Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G103900.1
Synonym ATMYB73, MYB73, Sb09g016570
Functional annotation myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YWC0
Pfam PF00249
Panther DB PTHR10641 PTHR10641:SF644
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G37260 : myb domain protein 73
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g28320.1 : myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025799 , Zm00025a042083 , Zm00025a051434 , Zm00025a043450 , Zm00025a043455
Brachypodium KQK06791 , KQK16730
Barley HORVU1Hr1G060030.1 , HORVU4Hr1G077230.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G322832 - -
2 Sobic.009G148000 anthranilate phosphoribosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.002G343000 expressed protein -
4 Sobic.007G023600 ATP binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.010G180200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G354600 expressed protein -
7 Sobic.008G041900 expressed protein -
8 Sobic.004G339900 expressed protein -
9 Sobic.010G152000 powdery mildew resistant protein 5, putative, expressed -
10 Sobic.004G014100 sialyltransferase family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.004G242200 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@nucleobase-ascorbate transporter, putative, expressed -
12 Sobic.001G081800 GASR3 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
13 Sobic.006G186300 fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G017000 expressed protein -
15 Sobic.002G420400 - -
16 Sobic.003G198048 - -
17 Sobic.003G198016 - -
18 Sobic.003G379900 plus-3 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.003G217500 expressed protein -
20 Sobic.008G045800 PHD-finger family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G103900 Sobic009G103900 Sobic001G322832 Sobic001G322832 Sobic009G103900--Sobic001G322832 Sobic009G148000 Sobic009G148000 Sobic009G103900--Sobic009G148000 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic009G103900--Sobic002G343000 Sobic007G023600 Sobic007G023600 Sobic009G103900--Sobic007G023600 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic009G103900--Sobic010G180200 Sobic004G354600 Sobic004G354600 Sobic009G103900--Sobic004G354600 Sobic008G041900 Sobic008G041900 Sobic009G103900--Sobic008G041900 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic009G103900--Sobic004G339900 Sobic010G152000 Sobic010G152000 Sobic009G103900--Sobic010G152000 Sobic001G322832--Sobic009G103900 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic001G322832--Sobic004G274500 Sobic009G017000 Sobic009G017000 Sobic001G322832--Sobic009G017000 Sobic001G322832--Sobic004G354600 Sobic001G150300 Sobic001G150300 Sobic001G322832--Sobic001G150300 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic001G322832--Sobic008G037100 Sobic010G061700 Sobic010G061700 Sobic001G322832--Sobic010G061700 Sobic002G123100 Sobic002G123100 Sobic001G322832--Sobic002G123100 Sobic001G401975 Sobic001G401975 Sobic001G322832--Sobic001G401975 Sobic009G148000--Sobic002G343000 Sobic002G253900 Sobic002G253900 Sobic009G148000--Sobic002G253900 Sobic006G200901 Sobic006G200901 Sobic009G148000--Sobic006G200901 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic009G148000--Sobic006G186300 Sobic003G217500 Sobic003G217500 Sobic009G148000--Sobic003G217500 Sobic001G005800 Sobic001G005800 Sobic009G148000--Sobic001G005800 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic009G148000--Sobic004G014100 Sobic009G148000--Sobic008G041900 Sobic004G250600 Sobic004G250600 Sobic009G148000--Sobic004G250600 Sobic002G343000--Sobic009G148000 Sobic002G343000--Sobic006G200901 Sobic002G343000--Sobic004G014100 Sobic006G143300 Sobic006G143300 Sobic002G343000--Sobic006G143300 Sobic002G343000--Sobic002G253900 Sobic002G343000--Sobic003G217500 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic002G343000--Sobic002G230400 Sobic002G343000--Sobic008G041900 Sobic002G343000--Sobic006G186300 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic007G023600--Sobic009G253800 Sobic006G261200 Sobic006G261200 Sobic007G023600--Sobic006G261200 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic007G023600--Sobic003G402100 Sobic004G190200 Sobic004G190200 Sobic007G023600--Sobic004G190200 Sobic010G118200 Sobic010G118200 Sobic007G023600--Sobic010G118200 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic007G023600--Sobic001G170500 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic007G023600--Sobic007G091200 Sobic007G023600--Sobic004G250600 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic007G023600--Sobic004G294500 Sobic010G180200--Sobic003G402100 Sobic001G053700 Sobic001G053700 Sobic010G180200--Sobic001G053700 Sobic001G324800 Sobic001G324800 Sobic010G180200--Sobic001G324800 Sobic006G066400 Sobic006G066400 Sobic010G180200--Sobic006G066400 Sobic010G180200--Sobic004G014100 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic010G180200--Sobic001G394900 Sobic010G180200--Sobic007G023600 Sobic004G218000 Sobic004G218000 Sobic010G180200--Sobic004G218000 Sobic010G212700 Sobic010G212700 Sobic010G180200--Sobic010G212700 Sobic009G227201 Sobic009G227201 Sobic004G354600--Sobic009G227201 Sobic004G354600--Sobic001G394900 Sobic004G354600--Sobic003G402100 Sobic004G354600--Sobic001G150300 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic004G354600--Sobic001G394100 Sobic003G101200 Sobic003G101200 Sobic004G354600--Sobic003G101200 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic004G354600--Sobic008G088881 Sobic004G354600--Sobic002G123100 Sobic004G354600--Sobic001G053700 Sobic005G018050 Sobic005G018050 Sobic008G041900--Sobic005G018050 Sobic008G041900--Sobic002G343000 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic008G041900--Sobic005G033700 Sobic008G041900--Sobic006G186300 Sobic008G041900--Sobic009G148000 Sobic007G106300 Sobic007G106300 Sobic008G041900--Sobic007G106300 Sobic006G272800 Sobic006G272800 Sobic008G041900--Sobic006G272800 Sobic008G041900--Sobic010G180200 Sobic010G275800 Sobic010G275800 Sobic008G041900--Sobic010G275800 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic004G339900--Sobic002G420400 Sobic004G071050 Sobic004G071050 Sobic004G339900--Sobic004G071050 Sobic001G485200 Sobic001G485200 Sobic004G339900--Sobic001G485200 Sobic001G194100 Sobic001G194100 Sobic004G339900--Sobic001G194100 Sobic004G339900--Sobic010G152000 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic004G339900--Sobic007G041200 Sobic008G116100 Sobic008G116100 Sobic004G339900--Sobic008G116100 Sobic004G065800 Sobic004G065800 Sobic004G339900--Sobic004G065800 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic004G339900--Sobic004G163700 Sobic010G152000--Sobic004G339900 Sobic010G152000--Sobic002G420400 Sobic010G152000--Sobic004G071050 Sobic005G036200 Sobic005G036200 Sobic010G152000--Sobic005G036200 Sobic001G456400 Sobic001G456400 Sobic010G152000--Sobic001G456400 Sobic004G242200 Sobic004G242200 Sobic010G152000--Sobic004G242200 Sobic010G152000--Sobic001G485200 Sobic003G071901 Sobic003G071901 Sobic010G152000--Sobic003G071901 Sobic010G152000--Sobic004G065800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.