Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G007000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PPI6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G113000 - -
2 Sobic.006G072601 - -
3 Sobic.008G105366 - -
4 Sobic.009G121400 - -
5 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.009G260350 - -
8 Sobic.004G230700 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
10 Sobic.003G258300 beclin-1, putative, expressed K08334: BECN, VPS30, beclin
11 Sobic.004G253700 - -
12 Sobic.006G112200 - -
13 Sobic.004G044900 DNA binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.007G141380 - -
16 Sobic.004G010151 - -
17 Sobic.009G055200 membrane protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G124200 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
19 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase
20 Sobic.007G198700 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic005G007000--Sobic004G113000 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic005G007000--Sobic006G072601 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic005G007000--Sobic008G105366 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic005G007000--Sobic009G121400 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic005G007000--Sobic007G198400 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic005G007000--Sobic004G038800 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic005G007000--Sobic009G260350 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic005G007000--Sobic004G230700 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic005G007000--Sobic001G333300 Sobic004G113000--Sobic006G072601 Sobic004G113000--Sobic008G105366 Sobic004G113000--Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic009G121400 Sobic004G113000--Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic004G038800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G113000--Sobic001G459600 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic004G113000--Sobic008G166550 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic004G113000--Sobic008G084300 Sobic006G072601--Sobic004G038800 Sobic006G072601--Sobic001G333300 Sobic006G072601--Sobic009G121400 Sobic002G115075 Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic002G115075 Sobic006G072601--Sobic004G113000 Sobic006G072601--Sobic007G198400 Sobic006G072601--Sobic008G105366 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic003G416000 Sobic006G072601--Sobic005G007000 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic004G113000 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic006G072601 Sobic008G105366--Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic007G198400 Sobic008G105366--Sobic001G459600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic009G121400 Sobic009G121400--Sobic006G072601 Sobic009G121400--Sobic004G113000 Sobic009G121400--Sobic001G333300 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic008G105366 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic004G334300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic009G121400--Sobic007G010700 Sobic009G121400--Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic003G416000 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic007G198400--Sobic007G141380 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic006G072601 Sobic007G198400--Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic008G105366 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic007G198400--Sobic007G202300 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic003G416000 Sobic004G038800--Sobic006G072601 Sobic002G115050 Sobic002G115050 Sobic004G038800--Sobic002G115050 Sobic001G303100 Sobic001G303100 Sobic004G038800--Sobic001G303100 Sobic010G131700 Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic010G131700 Sobic004G038800--Sobic002G115075 Sobic001G381600 Sobic001G381600 Sobic004G038800--Sobic001G381600 Sobic010G033100 Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic010G033100 Sobic004G038800--Sobic007G198400 Sobic007G106800 Sobic007G106800 Sobic004G038800--Sobic007G106800 Sobic009G260350--Sobic008G105366 Sobic009G260350--Sobic004G230700 Sobic010G057666 Sobic010G057666 Sobic009G260350--Sobic010G057666 Sobic009G260350--Sobic007G141380 Sobic009G260350--Sobic010G033100 Sobic009G260350--Sobic007G198400 Sobic009G260350--Sobic004G038800 Sobic009G260350--Sobic005G007000 Sobic009G260350--Sobic006G072601 Sobic004G230700--Sobic007G141380 Sobic004G230700--Sobic007G198400 Sobic004G230700--Sobic009G260350 Sobic004G230700--Sobic010G057666 Sobic004G230700--Sobic010G033100 Sobic004G230700--Sobic006G072601 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic004G230700--Sobic002G408100 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic004G230700--Sobic002G022100 Sobic004G230700--Sobic008G105366 Sobic007G001200 Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic007G001200 Sobic001G333300--Sobic006G072601 Sobic001G333300--Sobic009G121400 Sobic003G127001 Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic003G127001 Sobic001G333300--Sobic004G038800 Sobic001G333300--Sobic007G010700 Sobic001G479100 Sobic001G479100 Sobic001G333300--Sobic001G479100 Sobic009G097200 Sobic009G097200 Sobic001G333300--Sobic009G097200 Sobic003G434900 Sobic003G434900 Sobic001G333300--Sobic003G434900
Octagon: transcription factors


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