Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G013600.1
Synonym PLL2, Sb09g001340
Functional annotation protein phosphatase 2C, putative, expressed
UniProt B3VTB3
Pfam PF00481
Panther DB PTHR13832 PTHR13832:SF351
NCBI CDD KOG0700; Protein phosphatase 2C/pyruvate dehydrogenase (lipoamide) phosphatase
KEGG Orthology K01102; pyruvate dehydrogenase phosphatase
Gene Ontology GO:0003824; catalytic activity GO:0006470protein dephosphorylation GO:0004722protein serine/threonine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28890 : poltergeist like 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g02110.1 : protein phosphatase 2C, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016424 , Zm00025a008813 , Zm00025a038261
Brachypodium KQK00834 , KQK07011 , KQK07980
Barley HORVU1Hr1G005090.3 , HORVU1Hr1G005090.2 , HORVU1Hr1G005090.7 , HORVU1Hr1G005090.6 , HORVU1Hr1G005090.4 , HORVU1Hr1G005090.1 , HORVU5Hr1G012020.3 , HORVU5Hr1G113240.2 , HORVU5Hr1G113240.3 , HORVU5Hr1G113240.1 , HORVU5Hr1G113240.4 , HORVU5Hr1G113240.5 , HORVU1Hr1G005090.5
Wheat TraesCS1B02G042100 , TraesCS5A02G479600 , TraesCS5D02G493200 , TraesCS1A02G033700 , TraesCS5B02G492700
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
2 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G225250 - -
4 Sobic.002G392550 - -
5 Sobic.002G357500 - -
6 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G002350 - -
8 Sobic.010G133100 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
9 Sobic.009G080500 - -
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12 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G158200 - -
14 Sobic.001G173251 - -
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17 Sobic.004G067050 - -
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19 Sobic.001G344150 - -
20 Sobic.004G093300 interferon-related developmental regulator family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G013600 Sobic009G013600 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic009G013600--Sobic008G043000 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic009G013600--Sobic003G255000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic009G013600--Sobic009G225250 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic009G013600--Sobic002G392550 Sobic002G357500 Sobic002G357500 Sobic009G013600--Sobic002G357500 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic009G013600--Sobic002G250700 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic009G013600--Sobic005G002350 Sobic010G133100 Sobic010G133100 Sobic009G013600--Sobic010G133100 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic009G013600--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic003G255000 Sobic002G392550--Sobic003G063801 Sobic002G392550--Sobic008G043000 Sobic002G392550--Sobic005G002350 Sobic002G392550--Sobic009G225250 Sobic002G392550--Sobic002G250700 Sobic002G392550--Sobic002G064100 Sobic002G392550--Sobic010G133100 Sobic002G392550--Sobic004G204700 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic002G357500--Sobic002G369100 Sobic002G357500--Sobic008G043000 Sobic002G357500--Sobic009G225250 Sobic002G357500--Sobic002G250700 Sobic002G357500--Sobic005G002350 Sobic002G357500--Sobic004G204700 Sobic002G357500--Sobic003G255000 Sobic005G144900 Sobic005G144900 Sobic002G357500--Sobic005G144900 Sobic002G357500--Sobic009G080500 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic005G002350--Sobic002G369100 Sobic010G133100--Sobic003G063801 Sobic010G133100--Sobic002G064100 Sobic010G133100--Sobic008G043000 Sobic004G135600 Sobic004G135600 Sobic010G133100--Sobic004G135600 Sobic010G133100--Sobic009G225250 Sobic004G196600 Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic004G196600 Sobic010G133100--Sobic003G255000 Sobic010G133100--Sobic002G392550 Sobic010G133100--Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic009G225250 Sobic009G080500--Sobic008G043000 Sobic009G080500--Sobic002G250700 Sobic009G080500--Sobic004G204700 Sobic009G080500--Sobic005G002350 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic009G062150 Sobic009G080500--Sobic003G255000 Sobic009G080500--Sobic009G067700 Sobic009G080500--Sobic008G172900
Octagon: transcription factors


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