Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G113000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQ42
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G072601 - -
2 Sobic.008G105366 - -
3 Sobic.005G007000 - -
4 Sobic.009G121400 - -
5 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G459600 expressed protein -
8 Sobic.008G166550 - -
9 Sobic.008G084300 - -
10 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
11 Sobic.003G416000 - -
12 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
13 Sobic.002G115050 - -
14 Sobic.003G069875 - -
15 Sobic.010G256466 - -
16 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
17 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
18 Sobic.010G020800 aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed K14270: aminotransferase
19 Sobic.004G143475 - -
20 Sobic.006G240400 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic004G113000--Sobic006G072601 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G113000--Sobic008G105366 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic005G007000 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic004G113000--Sobic009G121400 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic007G198400 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic004G113000--Sobic004G038800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G113000--Sobic001G459600 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic004G113000--Sobic008G166550 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic004G113000--Sobic008G084300 Sobic006G072601--Sobic004G038800 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic009G121400 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic007G198400 Sobic006G072601--Sobic008G105366 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic005G007000 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic004G113000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic006G072601 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic007G198400 Sobic008G105366--Sobic001G459600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic009G121400 Sobic005G007000--Sobic004G113000 Sobic005G007000--Sobic006G072601 Sobic005G007000--Sobic008G105366 Sobic005G007000--Sobic009G121400 Sobic005G007000--Sobic007G198400 Sobic005G007000--Sobic004G038800 Sobic005G007000--Sobic009G260350 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic005G007000--Sobic004G230700 Sobic005G007000--Sobic001G333300 Sobic009G121400--Sobic006G072601 Sobic009G121400--Sobic004G113000 Sobic009G121400--Sobic001G333300 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic008G105366 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic004G334300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic009G121400--Sobic007G010700 Sobic009G121400--Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic003G416000 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic007G198400--Sobic007G141380 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic006G072601 Sobic007G198400--Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic008G105366 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic007G198400--Sobic007G202300 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic003G416000 Sobic004G038800--Sobic006G072601 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic004G038800--Sobic002G115050 Sobic001G303100 Sobic001G303100 Sobic004G038800--Sobic001G303100 Sobic010G131700 Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic002G115075 Sobic001G381600 Sobic001G381600 Sobic004G038800--Sobic001G381600 Sobic010G033100 Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic007G198400 Sobic007G106800 Sobic007G106800 Sobic004G038800--Sobic007G106800 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic005G133600 Sobic002G431500 Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic002G431500 Sobic008G166550--Sobic007G202300 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic002G244200 Sobic008G166550--Sobic003G416000 Sobic008G166550--Sobic008G101100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic005G095000 Sobic008G166550--Sobic002G017500 Sobic008G166550--Sobic002G115050 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic008G166550--Sobic005G093800 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic008G084300--Sobic008G088833 Sobic008G084300--Sobic001G459600 Sobic008G084300--Sobic008G166550 Sobic008G084300--Sobic001G000501 Sobic008G084300--Sobic008G101100 Sobic008G084300--Sobic002G244200 Sobic008G084300--Sobic005G095000 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic008G084300--Sobic009G248801 Sobic008G084300--Sobic003G416000
Octagon: transcription factors


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