Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G099232.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q2C8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G250700 DC1 domain-containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G043000 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed K08066: NFYC, nuclear transcription factor Y, gamma
3 Sobic.009G225250 - -
4 Sobic.003G255000 no apical meristem protein, putative, expressed -
5 Sobic.005G002350 - -
6 Sobic.008G172900 RGH1A, putative, expressed -
7 Sobic.004G204700 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G181900 MBTB37 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.005G045400 - -
10 Sobic.002G369100 expressed protein -
11 Sobic.002G392550 - -
12 Sobic.002G064100 DNA-binding storekeeper protein-related, putative, expressed -
13 Sobic.002G050450 - -
14 Sobic.009G080500 - -
15 Sobic.002G151900 - -
16 Sobic.002G357500 - -
17 Sobic.006G113100 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G344150 - -
19 Sobic.009G013600 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
20 Sobic.003G063801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G099232 Sobic003G099232 Sobic002G250700 Sobic002G250700 Sobic003G099232--Sobic002G250700 Sobic008G043000 Sobic008G043000 Sobic003G099232--Sobic008G043000 Sobic009G225250 Sobic009G225250 Sobic003G099232--Sobic009G225250 Sobic003G255000 Sobic003G255000 Sobic003G099232--Sobic003G255000 Sobic005G002350 Sobic005G002350 Sobic003G099232--Sobic005G002350 Sobic008G172900 Sobic008G172900 Sobic003G099232--Sobic008G172900 Sobic004G204700 Sobic004G204700 Sobic003G099232--Sobic004G204700 Sobic005G181900 Sobic005G181900 Sobic003G099232--Sobic005G181900 Sobic005G045400 Sobic005G045400 Sobic003G099232--Sobic005G045400 Sobic002G250700--Sobic009G225250 Sobic002G250700--Sobic008G043000 Sobic002G250700--Sobic004G204700 Sobic002G250700--Sobic003G255000 Sobic002G064100 Sobic002G064100 Sobic002G250700--Sobic002G064100 Sobic009G067700 Sobic009G067700 Sobic002G250700--Sobic009G067700 Sobic002G291850 Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic002G291850 Sobic002G250700--Sobic008G172900 Sobic002G250700--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic009G225250 Sobic008G043000--Sobic002G250700 Sobic008G043000--Sobic004G204700 Sobic008G043000--Sobic003G255000 Sobic008G043000--Sobic005G002350 Sobic008G043000--Sobic008G172900 Sobic008G043000--Sobic002G064100 Sobic009G080500 Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic009G080500 Sobic008G043000--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic008G043000 Sobic009G225250--Sobic002G250700 Sobic009G225250--Sobic004G204700 Sobic009G225250--Sobic003G255000 Sobic009G225250--Sobic002G064100 Sobic009G225250--Sobic008G172900 Sobic009G225250--Sobic009G067700 Sobic009G225250--Sobic002G291850 Sobic009G225250--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic008G043000 Sobic003G255000--Sobic009G225250 Sobic003G255000--Sobic002G250700 Sobic002G392550 Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic002G392550 Sobic003G255000--Sobic005G002350 Sobic003G255000--Sobic004G204700 Sobic003G255000--Sobic008G172900 Sobic003G255000--Sobic009G080500 Sobic003G063801 Sobic003G063801 Sobic003G255000--Sobic003G063801 Sobic005G002350--Sobic008G043000 Sobic005G002350--Sobic009G225250 Sobic005G002350--Sobic003G255000 Sobic005G002350--Sobic002G250700 Sobic005G002350--Sobic009G080500 Sobic005G002350--Sobic002G392550 Sobic005G002350--Sobic004G204700 Sobic005G002350--Sobic008G172900 Sobic002G369100 Sobic002G369100 Sobic005G002350--Sobic002G369100 Sobic008G172900--Sobic009G225250 Sobic008G172900--Sobic008G043000 Sobic008G172900--Sobic002G250700 Sobic008G172900--Sobic004G204700 Sobic008G172900--Sobic002G064100 Sobic008G172900--Sobic003G255000 Sobic008G172900--Sobic009G067700 Sobic008G172900--Sobic009G080500 Sobic008G172900--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic009G225250 Sobic004G204700--Sobic009G067700 Sobic004G204700--Sobic002G291850 Sobic004G204700--Sobic002G250700 Sobic004G204700--Sobic008G043000 Sobic009G062150 Sobic009G062150 Sobic004G204700--Sobic009G062150 Sobic010G142132 Sobic010G142132 Sobic004G204700--Sobic010G142132 Sobic001G183900 Sobic001G183900 Sobic004G204700--Sobic001G183900 Sobic009G128901 Sobic009G128901 Sobic004G204700--Sobic009G128901 Sobic005G181900--Sobic008G043000 Sobic005G181900--Sobic009G225250 Sobic005G181900--Sobic002G250700 Sobic005G181900--Sobic004G204700 Sobic006G142365 Sobic006G142365 Sobic005G181900--Sobic006G142365 Sobic005G181900--Sobic002G291850 Sobic005G181900--Sobic003G255000 Sobic002G385000 Sobic002G385000 Sobic005G181900--Sobic002G385000 Sobic005G181900--Sobic008G172900 Sobic005G045400--Sobic009G225250 Sobic005G045400--Sobic008G043000 Sobic005G045400--Sobic002G250700 Sobic005G045400--Sobic004G204700 Sobic005G045400--Sobic002G369100 Sobic005G045400--Sobic003G255000 Sobic002G050450 Sobic002G050450 Sobic005G045400--Sobic002G050450 Sobic005G045400--Sobic009G067700 Sobic005G045400--Sobic005G002350
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.