Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G053900.1
Synonym
Functional annotation ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PFR2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g24954.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G174400 - -
2 Sobic.001G176501 - -
3 Sobic.007G079000 exonuclease, putative, expressed -
4 Sobic.002G122200 - -
5 Sobic.007G213925 - -
6 Sobic.003G180600 - -
7 Sobic.001G419600 DnaK family protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G249300 auxin efflux carrier component, putative, expressed -
9 Sobic.007G098800 formamidopyrimidine-DNA glycosylase, putative, expressed K10563: mutM, formamidopyrimidine-DNA glycosylase
10 Sobic.003G232001 - -
11 Sobic.002G190500 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
12 Sobic.005G081900 - -
13 Sobic.005G095660 - K04733: interleukin-1 receptor-associated kinase 4
14 Sobic.007G095300 cbbY protein-related, putative, expressed -
15 Sobic.002G027232 - -
16 Sobic.003G174301 - -
17 Sobic.001G000501 - -
18 Sobic.002G171101 - -
19 Sobic.005G130400 terpene synthase, putative, expressed K15803: (-)-germacrene D synthase
20 Sobic.010G135900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G053900 Sobic007G053900 Sobic003G174400 Sobic003G174400 Sobic007G053900--Sobic003G174400 Sobic001G176501 Sobic001G176501 Sobic007G053900--Sobic001G176501 Sobic007G079000 Sobic007G079000 Sobic007G053900--Sobic007G079000 Sobic002G122200 Sobic002G122200 Sobic007G053900--Sobic002G122200 Sobic007G213925 Sobic007G213925 Sobic007G053900--Sobic007G213925 Sobic003G180600 Sobic003G180600 Sobic007G053900--Sobic003G180600 Sobic001G419600 Sobic001G419600 Sobic007G053900--Sobic001G419600 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic007G053900--Sobic002G249300 Sobic007G098800 Sobic007G098800 Sobic007G053900--Sobic007G098800 Sobic003G174400--Sobic001G176501 Sobic003G174400--Sobic002G249300 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic003G174400--Sobic001G459600 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic003G174400--Sobic004G034600 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic003G174400--Sobic005G149700 Sobic010G135900 Sobic010G135900 Sobic003G174400--Sobic010G135900 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic003G174400--Sobic001G000501 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic003G174400--Sobic003G174301 Sobic001G496100 Sobic001G496100 Sobic003G174400--Sobic001G496100 Sobic001G176501--Sobic003G174400 Sobic001G176501--Sobic002G249300 Sobic001G176501--Sobic010G135900 Sobic001G176501--Sobic001G496100 Sobic001G176501--Sobic003G174301 Sobic001G176501--Sobic004G034600 Sobic009G006400 Sobic009G006400 Sobic001G176501--Sobic009G006400 Sobic001G176501--Sobic001G000501 Sobic001G176501--Sobic005G149700 Sobic007G079000--Sobic003G174301 Sobic007G079000--Sobic002G249300 Sobic002G169900 Sobic002G169900 Sobic007G079000--Sobic002G169900 Sobic009G016600 Sobic009G016600 Sobic007G079000--Sobic009G016600 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic007G079000--Sobic007G010700 Sobic010G192800 Sobic010G192800 Sobic007G079000--Sobic010G192800 Sobic001G252000 Sobic001G252000 Sobic007G079000--Sobic001G252000 Sobic007G079000--Sobic007G213925 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic007G079000--Sobic005G053200 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic002G122200--Sobic005G095660 Sobic002G122200--Sobic007G213925 Sobic002G122200--Sobic003G174400 Sobic005G150400 Sobic005G150400 Sobic002G122200--Sobic005G150400 Sobic001G248200 Sobic001G248200 Sobic002G122200--Sobic001G248200 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic002G122200--Sobic010G057633 Sobic002G122200--Sobic002G249300 Sobic002G190500 Sobic002G190500 Sobic002G122200--Sobic002G190500 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic002G122200--Sobic001G542150 Sobic007G213925--Sobic001G176501 Sobic007G213925--Sobic002G190500 Sobic007G213925--Sobic002G122200 Sobic002G324000 Sobic002G324000 Sobic007G213925--Sobic002G324000 Sobic001G182500 Sobic001G182500 Sobic007G213925--Sobic001G182500 Sobic007G213925--Sobic003G174400 Sobic007G213925--Sobic007G079000 Sobic008G182700 Sobic008G182700 Sobic007G213925--Sobic008G182700 Sobic005G130400 Sobic005G130400 Sobic007G213925--Sobic005G130400 Sobic009G007200 Sobic009G007200 Sobic003G180600--Sobic009G007200 Sobic003G232001 Sobic003G232001 Sobic003G180600--Sobic003G232001 Sobic007G095300 Sobic007G095300 Sobic003G180600--Sobic007G095300 Sobic005G081900 Sobic005G081900 Sobic003G180600--Sobic005G081900 Sobic002G027232 Sobic002G027232 Sobic003G180600--Sobic002G027232 Sobic005G077200 Sobic005G077200 Sobic003G180600--Sobic005G077200 Sobic008G029200 Sobic008G029200 Sobic003G180600--Sobic008G029200 Sobic003G180600--Sobic007G098800 Sobic006G037900 Sobic006G037900 Sobic003G180600--Sobic006G037900 Sobic010G024200 Sobic010G024200 Sobic001G419600--Sobic010G024200 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic001G419600--Sobic005G221900 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic001G419600--Sobic004G003600 Sobic001G419600--Sobic007G095300 Sobic001G419600--Sobic003G232001 Sobic001G419600--Sobic003G180600 Sobic005G205200 Sobic005G205200 Sobic001G419600--Sobic005G205200 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic001G419600--Sobic005G073800 Sobic010G060800 Sobic010G060800 Sobic001G419600--Sobic010G060800 Sobic002G249300--Sobic004G034600 Sobic002G249300--Sobic003G174301 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic001G223550 Sobic002G249300--Sobic005G149700 Sobic009G011600 Sobic009G011600 Sobic002G249300--Sobic009G011600 Sobic001G233300 Sobic001G233300 Sobic002G249300--Sobic001G233300 Sobic002G249300--Sobic001G252000 Sobic002G249300--Sobic001G496100 Sobic002G249300--Sobic007G010700 Sobic007G098800--Sobic003G180600 Sobic007G098800--Sobic007G095300 Sobic007G098800--Sobic003G232001 Sobic007G098800--Sobic001G419600 Sobic002G296500 Sobic002G296500 Sobic007G098800--Sobic002G296500 Sobic002G171101 Sobic002G171101 Sobic007G098800--Sobic002G171101 Sobic010G163400 Sobic010G163400 Sobic007G098800--Sobic010G163400 Sobic003G234600 Sobic003G234600 Sobic007G098800--Sobic003G234600 Sobic007G098800--Sobic004G003600
Octagon: transcription factors


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