Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G061900.1
Synonym
Functional annotation AT hook motif domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PKI1
Pfam -
Panther DB PTHR31500:SF16 PTHR31500
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33620 : AT hook motif DNA-binding family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g42230.3 : AT hook motif domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G221250 - -
2 Sobic.003G069875 - -
3 Sobic.004G038800 OsFBX188 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G333300 circadian clock coupling factor-related, putative, expressed -
5 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.003G317500 acyltransferase, putative, expressed K13513: LCLAT1, lysocardiolipin and lysophospholipid acyltransferase
7 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
8 Sobic.005G150350 - -
9 Sobic.001G459600 expressed protein -
10 Sobic.010G262500 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
11 Sobic.010G057633 - K13993: HSP20 family protein
12 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.003G127001 - -
14 Sobic.007G060000 octicosapeptide/Phox/Bem1p, putative, expressed -
15 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
16 Sobic.001G227900 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@two-component response regulator, putative, expressed K14491: two-component response regulator ARR-B family
17 Sobic.010G033100 - -
18 Sobic.004G113000 - -
19 Sobic.009G139000 - -
20 Sobic.003G164950 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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