Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G017000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PF69
Pfam -
Panther DB PTHR33157 PTHR33157:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g24940.1 : conserved hypothetical protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G256466 - -
2 Sobic.010G244300 - -
3 Sobic.001G135650 - -
4 Sobic.008G084000 - -
5 Sobic.009G253600 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G138600 expressed protein -
7 Sobic.004G150901 - -
8 Sobic.008G091785 - -
9 Sobic.002G106700 OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
10 Sobic.004G213900 trafficking protein particle complex subunit, putative, expressed -
11 Sobic.007G007400 OsFBL38 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
12 Sobic.001G246800 MBTB44 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.005G070000 OsWAK92 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.007G139850 - -
15 Sobic.001G140950 - -
16 Sobic.009G021050 - -
17 Sobic.K028900 - -
18 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G038400 expressed protein -
20 Sobic.008G190400 uridine/cytidine kinase-like 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G017000 Sobic007G017000 Sobic010G256466 Sobic010G256466 Sobic007G017000--Sobic010G256466 Sobic010G244300 Sobic010G244300 Sobic007G017000--Sobic010G244300 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic007G017000--Sobic001G135650 Sobic008G084000 Sobic008G084000 Sobic007G017000--Sobic008G084000 Sobic009G253600 Sobic009G253600 Sobic007G017000--Sobic009G253600 Sobic010G138600 Sobic010G138600 Sobic007G017000--Sobic010G138600 Sobic004G150901 Sobic004G150901 Sobic007G017000--Sobic004G150901 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic007G017000--Sobic008G091785 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic007G017000--Sobic002G106700 Sobic004G113000 Sobic004G113000 Sobic010G256466--Sobic004G113000 Sobic010G218000 Sobic010G218000 Sobic010G256466--Sobic010G218000 Sobic010G256466--Sobic007G017000 Sobic006G132600 Sobic006G132600 Sobic010G256466--Sobic006G132600 Sobic004G130964 Sobic004G130964 Sobic010G256466--Sobic004G130964 Sobic009G121400 Sobic009G121400 Sobic010G256466--Sobic009G121400 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic010G256466--Sobic008G105366 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic010G256466--Sobic001G253300 Sobic008G190400 Sobic008G190400 Sobic010G256466--Sobic008G190400 Sobic010G149800 Sobic010G149800 Sobic010G244300--Sobic010G149800 Sobic002G011900 Sobic002G011900 Sobic010G244300--Sobic002G011900 Sobic010G136950 Sobic010G136950 Sobic010G244300--Sobic010G136950 Sobic004G089300 Sobic004G089300 Sobic010G244300--Sobic004G089300 Sobic002G060000 Sobic002G060000 Sobic010G244300--Sobic002G060000 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic010G244300--Sobic002G103800 Sobic007G099900 Sobic007G099900 Sobic010G244300--Sobic007G099900 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G244300--Sobic003G075300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G244300--Sobic005G191200 Sobic001G135650--Sobic008G091785 Sobic001G135650--Sobic002G106700 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic007G007400 Sobic001G135650--Sobic009G253600 Sobic001G135650--Sobic010G138600 Sobic001G135650--Sobic004G150901 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic001G135650--Sobic003G078000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic001G135650--Sobic008G164000 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic001G135650--Sobic006G230000 Sobic008G084000--Sobic004G150901 Sobic008G084000--Sobic010G138600 Sobic008G084000--Sobic009G253600 Sobic007G139850 Sobic007G139850 Sobic008G084000--Sobic007G139850 Sobic009G021050 Sobic009G021050 Sobic008G084000--Sobic009G021050 Sobic001G246800 Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic001G246800 Sobic008G084000--Sobic008G091785 Sobic008G084000--Sobic007G007400 Sobic008G084000--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic010G138600 Sobic009G253600--Sobic004G150901 Sobic009G253600--Sobic008G091785 Sobic009G253600--Sobic008G084000 Sobic009G253600--Sobic007G007400 Sobic009G253600--Sobic002G106700 Sobic009G253600--Sobic001G135650 Sobic009G253600--Sobic007G139850 Sobic009G253600--Sobic009G021050 Sobic010G138600--Sobic009G253600 Sobic010G138600--Sobic004G150901 Sobic010G138600--Sobic008G091785 Sobic010G138600--Sobic008G084000 Sobic010G138600--Sobic007G007400 Sobic010G138600--Sobic002G106700 Sobic010G138600--Sobic001G135650 Sobic010G138600--Sobic007G139850 Sobic010G138600--Sobic009G021050 Sobic004G150901--Sobic010G138600 Sobic004G150901--Sobic009G253600 Sobic004G150901--Sobic008G084000 Sobic004G150901--Sobic007G139850 Sobic004G150901--Sobic009G021050 Sobic004G150901--Sobic008G091785 Sobic004G150901--Sobic007G007400 Sobic004G150901--Sobic001G135650 Sobic004G150901--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic007G007400 Sobic008G091785--Sobic002G106700 Sobic008G091785--Sobic001G135650 Sobic008G091785--Sobic009G253600 Sobic008G091785--Sobic010G138600 Sobic008G091785--Sobic003G078000 Sobic008G091785--Sobic004G150901 Sobic008G091785--Sobic006G230000 Sobic008G091785--Sobic008G164000 Sobic002G106700--Sobic008G091785 Sobic002G106700--Sobic007G007400 Sobic002G106700--Sobic001G135650 Sobic002G106700--Sobic006G230000 Sobic002G106700--Sobic008G164000 Sobic002G106700--Sobic003G078000 Sobic002G106700--Sobic009G253600 Sobic002G106700--Sobic010G138600 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic002G106700--Sobic003G406060
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.