Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G164950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VXL2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G103100 - -
2 Sobic.008G089800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G056800 - -
4 Sobic.004G188000 histone H3, putative, expressed K11253: histone H3
5 Sobic.002G022100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.001G284475 - -
7 Sobic.003G418733 - -
8 Sobic.006G061900 AT hook motif domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G118101 - -
10 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.007G061100 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@transcription factor, putative, expressed K14431: transcription factor TGA
12 Sobic.001G236700 programmed cell death protein 2, putative, expressed -
13 Sobic.010G057633 - K13993: HSP20 family protein
14 Sobic.005G019500 - -
15 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
16 Sobic.002G016100 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G044900 DNA binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G149600 - -
19 Sobic.006G038951 - -
20 Sobic.002G237900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CSLE6 - cellulose synthase-like family E, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic003G164950--Sobic002G103100 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic003G164950--Sobic008G089800 Sobic006G056800 Sobic006G056800 Sobic003G164950--Sobic006G056800 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic003G164950--Sobic004G188000 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic003G164950--Sobic002G022100 Sobic001G284475 Sobic001G284475 Sobic003G164950--Sobic001G284475 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic003G164950--Sobic003G418733 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic003G164950--Sobic006G061900 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic003G164950--Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic008G089800--Sobic003G164950 Sobic008G089800--Sobic002G103100 Sobic008G089800--Sobic002G118101 Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic008G089800--Sobic001G053200 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic008G089800--Sobic001G236700 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic008G089800--Sobic007G061100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic008G089800--Sobic007G090403 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic008G089800--Sobic007G010700 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic008G089800--Sobic005G053200 Sobic006G056800--Sobic001G284475 Sobic005G060600 Sobic005G060600 Sobic006G056800--Sobic005G060600 Sobic003G181201 Sobic003G181201 Sobic006G056800--Sobic003G181201 Sobic003G252400 Sobic003G252400 Sobic006G056800--Sobic003G252400 Sobic006G056800--Sobic003G164950 Sobic003G251400 Sobic003G251400 Sobic006G056800--Sobic003G251400 Sobic001G086500 Sobic001G086500 Sobic006G056800--Sobic001G086500 Sobic004G211301 Sobic004G211301 Sobic006G056800--Sobic004G211301 Sobic003G397500 Sobic003G397500 Sobic006G056800--Sobic003G397500 Sobic004G188000--Sobic003G164950 Sobic004G213900 Sobic004G213900 Sobic004G188000--Sobic004G213900 Sobic004G188000--Sobic002G103100 Sobic004G185400 Sobic004G185400 Sobic004G188000--Sobic004G185400 Sobic002G237900 Sobic002G237900 Sobic004G188000--Sobic002G237900 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic004G188000--Sobic002G173700 Sobic004G122300 Sobic004G122300 Sobic004G188000--Sobic004G122300 Sobic009G098200 Sobic009G098200 Sobic004G188000--Sobic009G098200 Sobic004G188000--Sobic002G022100 Sobic002G048900 Sobic002G048900 Sobic002G022100--Sobic002G048900 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic002G022100--Sobic007G141380 Sobic002G016100 Sobic002G016100 Sobic002G022100--Sobic002G016100 Sobic002G022100--Sobic002G103100 Sobic002G022100--Sobic003G164950 Sobic002G022100--Sobic007G198400 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic002G022100--Sobic004G230700 Sobic009G185100 Sobic009G185100 Sobic002G022100--Sobic009G185100 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic002G022100--Sobic009G260350 Sobic001G284475--Sobic006G056800 Sobic006G038951 Sobic006G038951 Sobic001G284475--Sobic006G038951 Sobic001G284475--Sobic003G251400 Sobic001G284475--Sobic003G181201 Sobic001G284475--Sobic003G252400 Sobic010G217532 Sobic010G217532 Sobic001G284475--Sobic010G217532 Sobic001G284475--Sobic005G060600 Sobic007G213100 Sobic007G213100 Sobic001G284475--Sobic007G213100 Sobic001G284475--Sobic003G164950 Sobic003G418733--Sobic002G103100 Sobic003G418733--Sobic008G089800 Sobic003G418733--Sobic003G164950 Sobic001G317300 Sobic001G317300 Sobic003G418733--Sobic001G317300 Sobic008G003300 Sobic008G003300 Sobic003G418733--Sobic008G003300 Sobic003G418733--Sobic002G022100 Sobic006G060601 Sobic006G060601 Sobic003G418733--Sobic006G060601 Sobic010G078500 Sobic010G078500 Sobic003G418733--Sobic010G078500 Sobic003G418733--Sobic007G202300 Sobic005G221250 Sobic005G221250 Sobic006G061900--Sobic005G221250 Sobic003G069875 Sobic003G069875 Sobic006G061900--Sobic003G069875 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic006G061900--Sobic004G038800 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic006G061900--Sobic001G333300 Sobic006G061900--Sobic007G010700 Sobic003G317500 Sobic003G317500 Sobic006G061900--Sobic003G317500 Sobic005G095660 Sobic005G095660 Sobic006G061900--Sobic005G095660 Sobic005G150350 Sobic005G150350 Sobic006G061900--Sobic005G150350 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic006G061900--Sobic001G459600 Sobic002G118101--Sobic001G053200 Sobic002G321800 Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic002G321800 Sobic002G118101--Sobic008G089800 Sobic008G027200 Sobic008G027200 Sobic002G118101--Sobic008G027200 Sobic004G044900 Sobic004G044900 Sobic002G118101--Sobic004G044900 Sobic007G084300 Sobic007G084300 Sobic002G118101--Sobic007G084300 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic002G118101--Sobic003G080800 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic002G118101--Sobic002G017500 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G118101--Sobic001G413000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.