Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G097250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1V1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G01800 : saposin B domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g26954.1 : saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a037540
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
2 Sobic.002G115050 - -
3 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
4 Sobic.002G175050 - -
5 Sobic.007G083800 - -
6 Sobic.006G072601 - -
7 Sobic.010G141966 - -
8 Sobic.003G291200 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsIAA6 - Auxin-responsive Aux/IAA gene family member, expressed K14484: auxin-responsive protein IAA
9 Sobic.005G075100 rp3 protein, putative, expressed -
10 Sobic.009G130000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@endo-1,3@1,4-beta-D-glucanase precursor, putative, expressed -
11 Sobic.010G141800 expressed protein -
12 Sobic.008G084300 - -
13 Sobic.003G317500 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase
14 Sobic.003G063000 expressed protein -
15 Sobic.008G184900 resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G092800 - -
17 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
18 Sobic.002G111000 peptidase, putative, expressed -
19 Sobic.003G069875 - -
20 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G097250 Sobic009G097250 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic009G097250--Sobic009G097200 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic009G097250--Sobic002G115050 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic009G097250--Sobic001G333300 Sobic002G175050 Sobic002G175050 Sobic009G097250--Sobic002G175050 Sobic007G083800 Sobic007G083800 Sobic009G097250--Sobic007G083800 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic009G097250--Sobic006G072601 Sobic010G141966 Sobic010G141966 Sobic009G097250--Sobic010G141966 Sobic003G291200 Sobic003G291200 Sobic009G097250--Sobic003G291200 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic009G097250--Sobic005G075100 Sobic004G181700 Sobic004G181700 Sobic009G097200--Sobic004G181700 Sobic009G097200--Sobic005G075100 Sobic009G097200--Sobic009G097250 Sobic004G181600 Sobic004G181600 Sobic009G097200--Sobic004G181600 Sobic010G256700 Sobic010G256700 Sobic009G097200--Sobic010G256700 Sobic001G268200 Sobic001G268200 Sobic009G097200--Sobic001G268200 Sobic010G239600 Sobic010G239600 Sobic009G097200--Sobic010G239600 Sobic004G317100 Sobic004G317100 Sobic009G097200--Sobic004G317100 Sobic007G193700 Sobic007G193700 Sobic009G097200--Sobic007G193700 Sobic002G115050--Sobic005G075100 Sobic002G115050--Sobic010G141966 Sobic005G093800 Sobic005G093800 Sobic002G115050--Sobic005G093800 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic002G115050--Sobic008G166550 Sobic002G097700 Sobic002G097700 Sobic002G115050--Sobic002G097700 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic002G115050--Sobic002G115075 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G038800 Sobic002G115050--Sobic004G181600 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic002G115050--Sobic003G127001 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic009G053800 Sobic009G053800 Sobic002G175050--Sobic009G053800 Sobic002G175050--Sobic002G115050 Sobic010G141800 Sobic010G141800 Sobic002G175050--Sobic010G141800 Sobic002G175050--Sobic010G141966 Sobic002G175050--Sobic009G097250 Sobic008G027000 Sobic008G027000 Sobic002G175050--Sobic008G027000 Sobic002G175050--Sobic009G097200 Sobic002G175050--Sobic002G097700 Sobic008G122600 Sobic008G122600 Sobic002G175050--Sobic008G122600 Sobic007G083800--Sobic001G268200 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic007G083800--Sobic006G055200 Sobic007G083800--Sobic009G097200 Sobic003G435200 Sobic003G435200 Sobic007G083800--Sobic003G435200 Sobic006G043400 Sobic006G043400 Sobic007G083800--Sobic006G043400 Sobic009G056200 Sobic009G056200 Sobic007G083800--Sobic009G056200 Sobic003G139900 Sobic003G139900 Sobic007G083800--Sobic003G139900 Sobic010G262000 Sobic010G262000 Sobic007G083800--Sobic010G262000 Sobic003G185400 Sobic003G185400 Sobic007G083800--Sobic003G185400 Sobic006G072601--Sobic004G038800 Sobic006G072601--Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic009G121400 Sobic006G072601--Sobic002G115075 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic004G113000 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic006G072601--Sobic007G198400 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic006G072601--Sobic008G105366 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic003G416000 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic006G072601--Sobic005G007000 Sobic010G141966--Sobic010G141800 Sobic010G141966--Sobic002G115050 Sobic010G141966--Sobic005G075100 Sobic009G161550 Sobic009G161550 Sobic010G141966--Sobic009G161550 Sobic010G141966--Sobic002G097700 Sobic006G133900 Sobic006G133900 Sobic010G141966--Sobic006G133900 Sobic010G100516 Sobic010G100516 Sobic010G141966--Sobic010G100516 Sobic010G141966--Sobic010G239600 Sobic002G169400 Sobic002G169400 Sobic010G141966--Sobic002G169400 Sobic004G225200 Sobic004G225200 Sobic003G291200--Sobic004G225200 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic003G291200--Sobic001G000700 Sobic004G261900 Sobic004G261900 Sobic003G291200--Sobic004G261900 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic003G291200--Sobic004G034600 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic003G291200--Sobic001G459600 Sobic004G225100 Sobic004G225100 Sobic003G291200--Sobic004G225100 Sobic001G334600 Sobic001G334600 Sobic003G291200--Sobic001G334600 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic003G291200--Sobic001G496100 Sobic002G113100 Sobic002G113100 Sobic003G291200--Sobic002G113100 Sobic005G075100--Sobic002G115050 Sobic005G075100--Sobic004G181600 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic005G075100--Sobic002G173100 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic005G075100--Sobic002G345700 Sobic003G190000 Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic003G190000 Sobic005G075100--Sobic010G141966 Sobic005G075100--Sobic006G133900 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic005G075100--Sobic006G219600 Sobic005G075100--Sobic009G097200
Octagon: transcription factors


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