Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G244300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YL82
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G149800 - -
2 Sobic.002G011900 expressed protein -
3 Sobic.010G136950 - -
4 Sobic.004G089300 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G060000 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G103800 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
7 Sobic.007G099900 - -
8 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
10 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
11 Sobic.010G014850 - -
12 Sobic.002G350200 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
13 Sobic.004G064200 STE_PAK_Ste20_STLK.1 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
14 Sobic.K028900 - -
15 Sobic.010G158050 - -
16 Sobic.005G201501 - -
17 Sobic.002G261400 Os9bglu31 - beta-glucosidase, dhurrinase, similar to G. max hydroxyisourate hydrolase, expressed K01188: beta-glucosidase
18 Sobic.002G074800 - -
19 Sobic.004G213500 exostosin family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G057000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G244300 Sobic010G244300 Sobic010G149800 Sobic010G149800 Sobic010G244300--Sobic010G149800 Sobic002G011900 Sobic002G011900 Sobic010G244300--Sobic002G011900 Sobic010G136950 Sobic010G136950 Sobic010G244300--Sobic010G136950 Sobic004G089300 Sobic004G089300 Sobic010G244300--Sobic004G089300 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic010G244300--Sobic002G060000 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic010G244300--Sobic002G103800 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic010G244300--Sobic007G099900 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G244300--Sobic003G075300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G244300--Sobic005G191200 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic010G149800--Sobic006G270000 Sobic003G024400 Sobic003G024400 Sobic010G149800--Sobic003G024400 Sobic005G200300 Sobic005G200300 Sobic010G149800--Sobic005G200300 Sobic010G149800--Sobic010G244300 Sobic010G149800--Sobic002G011900 Sobic003G010800 Sobic003G010800 Sobic010G149800--Sobic003G010800 Sobic001G241401 Sobic001G241401 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Octagon: transcription factors


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