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Transcriptome id Sobic.007G083800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PGG8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G268200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G055200 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13192: RNA-binding protein 26
3 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
4 Sobic.003G435200 serine/threonine-protein kinase RIO-like, putative, expressed K07179: RIO kinase 2
5 Sobic.006G043400 - -
6 Sobic.009G056200 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01887: RARS, arginyl-tRNA synthetase
7 Sobic.003G139900 "Highest expression level in embryo, up-regulation in roots in response to exogenous ABA and PEG"(PubMedID : 27501690)@OsSPL1 - SBP-box gene family member, expressed -
8 Sobic.010G262000 tRNA-dihydrouridine synthase, putative, expressed K05542: tRNA-dihydrouridine synthase 1
9 Sobic.003G185400 - -
10 Sobic.010G228400 zinc finger, C3HC4 type, domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G331300 methyltransferase domain containing protein, expressed K15190: MEPCE, 7SK snRNA methylphosphate capping enzyme
12 Sobic.001G107600 - K18328: lariat debranching enzyme
13 Sobic.003G115900 lissencephaly type-1-like homology motif, putative, expressed -
14 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
15 Sobic.002G427050 - -
16 Sobic.010G239600 RNA polymerase I specific transcription initiation factor RRN3 family protein, putative, expressed K15216: RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3
17 Sobic.008G087866 - -
18 Sobic.002G111000 peptidase, putative, expressed -
19 Sobic.010G013200 CPuORF21 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K08829: male germ cell-associated kinase
20 Sobic.003G247500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G083800 Sobic007G083800 Sobic001G268200 Sobic001G268200 Sobic007G083800--Sobic001G268200 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic007G083800--Sobic006G055200 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic007G083800--Sobic009G097200 Sobic003G435200 Sobic003G435200 Sobic007G083800--Sobic003G435200 Sobic006G043400 Sobic006G043400 Sobic007G083800--Sobic006G043400 Sobic009G056200 Sobic009G056200 Sobic007G083800--Sobic009G056200 Sobic003G139900 Sobic003G139900 Sobic007G083800--Sobic003G139900 Sobic010G262000 Sobic010G262000 Sobic007G083800--Sobic010G262000 Sobic003G185400 Sobic003G185400 Sobic007G083800--Sobic003G185400 Sobic001G390800 Sobic001G390800 Sobic001G268200--Sobic001G390800 Sobic010G013200 Sobic010G013200 Sobic001G268200--Sobic010G013200 Sobic010G147100 Sobic010G147100 Sobic001G268200--Sobic010G147100 Sobic003G313500 Sobic003G313500 Sobic001G268200--Sobic003G313500 Sobic001G121200 Sobic001G121200 Sobic001G268200--Sobic001G121200 Sobic010G139600 Sobic010G139600 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Octagon: transcription factors


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