Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G120100.1
Synonym Sb06g020080
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YAQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g40120.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ83155
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G035300 expressed protein -
2 Sobic.003G099232 - -
3 Sobic.003G196500 - -
4 Sobic.002G385000 expressed protein -
5 Sobic.009G013600 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
6 Sobic.002G067400 ATPase, putative, expressed K08900: mitochondrial chaperone BCS1
7 Sobic.005G002350 - -
8 Sobic.002G392550 - -
9 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G396050 - -
11 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
12 Sobic.001G344150 - -
13 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
14 Sobic.005G116250 - -
15 Sobic.009G225250 - -
16 Sobic.005G181900 MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.006G110101 - -
18 Sobic.004G196600 expressed protein -
19 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G133100 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4


Gene co-expression network
sample Sobic006G120100 Sobic006G120100 Sobic008G035300 Sobic008G035300 Sobic006G120100--Sobic008G035300 Sobic003G099232 Sobic003G099232 Sobic006G120100--Sobic003G099232 Sobic003G196500 Sobic003G196500 Sobic006G120100--Sobic003G196500 Sobic002G385000 Sobic002G385000 Sobic006G120100--Sobic002G385000 Sobic009G013600 Sobic009G013600 Sobic006G120100--Sobic009G013600 Sobic002G067400 Sobic002G067400 Sobic006G120100--Sobic002G067400 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic006G120100--Sobic005G002350 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic006G120100--Sobic002G392550 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic006G120100--Sobic003G255000 Sobic006G110101 Sobic006G110101 Sobic008G035300--Sobic006G110101 Sobic008G068133 Sobic008G068133 Sobic008G035300--Sobic008G068133 Sobic010G079150 Sobic010G079150 Sobic008G035300--Sobic010G079150 Sobic008G126100 Sobic008G126100 Sobic008G035300--Sobic008G126100 Sobic008G035300--Sobic003G196500 Sobic002G030100 Sobic002G030100 Sobic008G035300--Sobic002G030100 Sobic008G017400 Sobic008G017400 Sobic008G035300--Sobic008G017400 Sobic001G369550 Sobic001G369550 Sobic008G035300--Sobic001G369550 Sobic003G213500 Sobic003G213500 Sobic008G035300--Sobic003G213500 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic003G099232--Sobic002G250700 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G099232--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G099232--Sobic009G225250 Sobic003G099232--Sobic003G255000 Sobic003G099232--Sobic005G002350 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic003G099232--Sobic008G172900 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic003G099232--Sobic004G204700 Sobic005G181900 Sobic005G181900 Sobic003G099232--Sobic005G181900 Sobic005G045400 Sobic005G045400 Sobic003G099232--Sobic005G045400 Sobic003G196500--Sobic010G079150 Sobic003G196500--Sobic006G110101 Sobic003G196500--Sobic001G369550 Sobic008G052700 Sobic008G052700 Sobic003G196500--Sobic008G052700 Sobic003G196500--Sobic008G043000 Sobic003G196500--Sobic009G225250 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G196500--Sobic003G063801 Sobic003G196500--Sobic002G250700 Sobic009G163000 Sobic009G163000 Sobic003G196500--Sobic009G163000 Sobic002G385000--Sobic005G181900 Sobic002G385000--Sobic002G067400 Sobic002G385000--Sobic002G250700 Sobic002G385000--Sobic004G204700 Sobic002G385000--Sobic008G043000 Sobic002G385000--Sobic009G225250 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G385000--Sobic002G291850 Sobic006G142365 Sobic006G142365 Sobic002G385000--Sobic006G142365 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic002G385000--Sobic002G064100 Sobic009G013600--Sobic008G043000 Sobic009G013600--Sobic003G255000 Sobic009G013600--Sobic009G225250 Sobic009G013600--Sobic002G392550 Sobic002G357500 Sobic002G357500 Sobic009G013600--Sobic002G357500 Sobic009G013600--Sobic002G250700 Sobic009G013600--Sobic005G002350 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic009G013600--Sobic010G133100 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic009G013600--Sobic009G080500 Sobic002G067400--Sobic004G204700 Sobic002G067400--Sobic008G043000 Sobic002G067400--Sobic009G225250 Sobic005G041800 Sobic005G041800 Sobic002G067400--Sobic005G041800 Sobic002G067400--Sobic002G250700 Sobic007G011500 Sobic007G011500 Sobic002G067400--Sobic007G011500 Sobic002G067400--Sobic002G385000 Sobic002G067400--Sobic002G064100 Sobic003G373200 Sobic003G373200 Sobic002G067400--Sobic003G373200 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100 Sobic002G392550--Sobic003G255000 Sobic002G392550--Sobic003G063801 Sobic002G392550--Sobic008G043000 Sobic002G392550--Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic009G225250 Sobic002G392550--Sobic002G250700 Sobic002G392550--Sobic002G064100 Sobic002G392550--Sobic010G133100 Sobic002G392550--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G255000--Sobic003G063801
Octagon: transcription factors


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