Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G186300.2
Synonym FLA10, Sb06g026030
Functional annotation fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RER0
Pfam PF02469
Panther DB PTHR32382 PTHR32382:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G45470 : FASCICLIN-like arabinogalactan protein 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g48490.1 : fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a010136
Brachypodium KQJ84139
Barley HORVU2Hr1G094510.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G186300


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.007G041200 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.002G122000 - -
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6 Sobic.010G084800 - -
7 Sobic.001G305100 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
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9 Sobic.005G171800 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G176875 - -
11 Sobic.008G109600 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G033700 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G038900 expressed protein -
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15 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.006G015800 "1,4-alpha-glucan branching enzyme/starch branching enzyme II, PULLULANASE 1, CHLOROPLASTIC"(PubMedID : 21853065)@Alpha amylase, catalytic domain containing protein, expressed -
17 Sobic.009G132650 - -
18 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G172100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic006G186300--Sobic010G047300 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic006G186300--Sobic007G041200 Sobic002G122000 Sobic002G122000 Sobic006G186300--Sobic002G122000 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic006G186300--Sobic004G075700 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic006G186300--Sobic002G230400 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic006G186300--Sobic010G084800 Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic006G186300--Sobic001G305100 Sobic005G131800 Sobic005G131800 Sobic006G186300--Sobic005G131800 Sobic005G171800 Sobic005G171800 Sobic006G186300--Sobic005G171800 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic010G047300--Sobic009G058300 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic010G047300--Sobic006G264800 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic010G047300--Sobic002G172100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic010G047300--Sobic001G489075 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic010G047300--Sobic008G109600 Sobic002G108300 Sobic002G108300 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Octagon: transcription factors


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