Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G185400.2,Sobic.003G185400.4,Sobic.003G185400.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXZ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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1 Sobic.001G066500 zinc ion binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G331300 methyltransferase domain containing protein, expressed K15190: MEPCE, 7SK snRNA methylphosphate capping enzyme
3 Sobic.004G263600 - K03655: ATP-dependent DNA helicase RecG
4 Sobic.006G043400 - -
5 Sobic.001G016700 ion channel DMI1-like, chloroplast precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G102600 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.010G003400 - K12598: MTR4, ATP-dependent RNA helicase DOB1
8 Sobic.004G174200 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
9 Sobic.008G087866 - -
10 Sobic.009G056200 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed K01887: RARS, arginyl-tRNA synthetase
11 Sobic.007G103100 SWP, putative, expressed K15156: MED14, mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
12 Sobic.003G112800 T-complex protein, putative, expressed K09494: T-complex protein 1 subunit beta
13 Sobic.003G032700 - -
14 Sobic.006G055200 RNA-binding motif protein, putative, expressed K13192: RNA-binding protein 26
15 Sobic.010G262500 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
16 Sobic.001G542500 1,3-beta-glucan synthase component domain containing protein, expressed K11000: callose synthase
17 Sobic.003G110000 TBC domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G247300 protein of unknown function DUF1296 domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G194200 diacylglycerol kinase, putative, expressed -
20 Sobic.004G276400 expressed protein K11320: E1A-binding protein p400


Gene co-expression network
sample Sobic003G185400 Sobic003G185400 Sobic001G066500 Sobic001G066500 Sobic003G185400--Sobic001G066500 Sobic003G331300 Sobic003G331300 Sobic003G185400--Sobic003G331300 Sobic004G263600 Sobic004G263600 Sobic003G185400--Sobic004G263600 Sobic006G043400 Sobic006G043400 Sobic003G185400--Sobic006G043400 Sobic001G016700 Sobic001G016700 Sobic003G185400--Sobic001G016700 Sobic010G102600 Sobic010G102600 Sobic003G185400--Sobic010G102600 Sobic010G003400 Sobic010G003400 Sobic003G185400--Sobic010G003400 Sobic004G174200 Sobic004G174200 Sobic003G185400--Sobic004G174200 Sobic008G087866 Sobic008G087866 Sobic003G185400--Sobic008G087866 Sobic001G066500--Sobic006G043400 Sobic001G066500--Sobic003G185400 Sobic010G217600 Sobic010G217600 Sobic001G066500--Sobic010G217600 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic001G066500--Sobic004G334300 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic001G066500--Sobic001G519900 Sobic001G066500--Sobic010G102600 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic001G066500--Sobic004G253700 SobicK025800 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Sobic001G370900 Sobic008G087866--Sobic001G370900
Octagon: transcription factors


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