Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G089800.1
Synonym
Functional annotation ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
UniProt C5YNE7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g12480.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G164950 - -
2 Sobic.002G103100 - -
3 Sobic.002G118101 - -
4 Sobic.001G053200 expressed protein -
5 Sobic.001G236700 programmed cell death protein 2, putative, expressed -
6 Sobic.007G061100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
7 Sobic.007G090403 - -
8 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
9 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
10 Sobic.005G133600 - -
11 Sobic.003G418733 - -
12 Sobic.004G070500 expressed protein -
13 Sobic.002G321800 60S ribosomal protein L44, putative, expressed K02929: RP-L44e, large subunit ribosomal protein L44e
14 Sobic.004G034600 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
15 Sobic.010G181100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@FAD binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.008G003300 - -
17 Sobic.009G248801 - -
18 Sobic.001G413000 ABC transporter family protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G175800 acyl-CoA thioesterase 2, putative, expressed K01068: acyl-coenzyme A thioesterase 1/2/4
20 Sobic.002G017500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic008G089800--Sobic003G164950 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic008G089800--Sobic002G103100 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic008G089800--Sobic002G118101 Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic008G089800--Sobic001G053200 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic008G089800--Sobic001G236700 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic008G089800--Sobic007G061100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic008G089800--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic008G089800--Sobic007G010700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic008G089800--Sobic005G053200 Sobic003G164950--Sobic002G103100 Sobic003G164950--Sobic008G089800 Sobic006G056800 Sobic006G056800 Sobic003G164950--Sobic006G056800 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic003G164950--Sobic004G188000 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic003G164950--Sobic002G022100 Sobic001G284475 Sobic001G284475 Sobic003G164950--Sobic001G284475 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic003G164950--Sobic003G418733 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic003G164950--Sobic006G061900 Sobic003G164950--Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic002G118101--Sobic001G053200 Sobic002G321800 Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic008G089800 Sobic008G027200 Sobic008G027200 Sobic002G118101--Sobic008G027200 Sobic004G044900 Sobic004G044900 Sobic002G118101--Sobic004G044900 Sobic007G084300 Sobic007G084300 Sobic002G118101--Sobic007G084300 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic002G118101--Sobic003G080800 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic002G118101--Sobic002G017500 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G118101--Sobic001G413000 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G053200--Sobic004G034600 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic001G053200--Sobic005G133600 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic001G053200--Sobic001G223550 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic001G053200--Sobic003G174301 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic001G053200--Sobic002G249300 Sobic001G053200--Sobic002G321800 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G053200--Sobic005G149700 Sobic006G175800 Sobic006G175800 Sobic001G053200--Sobic006G175800 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic001G053200--Sobic003G160100 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic001G236700--Sobic004G070500 Sobic001G236700--Sobic004G034600 Sobic001G236700--Sobic008G089800 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic001G236700--Sobic010G057633 Sobic001G236700--Sobic007G010700 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic001G236700--Sobic001G333300 Sobic001G236700--Sobic002G249300 Sobic009G101800 Sobic009G101800 Sobic001G236700--Sobic009G101800 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic001G236700--Sobic008G105366 Sobic007G061100--Sobic007G090403 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic007G061100--Sobic002G244200 Sobic001G062900 Sobic001G062900 Sobic007G061100--Sobic001G062900 Sobic007G061100--Sobic003G160100 Sobic007G061100--Sobic001G413000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic007G061100--Sobic004G086150 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic007G061100--Sobic009G248801 Sobic007G061100--Sobic002G017500 Sobic006G225900 Sobic006G225900 Sobic007G061100--Sobic006G225900 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic005G068700 Sobic007G090403--Sobic002G244200 Sobic006G219600 Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic006G219600 Sobic007G090403--Sobic001G062900 Sobic005G149200 Sobic005G149200 Sobic007G090403--Sobic005G149200 Sobic001G133000 Sobic001G133000 Sobic007G090403--Sobic001G133000 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic007G090403--Sobic009G123900 Sobic006G065100 Sobic006G065100 Sobic007G090403--Sobic006G065100 Sobic009G215500 Sobic009G215500 Sobic007G090403--Sobic009G215500 Sobic007G010700--Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic005G053200 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic007G010700--Sobic001G000501 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic007G010700--Sobic004G253700 Sobic007G010700--Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic005G133600 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic007G010700--Sobic005G089400 Sobic005G053200--Sobic007G010700 Sobic005G053200--Sobic004G070500 Sobic005G053200--Sobic002G249300 Sobic005G053200--Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic001G000501 Sobic005G053200--Sobic009G248801 Sobic005G053200--Sobic005G133600 Sobic010G227800 Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic005G089400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.