Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G129466.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REM4
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF120
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G53190 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g41070.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010931 , Zm00025a010934 , Zm00025a010937 , Zm00025a010928
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G048300 expressed protein -
2 Sobic.008G038900 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
3 Sobic.006G127750 - -
4 Sobic.002G129100 LTPL27 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.005G090100 expressed protein -
6 Sobic.007G049100 expressed protein -
7 Sobic.005G010600 LTPL58 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.002G380800 - -
9 Sobic.009G075000 expressed protein -
10 Sobic.003G016000 LTPL18 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.001G459700 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
12 Sobic.010G259400 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G074900 expressed protein -
14 Sobic.010G222501 - K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.010G048000 expressed protein -
16 Sobic.006G079500 AMP-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G088200 dihydroflavonol-4-reductase, putative, expressed -
18 Sobic.001G133200 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G133200 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G133200 OsFBX85 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
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