Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G198048.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A109ND48
Pfam PF02902
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008234; cysteine-type peptidase activity GO:0006508proteolysis


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G06910 : UB-like protease 1A
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g13750.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G198016 - -
2 Sobic.010G124600 estradiol 17-beta-dehydrogenase 12, putative, expressed K10251: HSD17B12, KAR, 17beta-estradiol 17-dehydrogenase / very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase
3 Sobic.006G034200 wax synthase, putative, expressed -
4 Sobic.001G538000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
5 Sobic.005G110538 - K08818: cell division cycle 2-like
6 Sobic.009G156400 tubulin-specific chaperone E, putative, expressed -
7 Sobic.008G087300 3-oxoacyl-reductase, chloroplast precursor, putative, expressed K00059: fabG, 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase
8 Sobic.003G179700 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
9 Sobic.004G167000 POEI29 - Pollen Ole e I allergen and extensin family protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G266900 LTPL37 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
11 Sobic.004G260500 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
12 Sobic.009G103900 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G040400 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.003G205700 THION18 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
15 Sobic.010G005900 nodulin, putative, expressed -
16 Sobic.008G008200 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G126000 calmodulin binding protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G180000 - -
19 Sobic.008G138300 expressed protein -
20 Sobic.010G233900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Os6bglu25 - beta-glucosidase homologue, similar to Os3bglu6, expressed K01188: beta-glucosidase


Gene co-expression network
sample Sobic003G198048 Sobic003G198048 Sobic003G198016 Sobic003G198016 Sobic003G198048--Sobic003G198016 Sobic010G124600 Sobic010G124600 Sobic003G198048--Sobic010G124600 Sobic006G034200 Sobic006G034200 Sobic003G198048--Sobic006G034200 Sobic001G538000 Sobic001G538000 Sobic003G198048--Sobic001G538000 Sobic005G110538 Sobic005G110538 Sobic003G198048--Sobic005G110538 Sobic009G156400 Sobic009G156400 Sobic003G198048--Sobic009G156400 Sobic008G087300 Sobic008G087300 Sobic003G198048--Sobic008G087300 Sobic003G179700 Sobic003G179700 Sobic003G198048--Sobic003G179700 Sobic004G167000 Sobic004G167000 Sobic003G198048--Sobic004G167000 Sobic003G198016--Sobic003G198048 Sobic003G198016--Sobic009G156400 Sobic003G198080 Sobic003G198080 Sobic003G198016--Sobic003G198080 Sobic009G103900 Sobic009G103900 Sobic003G198016--Sobic009G103900 Sobic007G116500 Sobic007G116500 Sobic003G198016--Sobic007G116500 Sobic004G218100 Sobic004G218100 Sobic003G198016--Sobic004G218100 Sobic005G166500 Sobic005G166500 Sobic003G198016--Sobic005G166500 Sobic003G198016--Sobic001G538000 Sobic002G273500 Sobic002G273500 Sobic003G198016--Sobic002G273500 Sobic010G124600--Sobic004G167000 Sobic010G124600--Sobic008G087300 Sobic001G266900 Sobic001G266900 Sobic010G124600--Sobic001G266900 Sobic008G008200 Sobic008G008200 Sobic010G124600--Sobic008G008200 Sobic003G040400 Sobic003G040400 Sobic010G124600--Sobic003G040400 Sobic010G180000 Sobic010G180000 Sobic010G124600--Sobic010G180000 Sobic009G239800 Sobic009G239800 Sobic010G124600--Sobic009G239800 Sobic008G138300 Sobic008G138300 Sobic010G124600--Sobic008G138300 Sobic010G159500 Sobic010G159500 Sobic010G124600--Sobic010G159500 Sobic003G162500 Sobic003G162500 Sobic006G034200--Sobic003G162500 Sobic006G251301 Sobic006G251301 Sobic006G034200--Sobic006G251301 Sobic008G189800 Sobic008G189800 Sobic006G034200--Sobic008G189800 Sobic003G206100 Sobic003G206100 Sobic006G034200--Sobic003G206100 Sobic004G090700 Sobic004G090700 Sobic006G034200--Sobic004G090700 Sobic003G206200 Sobic003G206200 Sobic006G034200--Sobic003G206200 Sobic004G159200 Sobic004G159200 Sobic006G034200--Sobic004G159200 Sobic003G413400 Sobic003G413400 Sobic006G034200--Sobic003G413400 Sobic002G129600 Sobic002G129600 Sobic006G034200--Sobic002G129600 Sobic001G538000--Sobic010G124600 Sobic001G538000--Sobic008G008200 Sobic001G538000--Sobic004G167000 Sobic001G538000--Sobic008G087300 Sobic007G068700 Sobic007G068700 Sobic001G538000--Sobic007G068700 Sobic001G538000--Sobic009G239800 Sobic001G538000--Sobic010G180000 Sobic010G005900 Sobic010G005900 Sobic001G538000--Sobic010G005900 Sobic001G303750 Sobic001G303750 Sobic001G538000--Sobic001G303750 Sobic005G110538--Sobic008G087300 Sobic005G110538--Sobic008G008200 Sobic005G110538--Sobic004G167000 Sobic005G110538--Sobic001G266900 Sobic005G110538--Sobic010G180000 Sobic005G110538--Sobic008G138300 Sobic005G110538--Sobic007G068700 Sobic005G110538--Sobic009G239800 Sobic005G110538--Sobic003G162500 Sobic002G317700 Sobic002G317700 Sobic009G156400--Sobic002G317700 Sobic006G211900 Sobic006G211900 Sobic009G156400--Sobic006G211900 Sobic008G118100 Sobic008G118100 Sobic009G156400--Sobic008G118100 Sobic002G112000 Sobic002G112000 Sobic009G156400--Sobic002G112000 Sobic009G156400--Sobic003G198016 Sobic001G033300 Sobic001G033300 Sobic009G156400--Sobic001G033300 Sobic010G175350 Sobic010G175350 Sobic009G156400--Sobic010G175350 Sobic009G156400--Sobic003G198048 Sobic004G078500 Sobic004G078500 Sobic009G156400--Sobic004G078500 Sobic008G087300--Sobic004G167000 Sobic008G087300--Sobic001G266900 Sobic008G087300--Sobic008G008200 Sobic008G087300--Sobic010G180000 Sobic008G087300--Sobic008G138300 Sobic008G087300--Sobic010G159500 Sobic008G087300--Sobic009G239800 Sobic003G239400 Sobic003G239400 Sobic008G087300--Sobic003G239400 Sobic008G126000 Sobic008G126000 Sobic008G087300--Sobic008G126000 Sobic007G073300 Sobic007G073300 Sobic003G179700--Sobic007G073300 Sobic003G179700--Sobic002G129600 Sobic003G179700--Sobic003G206200 Sobic003G179700--Sobic004G159200 Sobic003G179700--Sobic004G090700 Sobic003G179700--Sobic003G413400 Sobic003G179700--Sobic003G162500 Sobic003G206300 Sobic003G206300 Sobic003G179700--Sobic003G206300 Sobic007G064600 Sobic007G064600 Sobic003G179700--Sobic007G064600 Sobic004G167000--Sobic008G087300 Sobic004G167000--Sobic001G266900 Sobic004G167000--Sobic008G008200 Sobic004G167000--Sobic010G180000 Sobic004G167000--Sobic008G138300 Sobic004G167000--Sobic010G159500 Sobic004G167000--Sobic007G064600 Sobic004G167000--Sobic003G239400 Sobic004G167000--Sobic003G040400
Octagon: transcription factors


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