Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G112200.3,Sobic.006G112200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDB3 , C5YA86
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G072601 - -
2 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
3 Sobic.003G416000 - -
4 Sobic.004G253700 - -
5 Sobic.009G121400 - -
6 Sobic.007G198700 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.008G084300 - -
8 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
9 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.008G105366 - -
11 Sobic.001G000501 - -
12 Sobic.004G113000 - -
13 Sobic.001G459600 expressed protein -
14 Sobic.003G291200 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsIAA6 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
15 Sobic.003G080700 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.002G017500 expressed protein -
17 Sobic.001G000700 glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
18 Sobic.008G166550 - -
19 Sobic.007G036100 - -
20 Sobic.005G089400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G112200 Sobic006G112200 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic006G112200--Sobic006G072601 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic006G112200--Sobic008G101100 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G112200--Sobic003G416000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic006G112200--Sobic004G253700 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic006G112200--Sobic009G121400 Sobic007G198700 Sobic007G198700 Sobic006G112200--Sobic007G198700 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic006G112200--Sobic008G084300 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic006G112200--Sobic001G333300 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic006G112200--Sobic007G198400 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic006G072601--Sobic004G038800 Sobic006G072601--Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic009G121400 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic002G115075 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic007G198400 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic006G072601--Sobic008G105366 Sobic006G072601--Sobic003G416000 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic006G072601--Sobic005G007000 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic008G101100 Sobic004G253700--Sobic005G089400 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic004G253700--Sobic008G122100 Sobic004G253700--Sobic005G133600 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic004G253700--Sobic007G010700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic004G253700--Sobic001G000501 Sobic004G253700--Sobic009G248801 Sobic004G253700--Sobic003G416000 Sobic004G253700--Sobic008G105366 Sobic009G121400--Sobic006G072601 Sobic009G121400--Sobic004G113000 Sobic009G121400--Sobic001G333300 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic008G105366 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic007G010700 Sobic009G121400--Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic003G416000 Sobic007G198700--Sobic007G198400 Sobic007G198700--Sobic006G112200 Sobic007G198700--Sobic006G072601 Sobic007G036100 Sobic007G036100 Sobic007G198700--Sobic007G036100 Sobic007G198700--Sobic008G105366 Sobic007G198700--Sobic003G080700 Sobic007G198700--Sobic008G101100 Sobic007G198700--Sobic003G416000 Sobic007G198700--Sobic001G227900 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic008G084300--Sobic008G088833 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic008G084300--Sobic001G459600 Sobic008G084300--Sobic008G166550 Sobic008G084300--Sobic001G000501 Sobic008G084300--Sobic008G101100 Sobic008G084300--Sobic002G244200 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G084300--Sobic005G095000 Sobic008G084300--Sobic009G248801 Sobic008G084300--Sobic003G416000 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic007G198400--Sobic007G141380 Sobic007G198400--Sobic001G227900 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic006G072601 Sobic007G198400--Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic008G105366 Sobic007G198400--Sobic007G202300 Sobic007G198400--Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic003G416000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.