Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G069875.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VW28
Pfam PF00560
Panther DB PTHR27000 PTHR27000:SF164
NCBI CDD KOG0472; Leucine-rich repeat protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47570 : Leucine-rich repeat protein kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05960.1 : receptor kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK02275
Barley -
Wheat TraesCS1B02G004700 , TraesCS4B02G360600 , TraesCS4B02G360600
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G069950 - -
2 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G459600 expressed protein -
4 Sobic.008G007400 receptor-like protein kinase 2 precursor, putative, expressed -
5 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
6 Sobic.004G113000 - -
7 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase
8 Sobic.002G059932 - -
9 Sobic.009G147300 expressed protein -
10 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
11 Sobic.005G156400 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
12 Sobic.009G097250 - -
13 Sobic.003G317500 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase
14 Sobic.006G072601 - -
15 Sobic.009G130000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endo-1,3@1,4-beta-D-glucanase precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G127001 - -
17 Sobic.002G115050 - -
18 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
19 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G069875 Sobic003G069875 Sobic003G069950 Sobic003G069950 Sobic003G069875--Sobic003G069950 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic003G069875--Sobic006G061900 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic003G069875--Sobic001G459600 Sobic008G007400 Sobic008G007400 Sobic003G069875--Sobic008G007400 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic003G069875--Sobic001G333300 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic003G069875--Sobic004G113000 Sobic001G248200 Sobic001G248200 Sobic003G069875--Sobic001G248200 Sobic002G059932 Sobic002G059932 Sobic003G069875--Sobic002G059932 Sobic009G147300 Sobic009G147300 Sobic003G069875--Sobic009G147300 Sobic003G069950--Sobic003G069875 Sobic003G069950--Sobic001G248200 Sobic007G169300 Sobic007G169300 Sobic003G069950--Sobic007G169300 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic003G069950--Sobic001G517800 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic003G069950--Sobic003G317500 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic003G069950--Sobic009G011600 Sobic001G351800 Sobic001G351800 Sobic003G069950--Sobic001G351800 Sobic003G069950--Sobic001G459600 Sobic003G301900 Sobic003G301900 Sobic003G069950--Sobic003G301900 Sobic005G221250 Sobic005G221250 Sobic006G061900--Sobic005G221250 Sobic006G061900--Sobic003G069875 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic006G061900--Sobic004G038800 Sobic006G061900--Sobic001G333300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic006G061900--Sobic007G010700 Sobic006G061900--Sobic003G317500 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic006G061900--Sobic005G095660 Sobic005G150350 Sobic005G150350 Sobic006G061900--Sobic005G150350 Sobic006G061900--Sobic001G459600 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G459600--Sobic005G133600 Sobic008G007400--Sobic003G069875 Sobic009G019100 Sobic009G019100 Sobic008G007400--Sobic009G019100 Sobic008G007400--Sobic003G069950 Sobic001G275500 Sobic001G275500 Sobic008G007400--Sobic001G275500 Sobic005G175500 Sobic005G175500 Sobic008G007400--Sobic005G175500 Sobic006G060601 Sobic006G060601 Sobic008G007400--Sobic006G060601 Sobic008G007400--Sobic009G147300 Sobic009G213800 Sobic009G213800 Sobic008G007400--Sobic009G213800 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic008G007400--Sobic003G080800 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic004G113000--Sobic006G072601 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G113000--Sobic008G105366 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic009G121400 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic004G038800 Sobic004G113000--Sobic001G459600 Sobic004G113000--Sobic008G166550 Sobic004G113000--Sobic008G084300 Sobic001G248200--Sobic005G095660 Sobic006G030600 Sobic006G030600 Sobic001G248200--Sobic006G030600 Sobic001G396000 Sobic001G396000 Sobic001G248200--Sobic001G396000 Sobic010G203200 Sobic010G203200 Sobic001G248200--Sobic010G203200 Sobic001G248200--Sobic004G034600 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic001G248200--Sobic008G081800 Sobic004G131040 Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic007G010700 Sobic001G248300 Sobic001G248300 Sobic001G248200--Sobic001G248300 Sobic005G156400 Sobic005G156400 Sobic002G059932--Sobic005G156400 Sobic002G190200 Sobic002G190200 Sobic002G059932--Sobic002G190200 Sobic009G130000 Sobic009G130000 Sobic002G059932--Sobic009G130000 Sobic002G044700 Sobic002G044700 Sobic002G059932--Sobic002G044700 Sobic002G071350 Sobic002G071350 Sobic002G059932--Sobic002G071350 Sobic001G363900 Sobic001G363900 Sobic002G059932--Sobic001G363900 Sobic001G086800 Sobic001G086800 Sobic009G147300--Sobic001G086800 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic009G147300--Sobic001G413000 Sobic009G147300--Sobic007G169300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic009G147300--Sobic003G080700 Sobic003G190100 Sobic003G190100 Sobic009G147300--Sobic003G190100 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic009G147300--Sobic005G149200 Sobic002G390500 Sobic002G390500 Sobic009G147300--Sobic002G390500 Sobic006G243800 Sobic006G243800 Sobic009G147300--Sobic006G243800 Sobic009G147300--Sobic001G517800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.