Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G150500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PM36
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010635
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G335000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G016950 - -
3 Sobic.009G186300 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.006G048400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
5 Sobic.006G233400 - -
6 Sobic.002G324801 - -
7 Sobic.003G334400 verticillium wilt disease resistance protein precursor, putative, expressed -
8 Sobic.002G181066 - -
9 Sobic.007G052000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10666: E3 ubiquitin-protein ligase RNF5
10 Sobic.007G133733 - -
11 Sobic.001G074601 - -
12 Sobic.010G011100 - -
13 Sobic.001G524750 - -
14 Sobic.004G203633 - -
15 Sobic.005G118500 expressed protein -
16 Sobic.003G096950 - -
17 Sobic.003G375500 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G305733 - -
19 Sobic.009G026700 expressed protein -
20 Sobic.001G460900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G150500 Sobic006G150500 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic006G150500--Sobic003G335000 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G150500--Sobic003G016950 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic006G150500--Sobic009G186300 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic006G150500--Sobic006G048400 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic006G150500--Sobic006G233400 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic006G150500--Sobic002G324801 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic006G150500--Sobic003G334400 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic006G150500--Sobic002G181066 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic006G150500--Sobic007G052000 Sobic003G335000--Sobic003G334400 Sobic006G223101 Sobic006G223101 Sobic003G335000--Sobic006G223101 Sobic003G335100 Sobic003G335100 Sobic003G335000--Sobic003G335100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G335000--Sobic008G085800 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G335000--Sobic002G171901 Sobic001G229850 Sobic001G229850 Sobic003G335000--Sobic001G229850 Sobic006G223601 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Octagon: transcription factors


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