Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G057633.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt -
Pfam PF00011
Panther DB PTHR11527 PTHR11527:SF166
NCBI CDD -
KEGG Orthology K13993; HSP20 family protein
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G51440 : HSP20-like chaperones superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g11610.1 : heat shock 22 kDa protein, mitochondrial precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a049511 , Zm00025a033133
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G179600 , TraesCS7B02G083500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
2 Sobic.001G000501 - -
3 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
4 Sobic.001G236700 programmed cell death protein 2, putative, expressed -
5 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
6 Sobic.009G098200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
7 Sobic.001G000700 glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
8 Sobic.002G418800 - -
9 Sobic.001G459600 expressed protein -
10 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G253700 - -
13 Sobic.004G070500 expressed protein -
14 Sobic.009G121400 - -
15 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
16 Sobic.002G122200 - -
17 Sobic.001G000300 - -
18 Sobic.001G504900 pheophorbide a oxygenase, chloroplast precursor, putative, expressed K13071: PAO, pheophorbide a oxygenase
19 Sobic.008G089800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G252000 uridylyltransferase-related, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic010G057633--Sobic007G010700 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic010G057633--Sobic001G000501 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic010G057633--Sobic005G095660 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic010G057633--Sobic001G236700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic010G057633--Sobic005G053200 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic010G057633--Sobic009G098200 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic010G057633--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic010G057633--Sobic002G418800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic010G057633--Sobic001G459600 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic005G053200 Sobic007G010700--Sobic001G000501 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic007G010700--Sobic004G253700 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic004G034600 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic007G010700--Sobic005G133600 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic003G061200 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic007G010700--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic001G459600 Sobic001G000501--Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic007G010700 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic001G000501--Sobic008G084300 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic004G034600 Sobic001G000501--Sobic005G053200 Sobic001G000501--Sobic004G253700 Sobic002G122200 Sobic002G122200 Sobic005G095660--Sobic002G122200 Sobic001G248200 Sobic001G248200 Sobic005G095660--Sobic001G248200 Sobic005G095660--Sobic010G057633 Sobic005G095660--Sobic002G249300 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic005G095660--Sobic001G000300 Sobic005G095660--Sobic007G010700 Sobic005G095660--Sobic001G459600 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic005G095660--Sobic003G174400 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic005G095660--Sobic008G081800 Sobic001G236700--Sobic004G070500 Sobic001G236700--Sobic004G034600 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic001G236700--Sobic008G089800 Sobic001G236700--Sobic010G057633 Sobic001G236700--Sobic007G010700 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic001G236700--Sobic001G333300 Sobic001G236700--Sobic002G249300 Sobic009G101800 Sobic009G101800 Sobic001G236700--Sobic009G101800 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic001G236700--Sobic008G105366 Sobic005G053200--Sobic007G010700 Sobic005G053200--Sobic004G070500 Sobic005G053200--Sobic002G249300 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic001G000501 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G053200--Sobic009G248801 Sobic005G053200--Sobic005G133600 Sobic010G227800 Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic005G089400 Sobic009G098200--Sobic001G459600 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic009G098200--Sobic003G317500 Sobic009G098200--Sobic002G418800 Sobic004G175400 Sobic004G175400 Sobic009G098200--Sobic004G175400 Sobic009G098200--Sobic001G000501 Sobic001G517800 Sobic001G517800 Sobic009G098200--Sobic001G517800 Sobic009G098200--Sobic001G000700 Sobic009G098200--Sobic010G057633 Sobic009G098200--Sobic009G248801 Sobic001G000700--Sobic001G000501 Sobic001G000700--Sobic001G459600 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic001G000700--Sobic001G496100 Sobic001G000700--Sobic005G089400 Sobic001G000700--Sobic001G517800 Sobic003G291200 Sobic003G291200 Sobic001G000700--Sobic003G291200 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic001G000700--Sobic001G233300 Sobic001G000700--Sobic005G149700 Sobic001G000700--Sobic004G034600 Sobic002G418800--Sobic001G459600 Sobic002G418800--Sobic001G000501 Sobic002G418800--Sobic005G089400 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic002G418800--Sobic008G166550 Sobic002G418800--Sobic004G034600 Sobic002G418800--Sobic001G517800 Sobic002G418800--Sobic009G098200 Sobic002G418800--Sobic009G101800 Sobic002G418800--Sobic004G175400 Sobic001G459600--Sobic001G517800 Sobic001G459600--Sobic001G000501 Sobic001G459600--Sobic004G034600 Sobic001G459600--Sobic001G000700 Sobic001G459600--Sobic002G418800 Sobic001G459600--Sobic008G084300 Sobic001G459600--Sobic008G166550 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic001G223550 Sobic001G459600--Sobic005G133600
Octagon: transcription factors


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