Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G256466.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VUS9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11390 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56510.1 : ABC1 family domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G113000 - -
2 Sobic.010G218000 rabGAP/TBC domain-containing protein, putative, expressed K18469: TBC1 domain family member 5
3 Sobic.007G017000 expressed protein -
4 Sobic.006G132600 - -
5 Sobic.004G130964 - -
6 Sobic.009G121400 - -
7 Sobic.008G105366 - -
8 Sobic.001G253300 phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
9 Sobic.008G190400 uridine/cytidine kinase-like 1, putative, expressed -
10 Sobic.009G217400 regulator of chromosome condensation, putative, expressed -
11 Sobic.005G007000 - -
12 Sobic.004G213900 trafficking protein particle complex subunit, putative, expressed -
13 Sobic.007G182000 hydroxymethylglutaryl-CoA synthase("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@hydroxymethylglutaryl-CoA synthase, putative, expressed K01641: hydroxymethylglutaryl-CoA synthase
14 Sobic.007G062000 diacylglycerol kinase, putative, expressed K00901: dgkA, diacylglycerol kinase (ATP)
15 Sobic.010G244300 - -
16 Sobic.007G099900 - -
17 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
18 Sobic.003G114400 expressed protein K05288: GPI ethanolamine phosphate transferase 3 subunit O
19 Sobic.003G243800 - -
20 Sobic.008G097900 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G256466 Sobic010G256466 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic010G256466--Sobic004G113000 Sobic010G218000 Sobic010G218000 Sobic010G256466--Sobic010G218000 Sobic007G017000 Sobic007G017000 Sobic010G256466--Sobic007G017000 Sobic006G132600 Sobic006G132600 Sobic010G256466--Sobic006G132600 Sobic004G130964 Sobic004G130964 Sobic010G256466--Sobic004G130964 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic010G256466--Sobic009G121400 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic010G256466--Sobic008G105366 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic010G256466--Sobic001G253300 Sobic008G190400 Sobic008G190400 Sobic010G256466--Sobic008G190400 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic004G113000--Sobic006G072601 Sobic004G113000--Sobic008G105366 Sobic005G007000 Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic005G007000 Sobic004G113000--Sobic009G121400 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic004G113000--Sobic007G198400 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic004G113000--Sobic004G038800 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic004G113000--Sobic001G459600 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic004G113000--Sobic008G166550 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic004G113000--Sobic008G084300 Sobic003G243800 Sobic003G243800 Sobic010G218000--Sobic003G243800 Sobic006G222600 Sobic006G222600 Sobic010G218000--Sobic006G222600 Sobic004G321100 Sobic004G321100 Sobic010G218000--Sobic004G321100 Sobic009G041700 Sobic009G041700 Sobic010G218000--Sobic009G041700 Sobic007G201500 Sobic007G201500 Sobic010G218000--Sobic007G201500 Sobic005G177700 Sobic005G177700 Sobic010G218000--Sobic005G177700 Sobic007G062000 Sobic007G062000 Sobic010G218000--Sobic007G062000 Sobic001G332700 Sobic001G332700 Sobic010G218000--Sobic001G332700 Sobic007G172200 Sobic007G172200 Sobic010G218000--Sobic007G172200 Sobic007G017000--Sobic010G256466 Sobic010G244300 Sobic010G244300 Sobic007G017000--Sobic010G244300 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic007G017000--Sobic001G135650 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic007G017000--Sobic008G084000 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic007G017000--Sobic009G253600 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic007G017000--Sobic010G138600 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic007G017000--Sobic004G150901 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic007G017000--Sobic008G091785 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic007G017000--Sobic002G106700 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic006G132600--Sobic002G180800 Sobic010G270200 Sobic010G270200 Sobic006G132600--Sobic010G270200 Sobic010G158000 Sobic010G158000 Sobic006G132600--Sobic010G158000 Sobic003G038400 Sobic003G038400 Sobic006G132600--Sobic003G038400 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic006G132600--Sobic004G077300 Sobic009G007300 Sobic009G007300 Sobic006G132600--Sobic009G007300 Sobic009G055500 Sobic009G055500 Sobic006G132600--Sobic009G055500 Sobic006G080700 Sobic006G080700 Sobic006G132600--Sobic006G080700 Sobic008G054200 Sobic008G054200 Sobic006G132600--Sobic008G054200 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic004G130964--Sobic007G010700 Sobic008G021400 Sobic008G021400 Sobic004G130964--Sobic008G021400 Sobic003G114400 Sobic003G114400 Sobic004G130964--Sobic003G114400 Sobic002G426300 Sobic002G426300 Sobic004G130964--Sobic002G426300 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic004G130964--Sobic001G542150 Sobic008G088872 Sobic008G088872 Sobic004G130964--Sobic008G088872 Sobic010G205600 Sobic010G205600 Sobic004G130964--Sobic010G205600 Sobic009G019800 Sobic009G019800 Sobic004G130964--Sobic009G019800 Sobic006G268600 Sobic006G268600 Sobic004G130964--Sobic006G268600 Sobic009G121400--Sobic006G072601 Sobic009G121400--Sobic004G113000 Sobic001G333300 Sobic001G333300 Sobic009G121400--Sobic001G333300 Sobic004G143475 Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic004G143475 Sobic009G121400--Sobic008G105366 Sobic004G334300 Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic004G334300 Sobic009G121400--Sobic007G010700 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic009G121400--Sobic004G253700 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic009G121400--Sobic003G416000 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic005G133600 Sobic008G105366--Sobic004G113000 Sobic008G105366--Sobic004G253700 Sobic008G105366--Sobic006G072601 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic009G260350 Sobic008G105366--Sobic007G198400 Sobic008G105366--Sobic001G459600 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic008G101100 Sobic008G105366--Sobic009G121400 Sobic003G316200 Sobic003G316200 Sobic001G253300--Sobic003G316200 Sobic001G188400 Sobic001G188400 Sobic001G253300--Sobic001G188400 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic001G253300--Sobic007G172700 Sobic008G097900 Sobic008G097900 Sobic001G253300--Sobic008G097900 Sobic003G365100 Sobic003G365100 Sobic001G253300--Sobic003G365100 Sobic001G253300--Sobic005G177700 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic001G253300--Sobic002G355800 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic001G253300--Sobic006G250800 Sobic009G162100 Sobic009G162100 Sobic001G253300--Sobic009G162100 Sobic003G166875 Sobic003G166875 Sobic008G190400--Sobic003G166875 Sobic008G190400--Sobic002G180800 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic008G190400--Sobic004G064200 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic008G190400--Sobic004G176200 Sobic007G086900 Sobic007G086900 Sobic008G190400--Sobic007G086900 Sobic002G350200 Sobic002G350200 Sobic008G190400--Sobic002G350200 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic008G190400--Sobic003G014200 Sobic009G256601 Sobic009G256601 Sobic008G190400--Sobic009G256601 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic008G190400--Sobic007G099900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.