Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G333300.1,Sobic.001G333300.3,Sobic.001G333300.2
Synonym Sb01g032190, EDL1
Functional annotation circadian clock coupling factor-related, putative, expressed
UniProt C5WWH6
Pfam -
Panther DB PTHR31348 PTHR31348:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15440 : EID1-like 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g31310.2,LOC_Os03g31310.1 : circadian clock coupling factor-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002914
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G001200 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08515: vesicle-associated membrane protein 7
2 Sobic.006G072601 - -
3 Sobic.009G121400 - -
4 Sobic.003G127001 - -
5 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
7 Sobic.001G479100 ORC2 - Putative origin recognition complex subunit 2, expressed K02604: origin recognition complex subunit 2
8 Sobic.009G097200 saposin-like type B, region 1 family protein, putative, expressed K12382: PSAP, saposin
9 Sobic.003G434900 copine, putative, expressed K16280: E3 ubiquitin-protein ligase RGLG
10 Sobic.002G115075 - -
11 Sobic.009G097250 - -
12 Sobic.003G317500 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase
13 Sobic.003G416000 - -
14 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.002G115050 - -
16 Sobic.002G244200 nucleolar GTP-binding protein 1, putative, expressed -
17 Sobic.008G084300 - -
18 Sobic.001G236700 programmed cell death protein 2, putative, expressed -
19 Sobic.003G139800 protein kinase, putative, expressed K13436: pto-interacting protein 1
20 Sobic.001G459600 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900 Sobic007G001200--Sobic001G333300 Sobic007G001500 Sobic007G001500 Sobic007G001200--Sobic007G001500 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic007G001200--Sobic003G317500 Sobic010G147000 Sobic010G147000 Sobic007G001200--Sobic010G147000 Sobic007G165600 Sobic007G165600 Sobic007G001200--Sobic007G165600 Sobic009G056200 Sobic009G056200 Sobic007G001200--Sobic009G056200 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Octagon: transcription factors


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