Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G072601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RCP4
Pfam -
Panther DB PTHR33065 PTHR33065:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g07160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7B02G132200 , TraesCS7B02G132200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
3 Sobic.009G121400 - -
4 Sobic.002G115075 - -
5 Sobic.004G113000 - -
6 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
7 Sobic.008G105366 - -
8 Sobic.003G416000 - -
9 Sobic.005G007000 - -
10 Sobic.003G080700 Ser/Thr protein kinase, putative, expressed -
11 Sobic.002G115050 - -
12 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
13 Sobic.004G143475 - -
14 Sobic.006G112200 - -
15 Sobic.003G317500 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase
16 Sobic.002G017500 expressed protein -
17 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
18 Sobic.004G044900 DNA binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G149200 ABC1 family domain containing protein, putative, expressed K08869: ADCK, aarF domain-containing kinase
20 Sobic.005G133600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic006G072601--Sobic004G038800 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic001G333300 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic006G072601--Sobic009G121400 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic002G115075 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic004G113000 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic006G072601--Sobic007G198400 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic006G072601--Sobic008G105366 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic003G416000 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic006G072601--Sobic005G007000 Sobic004G038800--Sobic006G072601 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic004G038800--Sobic002G115050 Sobic001G303100 Sobic001G303100 Sobic004G038800--Sobic001G303100 Sobic010G131700 Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic002G115075 Sobic001G381600 Sobic001G381600 Sobic004G038800--Sobic001G381600 Sobic010G033100 Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic007G198400 Sobic007G106800 Sobic007G106800 Sobic004G038800--Sobic007G106800 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic009G121400--Sobic006G072601 Sobic009G121400--Sobic004G113000 Sobic009G121400--Sobic001G333300 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic008G105366 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic007G010700 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic003G416000 Sobic002G115075--Sobic002G115050 Sobic002G345700 Sobic002G345700 Sobic002G115075--Sobic002G345700 Sobic002G115075--Sobic006G072601 Sobic002G173100 Sobic002G173100 Sobic002G115075--Sobic002G173100 Sobic004G207400 Sobic004G207400 Sobic002G115075--Sobic004G207400 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic002G115075--Sobic002G244200 Sobic005G142800 Sobic005G142800 Sobic002G115075--Sobic005G142800 Sobic005G075100 Sobic005G075100 Sobic002G115075--Sobic005G075100 Sobic003G264800 Sobic003G264800 Sobic002G115075--Sobic003G264800 Sobic004G113000--Sobic006G072601 Sobic004G113000--Sobic008G105366 Sobic004G113000--Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic009G121400 Sobic004G113000--Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic004G038800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G113000--Sobic001G459600 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic004G113000--Sobic008G166550 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic004G113000--Sobic008G084300 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic007G198400--Sobic007G141380 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic001G227900 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic006G072601 Sobic007G198400--Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic008G105366 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic007G198400--Sobic007G202300 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic003G416000 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic004G113000 Sobic008G105366--Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic006G072601 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic007G198400 Sobic008G105366--Sobic001G459600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic009G121400 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic005G007000--Sobic004G113000 Sobic005G007000--Sobic006G072601 Sobic005G007000--Sobic008G105366 Sobic005G007000--Sobic009G121400 Sobic005G007000--Sobic007G198400 Sobic005G007000--Sobic004G038800 Sobic005G007000--Sobic009G260350 Sobic005G007000--Sobic004G230700 Sobic005G007000--Sobic001G333300
Octagon: transcription factors


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