Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G015000.1
Synonym Sb06g001460
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YC56
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF28
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45480 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g07250.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a012322
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5B02G470000 , TraesCS7A02G197200 , TraesCS5D02G471400
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G209450 - -
2 Sobic.009G193600 Eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G241000 homeobox domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G126200 - -
5 Sobic.005G228250 - -
6 Sobic.002G015950 - -
7 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.010G003000 - -
9 Sobic.004G071850 - -
10 Sobic.003G019500 - -
11 Sobic.003G260050 - -
12 Sobic.008G119100 - -
13 Sobic.005G015600 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
14 Sobic.010G194801 - -
15 Sobic.005G156201 - -
16 Sobic.003G111700 - -
17 Sobic.008G088812 - -
18 Sobic.006G272100 OsFBX30 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
20 Sobic.003G331200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G015000 Sobic006G015000 Sobic004G209450 Sobic004G209450 Sobic006G015000--Sobic004G209450 Sobic009G193600 Sobic009G193600 Sobic006G015000--Sobic009G193600 Sobic006G241000 Sobic006G241000 Sobic006G015000--Sobic006G241000 Sobic009G126200 Sobic009G126200 Sobic006G015000--Sobic009G126200 Sobic005G228250 Sobic005G228250 Sobic006G015000--Sobic005G228250 Sobic002G015950 Sobic002G015950 Sobic006G015000--Sobic002G015950 Sobic009G043900 Sobic009G043900 Sobic006G015000--Sobic009G043900 Sobic010G003000 Sobic010G003000 Sobic006G015000--Sobic010G003000 Sobic004G071850 Sobic004G071850 Sobic006G015000--Sobic004G071850 Sobic004G209450--Sobic009G126200 Sobic002G372100 Sobic002G372100 Sobic004G209450--Sobic002G372100 Sobic005G159400 Sobic005G159400 Sobic004G209450--Sobic005G159400 Sobic004G209450--Sobic005G228250 Sobic004G209450--Sobic006G015000 Sobic009G248600 Sobic009G248600 Sobic004G209450--Sobic009G248600 Sobic007G022100 Sobic007G022100 Sobic004G209450--Sobic007G022100 Sobic003G089500 Sobic003G089500 Sobic004G209450--Sobic003G089500 Sobic005G133750 Sobic005G133750 Sobic004G209450--Sobic005G133750 Sobic009G193600--Sobic002G015950 Sobic006G037500 Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic006G037500 Sobic009G193600--Sobic004G071850 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G193600--Sobic005G205100 Sobic001G273950 Sobic001G273950 Sobic009G193600--Sobic001G273950 Sobic003G260050 Sobic003G260050 Sobic009G193600--Sobic003G260050 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic003G111700 Sobic009G193600--Sobic009G043900 Sobic006G049000 Sobic006G049000 Sobic009G193600--Sobic006G049000 Sobic006G241000--Sobic009G043900 Sobic006G241000--Sobic002G015950 Sobic006G241000--Sobic003G260050 Sobic006G241000--Sobic009G193600 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic006G241000--Sobic003G019500 Sobic006G241000--Sobic004G071850 Sobic006G241000--Sobic003G111700 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic006G241000--Sobic008G088812 Sobic006G241000--Sobic006G037500 Sobic009G126200--Sobic005G228250 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic009G126200--Sobic006G142925 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic009G126200--Sobic009G019400 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G126200--Sobic002G069300 Sobic003G281000 Sobic003G281000 Sobic009G126200--Sobic003G281000 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G126200--Sobic010G143666 Sobic002G382200 Sobic002G382200 Sobic009G126200--Sobic002G382200 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic009G126200--Sobic009G239400 Sobic009G126200--Sobic005G133750 Sobic005G228250--Sobic009G126200 Sobic008G004500 Sobic008G004500 Sobic005G228250--Sobic008G004500 Sobic005G228250--Sobic005G133750 Sobic005G228250--Sobic002G382200 Sobic005G228250--Sobic010G143666 Sobic002G202050 Sobic002G202050 Sobic005G228250--Sobic002G202050 Sobic002G015950--Sobic003G260050 Sobic002G015950--Sobic003G111700 Sobic002G015950--Sobic009G193600 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic002G015950--Sobic001G310000 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic002G015950--Sobic010G194801 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic010G011500 Sobic002G015950--Sobic004G071850 Sobic002G266700 Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic002G266700 Sobic002G015950--Sobic009G043900 Sobic009G043900--Sobic003G019500 Sobic009G043900--Sobic003G260050 Sobic009G043900--Sobic003G111700 Sobic009G043900--Sobic010G194801 Sobic009G043900--Sobic004G071850 Sobic009G043900--Sobic002G015950 Sobic009G043900--Sobic008G088812 Sobic009G043900--Sobic002G202050 Sobic010G003000--Sobic005G228250 Sobic010G003000--Sobic006G241000 Sobic001G442750 Sobic001G442750 Sobic010G003000--Sobic001G442750 Sobic001G309666 Sobic001G309666 Sobic010G003000--Sobic001G309666 Sobic010G003000--Sobic009G043900 Sobic010G003000--Sobic003G019500 Sobic008G161900 Sobic008G161900 Sobic010G003000--Sobic008G161900 Sobic010G003000--Sobic009G193600 Sobic010G246300 Sobic010G246300 Sobic010G003000--Sobic010G246300 Sobic004G071850--Sobic003G260050 Sobic004G071850--Sobic003G111700 Sobic004G071850--Sobic010G194801 Sobic004G071850--Sobic003G019500 Sobic004G071850--Sobic002G015950 Sobic004G071850--Sobic009G043900 Sobic004G071850--Sobic006G037500 Sobic004G071850--Sobic009G193600 Sobic004G071850--Sobic002G202050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.