Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K025800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A109ND22
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G043400 - -
2 Sobic.001G066500 zinc ion binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.006G247900 phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed K01952: PFAS, phosphoribosylformylglycinamidine synthase
4 Sobic.010G055700 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed K03217: yidC, spoIIIJ, OXA1, YidC/Oxa1 family membrane protein insertase
5 Sobic.008G014801 - -
6 Sobic.003G032700 - -
7 Sobic.003G171500 dnaJ domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G102600 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.001G111850 - -
10 Sobic.004G319900 expressed protein K05310: PIGG, ethanolamine phosphate transferase 2 subunit G
11 Sobic.002G171300 - -
12 Sobic.008G088872 - -
13 Sobic.002G235200 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.010G127100 - -
15 Sobic.006G086600 IKI3 family protein, expressed K11373: ELP1, IKI3, elongator complex protein 1
16 Sobic.004G277200 GPI transamidase subunit PIG-U domain containing protein, expressed K05293: GPI-anchor transamidase subunit U
17 Sobic.001G407700 leucyl-tRNA synthetase, cytoplasmic, putative, expressed K01869: LARS, leucyl-tRNA synthetase
18 Sobic.007G207200 phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain, putative, expressed K01890: FARSB, phenylalanyl-tRNA synthetase beta chain
19 Sobic.005G162500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, putative, expressed K11838: USP7, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7
20 Sobic.003G441900 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample SobicK025800 SobicK025800 Sobic006G043400 Sobic006G043400 SobicK025800--Sobic006G043400 Sobic001G066500 Sobic001G066500 SobicK025800--Sobic001G066500 Sobic006G247900 Sobic006G247900 SobicK025800--Sobic006G247900 Sobic010G055700 Sobic010G055700 SobicK025800--Sobic010G055700 Sobic008G014801 Sobic008G014801 SobicK025800--Sobic008G014801 Sobic003G032700 Sobic003G032700 SobicK025800--Sobic003G032700 Sobic003G171500 Sobic003G171500 SobicK025800--Sobic003G171500 Sobic010G102600 Sobic010G102600 SobicK025800--Sobic010G102600 Sobic001G111850 Sobic001G111850 SobicK025800--Sobic001G111850 Sobic006G043400--Sobic001G066500 Sobic006G043400--SobicK025800 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic006G043400--Sobic004G334300 Sobic003G185400 Sobic003G185400 Sobic006G043400--Sobic003G185400 Sobic010G217600 Sobic010G217600 Sobic006G043400--Sobic010G217600 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic006G043400--Sobic008G088872 Sobic006G043400--Sobic001G111850 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic006G043400--Sobic004G253700 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic006G043400--Sobic007G010700 Sobic001G066500--Sobic006G043400 Sobic001G066500--Sobic003G185400 Sobic001G066500--Sobic010G217600 Sobic001G066500--Sobic004G334300 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic001G066500--Sobic001G519900 Sobic001G066500--Sobic010G102600 Sobic001G066500--Sobic004G253700 Sobic001G066500--SobicK025800 Sobic010G169600 Sobic010G169600 Sobic001G066500--Sobic010G169600 Sobic004G135400 Sobic004G135400 Sobic006G247900--Sobic004G135400 Sobic003G014500 Sobic003G014500 Sobic006G247900--Sobic003G014500 Sobic008G167800 Sobic008G167800 Sobic006G247900--Sobic008G167800 Sobic001G110600 Sobic001G110600 Sobic006G247900--Sobic001G110600 Sobic006G247900--SobicK025800 Sobic006G086600 Sobic006G086600 Sobic006G247900--Sobic006G086600 Sobic003G279900 Sobic003G279900 Sobic006G247900--Sobic003G279900 Sobic001G447300 Sobic001G447300 Sobic006G247900--Sobic001G447300 Sobic010G205200 Sobic010G205200 Sobic006G247900--Sobic010G205200 Sobic010G003400 Sobic010G003400 Sobic010G055700--Sobic010G003400 Sobic010G055700--Sobic006G086600 Sobic003G146600 Sobic003G146600 Sobic010G055700--Sobic003G146600 Sobic010G059500 Sobic010G059500 Sobic010G055700--Sobic010G059500 Sobic002G235200 Sobic002G235200 Sobic010G055700--Sobic002G235200 Sobic001G401500 Sobic001G401500 Sobic010G055700--Sobic001G401500 Sobic008G160000 Sobic008G160000 Sobic010G055700--Sobic008G160000 Sobic008G051200 Sobic008G051200 Sobic010G055700--Sobic008G051200 Sobic001G145400 Sobic001G145400 Sobic010G055700--Sobic001G145400 Sobic008G014801--Sobic010G102600 Sobic001G052400 Sobic001G052400 Sobic008G014801--Sobic001G052400 Sobic001G376900 Sobic001G376900 Sobic008G014801--Sobic001G376900 Sobic003G441900 Sobic003G441900 Sobic008G014801--Sobic003G441900 Sobic004G320500 Sobic004G320500 Sobic008G014801--Sobic004G320500 Sobic008G014801--Sobic003G032700 Sobic001G455600 Sobic001G455600 Sobic008G014801--Sobic001G455600 Sobic008G014801--Sobic003G171500 Sobic008G063300 Sobic008G063300 Sobic008G014801--Sobic008G063300 Sobic001G089600 Sobic001G089600 Sobic003G032700--Sobic001G089600 Sobic003G032700--Sobic003G171500 Sobic003G166750 Sobic003G166750 Sobic003G032700--Sobic003G166750 Sobic004G089000 Sobic004G089000 Sobic003G032700--Sobic004G089000 Sobic006G216100 Sobic006G216100 Sobic003G032700--Sobic006G216100 Sobic010G115400 Sobic010G115400 Sobic003G032700--Sobic010G115400 Sobic003G032700--Sobic010G102600 Sobic003G095900 Sobic003G095900 Sobic003G032700--Sobic003G095900 Sobic003G032700--Sobic001G111850 Sobic006G055200 Sobic006G055200 Sobic003G171500--Sobic006G055200 Sobic003G171500--Sobic006G086600 Sobic007G207200 Sobic007G207200 Sobic003G171500--Sobic007G207200 Sobic002G317200 Sobic002G317200 Sobic003G171500--Sobic002G317200 Sobic005G160100 Sobic005G160100 Sobic003G171500--Sobic005G160100 Sobic007G220300 Sobic007G220300 Sobic003G171500--Sobic007G220300 Sobic003G171500--Sobic003G032700 Sobic001G020000 Sobic001G020000 Sobic003G171500--Sobic001G020000 Sobic004G131300 Sobic004G131300 Sobic003G171500--Sobic004G131300 Sobic010G102600--Sobic008G014801 Sobic010G102600--Sobic001G089600 Sobic010G102600--Sobic004G320500 Sobic001G453400 Sobic001G453400 Sobic010G102600--Sobic001G453400 Sobic001G493700 Sobic001G493700 Sobic010G102600--Sobic001G493700 Sobic005G122700 Sobic005G122700 Sobic010G102600--Sobic005G122700 Sobic010G102600--Sobic010G115400 Sobic010G102600--Sobic010G003400 Sobic010G102600--Sobic003G166750 Sobic001G111850--Sobic003G166750 Sobic009G165700 Sobic009G165700 Sobic001G111850--Sobic009G165700 Sobic001G439300 Sobic001G439300 Sobic001G111850--Sobic001G439300 Sobic008G001200 Sobic008G001200 Sobic001G111850--Sobic008G001200 Sobic009G256400 Sobic009G256400 Sobic001G111850--Sobic009G256400 Sobic001G433800 Sobic001G433800 Sobic001G111850--Sobic001G433800 Sobic001G370900 Sobic001G370900 Sobic001G111850--Sobic001G370900 Sobic010G123600 Sobic010G123600 Sobic001G111850--Sobic010G123600 Sobic002G042600 Sobic002G042600 Sobic001G111850--Sobic002G042600
Octagon: transcription factors


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