Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G087300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QI20
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G328100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
2 Sobic.004G260500 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
3 Sobic.007G012400 - -
4 Sobic.009G142100 DUF538 domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G150900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.005G058700 expressed protein -
7 Sobic.002G365700 - -
8 Sobic.003G297200 lipase, putative, expressed -
9 Sobic.001G282900 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K00968: choline-phosphate cytidylyltransferase
10 Sobic.007G150900 expressed protein -
11 Sobic.001G282000 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
12 Sobic.004G002600 rhodanese-like domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G413900 expressed protein -
14 Sobic.003G198048 - -
15 Sobic.006G124600 Regulator of chromosome condensation domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G354600 expressed protein -
17 Sobic.002G374200 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, putative, expressed K03017: RPB9, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
18 Sobic.002G123100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed K07407: E3.2.1.22B, galA, alpha-galactosidase
19 Sobic.001G149600 CS domain containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.009G105000 leaf senescence related protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G087300 Sobic001G087300 Sobic001G328100 Sobic001G328100 Sobic001G087300--Sobic001G328100 Sobic004G260500 Sobic004G260500 Sobic001G087300--Sobic004G260500 Sobic007G012400 Sobic007G012400 Sobic001G087300--Sobic007G012400 Sobic009G142100 Sobic009G142100 Sobic001G087300--Sobic009G142100 Sobic010G150900 Sobic010G150900 Sobic001G087300--Sobic010G150900 Sobic005G058700 Sobic005G058700 Sobic001G087300--Sobic005G058700 Sobic002G365700 Sobic002G365700 Sobic001G087300--Sobic002G365700 Sobic003G297200 Sobic003G297200 Sobic001G087300--Sobic003G297200 Sobic001G282900 Sobic001G282900 Sobic001G087300--Sobic001G282900 Sobic001G328100--Sobic001G087300 Sobic001G042500 Sobic001G042500 Sobic001G328100--Sobic001G042500 Sobic008G110200 Sobic008G110200 Sobic001G328100--Sobic008G110200 Sobic006G271300 Sobic006G271300 Sobic001G328100--Sobic006G271300 Sobic001G399300 Sobic001G399300 Sobic001G328100--Sobic001G399300 Sobic006G136200 Sobic006G136200 Sobic001G328100--Sobic006G136200 Sobic006G189700 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Octagon: transcription factors


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