Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G073300.1
Synonym Sb06g016070
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt C5YFZ4
Pfam PF00076
Panther DB PTHR24012
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06210 : RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g33810.1 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011496
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G132100 serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
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15 Sobic.002G087700 - -
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17 Sobic.009G236900 - -
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20 Sobic.007G137501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G073300 Sobic006G073300 Sobic005G132100 Sobic005G132100 Sobic006G073300--Sobic005G132100 Sobic002G257150 Sobic002G257150 Sobic006G073300--Sobic002G257150 Sobic008G007500 Sobic008G007500 Sobic006G073300--Sobic008G007500 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic006G073300--Sobic004G242800 Sobic005G187800 Sobic005G187800 Sobic006G073300--Sobic005G187800 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic006G073300--Sobic003G064901 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic006G073300--Sobic002G076300 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic006G073300--Sobic001G144001 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic006G073300--Sobic001G329001 Sobic005G132100--Sobic002G257150 Sobic005G132100--Sobic006G073300 Sobic003G192900 Sobic003G192900 Sobic005G132100--Sobic003G192900 Sobic005G132100--Sobic008G007500 Sobic010G278900 Sobic010G278900 Sobic005G132100--Sobic010G278900 Sobic005G132100--Sobic005G187800 Sobic002G232300 Sobic002G232300 Sobic005G132100--Sobic002G232300 Sobic005G132100--Sobic001G329001 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic005G132100--Sobic009G236900 Sobic002G257150--Sobic001G329001 Sobic002G257150--Sobic005G132100 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic002G257150--Sobic003G410000 Sobic004G248200 Sobic004G248200 Sobic002G257150--Sobic004G248200 Sobic004G058400 Sobic004G058400 Sobic002G257150--Sobic004G058400 Sobic002G257150--Sobic004G242800 Sobic002G257150--Sobic002G076300 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic002G257150--Sobic004G206600 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic002G257150--Sobic002G086700 Sobic008G007500--Sobic005G187800 Sobic008G029000 Sobic008G029000 Sobic008G007500--Sobic008G029000 Sobic004G091900 Sobic004G091900 Sobic008G007500--Sobic004G091900 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic008G007500--Sobic006G202900 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic008G007500--Sobic002G190600 Sobic010G018200 Sobic010G018200 Sobic008G007500--Sobic010G018200 Sobic010G193100 Sobic010G193100 Sobic008G007500--Sobic010G193100 Sobic003G003300 Sobic003G003300 Sobic008G007500--Sobic003G003300 Sobic002G087700 Sobic002G087700 Sobic008G007500--Sobic002G087700 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic004G242800--Sobic001G167000 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic004G242800--Sobic002G012100 Sobic004G242800--Sobic004G206600 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic004G242800--Sobic010G196466 Sobic009G175800 Sobic009G175800 Sobic004G242800--Sobic009G175800 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic004G242800--Sobic001G270800 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic004G242800--Sobic003G330350 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic004G242800--Sobic009G102250 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic004G242800--Sobic009G087540 Sobic005G187800--Sobic008G007500 Sobic005G187800--Sobic008G029000 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic005G187800--Sobic009G087480 Sobic005G187800--Sobic002G232300 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic005G187800--Sobic006G139200 Sobic005G187800--Sobic010G278900 Sobic004G351000 Sobic004G351000 Sobic005G187800--Sobic004G351000 Sobic005G199151 Sobic005G199151 Sobic005G187800--Sobic005G199151 Sobic005G187800--Sobic010G018200 Sobic003G064901--Sobic009G102250 Sobic002G138400 Sobic002G138400 Sobic003G064901--Sobic002G138400 Sobic003G064901--Sobic004G091900 Sobic003G064901--Sobic001G270800 Sobic003G064901--Sobic001G167000 Sobic001G182700 Sobic001G182700 Sobic003G064901--Sobic001G182700 Sobic004G032200 Sobic004G032200 Sobic003G064901--Sobic004G032200 Sobic007G137501 Sobic007G137501 Sobic003G064901--Sobic007G137501 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic003G064901--Sobic001G182800 Sobic001G498033 Sobic001G498033 Sobic002G076300--Sobic001G498033 Sobic002G076300--Sobic001G329001 Sobic002G076300--Sobic002G086700 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic002G076300--Sobic010G195000 Sobic010G054700 Sobic010G054700 Sobic002G076300--Sobic010G054700 Sobic002G377501 Sobic002G377501 Sobic002G076300--Sobic002G377501 Sobic002G076300--Sobic004G242800 Sobic004G347000 Sobic004G347000 Sobic002G076300--Sobic004G347000 Sobic009G235400 Sobic009G235400 Sobic002G076300--Sobic009G235400 Sobic001G144001--Sobic009G236900 Sobic006G131700 Sobic006G131700 Sobic001G144001--Sobic006G131700 Sobic003G139050 Sobic003G139050 Sobic001G144001--Sobic003G139050 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic001G144001--Sobic003G113100 Sobic004G282933 Sobic004G282933 Sobic001G144001--Sobic004G282933 Sobic004G242900 Sobic004G242900 Sobic001G144001--Sobic004G242900 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic001G144001--Sobic009G192200 Sobic001G144001--Sobic003G330350 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic001G144001--Sobic001G054050 Sobic001G329001--Sobic003G410000 Sobic001G329001--Sobic004G058400 Sobic001G329001--Sobic002G086700 Sobic001G329001--Sobic002G257150 Sobic001G329001--Sobic002G076300 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G329001--Sobic008G177100 Sobic001G329001--Sobic010G195000 Sobic003G347560 Sobic003G347560 Sobic001G329001--Sobic003G347560 Sobic006G134300 Sobic006G134300 Sobic001G329001--Sobic006G134300
Octagon: transcription factors


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