Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G150900.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PI30
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g35730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G260500 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
2 Sobic.004G354600 expressed protein -
3 Sobic.002G123100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
4 Sobic.005G110538 - K08818: cell division cycle 2-like
5 Sobic.010G239033 - -
6 Sobic.009G227201 - -
7 Sobic.001G188500 expressed protein -
8 Sobic.003G179700 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.003G198048 - -
10 Sobic.001G087300 - -
11 Sobic.003G128100 expressed protein -
12 Sobic.001G150300 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
13 Sobic.002G144150 - -
14 Sobic.003G436400 plasma membrane ATPase, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
15 Sobic.008G186700 - -
16 Sobic.001G394100 - -
17 Sobic.003G045501 - -
18 Sobic.006G170400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.010G005900 nodulin, putative, expressed -
20 Sobic.002G007400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G150900 Sobic007G150900 Sobic004G260500 Sobic004G260500 Sobic007G150900--Sobic004G260500 Sobic004G354600 Sobic004G354600 Sobic007G150900--Sobic004G354600 Sobic002G123100 Sobic002G123100 Sobic007G150900--Sobic002G123100 Sobic005G110538 Sobic005G110538 Sobic007G150900--Sobic005G110538 Sobic010G239033 Sobic010G239033 Sobic007G150900--Sobic010G239033 Sobic009G227201 Sobic009G227201 Sobic007G150900--Sobic009G227201 Sobic001G188500 Sobic001G188500 Sobic007G150900--Sobic001G188500 Sobic003G179700 Sobic003G179700 Sobic007G150900--Sobic003G179700 Sobic003G198048 Sobic003G198048 Sobic007G150900--Sobic003G198048 Sobic004G260500--Sobic005G110538 Sobic005G011100 Sobic005G011100 Sobic004G260500--Sobic005G011100 Sobic004G260500--Sobic003G179700 Sobic008G010400 Sobic008G010400 Sobic004G260500--Sobic008G010400 Sobic010G152900 Sobic010G152900 Sobic004G260500--Sobic010G152900 Sobic002G007400 Sobic002G007400 Sobic004G260500--Sobic002G007400 Sobic001G422300 Sobic001G422300 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Octagon: transcription factors


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