G018300 Sobic004G080300 Sobic004G080300 Sobic009G098000--Sobic004G080300 Sobic001G277600 Sobic001G277600 Sobic001G160500--Sobic001G277600 Sobic004G148400 Sobic004G148400 Sobic001G160500--Sobic004G148400 Sobic001G506500 Sobic001G506500 Sobic001G160500--Sobic001G506500 Sobic005G048400 Sobic005G048400 Sobic001G160500--Sobic005G048400 Sobic001G076300 Sobic001G076300 Sobic001G160500--Sobic001G076300 Sobic001G160500--Sobic001G499701 Sobic001G160500--Sobic002G063566 Sobic002G273400 Sobic002G273400 Sobic001G160500--Sobic002G273400 Sobic001G160500--Sobic009G098000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.