Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G122000.1
Synonym Sb02g010560
Functional annotation -
UniProt C5X521
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045817
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G010350.7
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G122000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G186300 fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G128400 expressed protein -
3 Sobic.005G033700 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G038900 expressed protein -
5 Sobic.003G029900 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
6 Sobic.010G067200 receptor-like protein kinase precursor, putative, expressed -
7 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
8 Sobic.005G171800 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G133150 - -
10 Sobic.003G402100 leucine-rich repeat receptor protein kinase EXS precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G131800 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03006: RPB1, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
12 Sobic.001G305100 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.010G180200 transcription factor S-II, central domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G183100 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
15 Sobic.006G143300 nuclear transport factor 2, putative, expressed -
16 Sobic.004G294600 expressed protein -
17 Sobic.004G075700 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G108300 expressed protein -
19 Sobic.008G088900 hypothetical protein -
20 Sobic.009G058300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G122000 Sobic002G122000 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic002G122000--Sobic006G186300 Sobic007G128400 Sobic007G128400 Sobic002G122000--Sobic007G128400 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic002G122000--Sobic005G033700 Sobic004G038900 Sobic004G038900 Sobic002G122000--Sobic004G038900 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic002G122000--Sobic003G029900 Sobic010G067200 Sobic010G067200 Sobic002G122000--Sobic010G067200 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G122000--Sobic010G047300 Sobic005G171800 Sobic005G171800 Sobic002G122000--Sobic005G171800 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic002G122000--Sobic010G133150 Sobic006G186300--Sobic010G047300 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic006G186300--Sobic007G041200 Sobic006G186300--Sobic002G122000 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic006G186300--Sobic004G075700 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic006G186300--Sobic002G230400 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic006G186300--Sobic010G084800 Sobic001G305100 Sobic001G305100 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Octagon: transcription factors


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