Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G122200.2,Sobic.002G122200.3
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QAR4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
2 Sobic.007G213925 - -
3 Sobic.003G174400 - -
4 Sobic.005G150400 - -
5 Sobic.001G248200 OsPOP22 - Putative Prolyl Oligopeptidase homologue, expressed K01303: acylaminoacyl-peptidase
6 Sobic.010G057633 - K13993: HSP20 family protein
7 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
8 Sobic.002G190500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
9 Sobic.001G542150 - -
10 Sobic.001G000300 - -
11 Sobic.001G236700 programmed cell death protein 2, putative, expressed -
12 Sobic.002G153200 - -
13 Sobic.007G053900 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G143766 - -
15 Sobic.007G079000 exonuclease, putative, expressed -
16 Sobic.001G176501 - -
17 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
19 Sobic.001G233300 - -
20 Sobic.001G000501 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G122200 Sobic002G122200 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic002G122200--Sobic005G095660 Sobic007G213925 Sobic007G213925 Sobic002G122200--Sobic007G213925 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic002G122200--Sobic003G174400 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic002G122200--Sobic005G150400 Sobic001G248200 Sobic001G248200 Sobic002G122200--Sobic001G248200 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic002G122200--Sobic010G057633 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic002G122200--Sobic002G249300 Sobic002G190500 Sobic002G190500 Sobic002G122200--Sobic002G190500 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G122200--Sobic001G542150 Sobic005G095660--Sobic002G122200 Sobic005G095660--Sobic001G248200 Sobic005G095660--Sobic010G057633 Sobic005G095660--Sobic002G249300 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic005G095660--Sobic001G000300 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G095660--Sobic007G010700 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic005G095660--Sobic001G459600 Sobic005G095660--Sobic003G174400 Sobic008G081800 Sobic008G081800 Sobic005G095660--Sobic008G081800 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic007G213925--Sobic001G176501 Sobic007G213925--Sobic002G190500 Sobic007G213925--Sobic002G122200 Sobic002G324000 Sobic002G324000 Sobic007G213925--Sobic002G324000 Sobic001G182500 Sobic001G182500 Sobic007G213925--Sobic001G182500 Sobic007G213925--Sobic003G174400 Sobic007G079000 Sobic007G079000 Sobic007G213925--Sobic007G079000 Sobic008G182700 Sobic008G182700 Sobic007G213925--Sobic008G182700 Sobic005G130400 Sobic005G130400 Sobic007G213925--Sobic005G130400 Sobic003G174400--Sobic001G176501 Sobic003G174400--Sobic002G249300 Sobic003G174400--Sobic001G459600 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic003G174400--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic003G174400--Sobic005G149700 Sobic010G135900 Sobic010G135900 Sobic003G174400--Sobic010G135900 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic003G174400--Sobic001G000501 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic003G174400--Sobic003G174301 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic003G174400--Sobic001G496100 Sobic007G185300 Sobic007G185300 Sobic005G150400--Sobic007G185300 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic005G150400--Sobic005G133600 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic005G150400--Sobic009G248801 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic005G150400--Sobic003G232001 Sobic005G150400--Sobic007G010700 Sobic001G519900 Sobic001G519900 Sobic005G150400--Sobic001G519900 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic005G150400--Sobic007G090403 Sobic003G179350 Sobic003G179350 Sobic005G150400--Sobic003G179350 Sobic005G150400--Sobic001G542150 Sobic001G248200--Sobic005G095660 Sobic006G030600 Sobic006G030600 Sobic001G248200--Sobic006G030600 Sobic001G396000 Sobic001G396000 Sobic001G248200--Sobic001G396000 Sobic010G203200 Sobic010G203200 Sobic001G248200--Sobic010G203200 Sobic001G248200--Sobic004G034600 Sobic001G248200--Sobic008G081800 Sobic004G131040 Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic004G131040 Sobic001G248200--Sobic007G010700 Sobic001G248300 Sobic001G248300 Sobic001G248200--Sobic001G248300 Sobic010G057633--Sobic007G010700 Sobic010G057633--Sobic001G000501 Sobic010G057633--Sobic005G095660 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic010G057633--Sobic001G236700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic010G057633--Sobic005G053200 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic010G057633--Sobic009G098200 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic010G057633--Sobic001G000700 Sobic002G418800 Sobic002G418800 Sobic010G057633--Sobic002G418800 Sobic010G057633--Sobic001G459600 Sobic002G249300--Sobic004G034600 Sobic002G249300--Sobic003G174301 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic005G149700 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic009G011600 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic002G249300--Sobic001G233300 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic007G010700 Sobic002G190500--Sobic002G324000 Sobic004G113300 Sobic004G113300 Sobic002G190500--Sobic004G113300 Sobic002G190500--Sobic005G130400 Sobic004G050200 Sobic004G050200 Sobic002G190500--Sobic004G050200 Sobic003G184900 Sobic003G184900 Sobic002G190500--Sobic003G184900 Sobic004G345800 Sobic004G345800 Sobic002G190500--Sobic004G345800 Sobic004G321800 Sobic004G321800 Sobic002G190500--Sobic004G321800 Sobic007G216201 Sobic007G216201 Sobic002G190500--Sobic007G216201 Sobic008G079300 Sobic008G079300 Sobic002G190500--Sobic008G079300 Sobic001G542150--Sobic001G233300 Sobic002G153200 Sobic002G153200 Sobic001G542150--Sobic002G153200 Sobic002G143766 Sobic002G143766 Sobic001G542150--Sobic002G143766 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic001G542150--Sobic009G007200 Sobic001G542150--Sobic001G176501 Sobic001G542150--Sobic003G174400 Sobic001G542150--Sobic002G249300 Sobic004G057500 Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic004G057500 Sobic001G542150--Sobic005G150400
Octagon: transcription factors


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