Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G043400.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PK44
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.006G043400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G066500 zinc ion binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.K025800 - -
3 Sobic.004G334300 ATMAK10, putative, expressed -
4 Sobic.003G185400 - -
5 Sobic.010G217600 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G088872 - -
7 Sobic.001G111850 - -
8 Sobic.004G253700 - -
9 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.006G055200 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13192: RNA-binding protein 26
11 Sobic.003G247500 expressed protein -
12 Sobic.003G186000 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -
13 Sobic.006G040500 phospholipid-transporting ATPase 2, putative, expressed K01530: phospholipid-translocating ATPase
14 Sobic.006G247900 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01952: PFAS, phosphoribosylformylglycinamidine synthase
15 Sobic.004G005100 peptidase family C78 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G319900 expressed protein K05310: PIGG, ethanolamine phosphate transferase 2 subunit G
17 Sobic.003G171500 dnaJ domain containing protein, expressed -
18 Sobic.010G169600 OsCML2 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed -
19 Sobic.001G519900 ribonuclease protein, putative, expressed K12585: DIS3, exosome complex exonuclease DIS3/RRP44
20 Sobic.010G055700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase


Gene co-expression network
sample Sobic006G043400 Sobic006G043400 Sobic001G066500 Sobic001G066500 Sobic006G043400--Sobic001G066500 SobicK025800 SobicK025800 Sobic006G043400--SobicK025800 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic006G043400--Sobic004G334300 Sobic003G185400 Sobic003G185400 Sobic006G043400--Sobic003G185400 Sobic010G217600 Sobic010G217600 Sobic006G043400--Sobic010G217600 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic006G043400--Sobic008G088872 Sobic001G111850 Sobic001G111850 Sobic006G043400--Sobic001G111850 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic006G043400--Sobic004G253700 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic006G043400--Sobic007G010700 Sobic001G066500--Sobic006G043400 Sobic001G066500--Sobic003G185400 Sobic001G066500--Sobic010G217600 Sobic001G066500--Sobic004G334300 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic001G066500--Sobic001G519900 Sobic010G102600 Sobic010G102600 Sobic001G066500--Sobic010G102600 Sobic001G066500--Sobic004G253700 Sobic001G066500--SobicK025800 Sobic010G169600 Sobic010G169600 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Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic005G089400
Octagon: transcription factors


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